39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2868 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2868  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  659    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.430946  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1790  hypothetical protein  42.99 
 
 		 318 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.269411  normal  0.659808 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3530  hypothetical protein  36.62 
 
 		 321 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.582782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0257  hypothetical protein  37.27 
 
 		 346 aa  168  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1650  hypothetical protein  36.51 
 
 		 299 aa  151  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00343352  normal  0.111404 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3069  protein of unknown function DUF201  34.76 
 
 		 330 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3138  hypothetical protein  34.72 
 
 		 343 aa  105  8e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5936  hypothetical protein  31.4 
 
 		 350 aa  99.4  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.400754  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2459  hypothetical protein  31.16 
 
 		 351 aa  96.3  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.243354 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2621  hypothetical protein  31.45 
 
 		 319 aa  89.4  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.24085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6502  hypothetical protein  29.88 
 
 		 357 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.868447  normal  0.0200511 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0448  hypothetical protein  24.6 
 
 		 311 aa  79.3  0.00000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00145655  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0283  protein of unknown function DUF201  26.59 
 
 		 360 aa  75.1  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0329  hypothetical protein  23.47 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1440  hypothetical protein  23.58 
 
 		 302 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.357308  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1043  hypothetical protein  23.39 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0920  hypothetical protein  28.91 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0220945  hitchhiker  0.000000000622111 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1583  hypothetical protein  23.63 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0571  hypothetical protein  25.79 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0897117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1666  hypothetical protein  32.53 
 
 		 355 aa  58.9  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1641  hypothetical protein  34.27 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0581  protein of unknown function DUF201  27.97 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0946746  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1315  hypothetical protein  28.34 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1384  hypothetical protein  29.02 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0268  ornithine carbamoyltransferase  27.8 
 
 		 301 aa  50.8  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.313188 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4856  protein of unknown function DUF201  26.42 
 
 		 396 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0628  alpha-L-glutamate ligase  56.82 
 
 		 300 aa  47.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0506  SSU ribosomal protein S6P modification protein  53.33 
 
 		 299 aa  46.6  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5879  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.95 
 
 		 422 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521142  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5515  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.95 
 
 		 422 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.330375  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6388  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.95 
 
 		 422 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.357309  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0686  SSU ribosomal protein S6P modification protein  37.14 
 
 		 301 aa  45.8  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000259145  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0723  alpha-L-glutamate ligase  53.33 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.349493 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0244  alpha-L-glutamate ligase  38.03 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.12128  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0753  carbamoyl phosphate synthase-like protein  22.32 
 
 		 326 aa  44.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3820  carbamoyl phosphate synthase-like protein  24.88 
 
 		 343 aa  43.9  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.937743  normal  0.217924 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1747  alpha-L-glutamate ligase  51.11 
 
 		 299 aa  43.9  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0763  alpha-L-glutamate ligase  51.11 
 
 		 299 aa  43.5  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.708688  normal  0.325873 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1871  ribosomal protein S6 modification protein  37.7 
 
 		 301 aa  42.7  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>