40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3467 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3467  hypothetical protein  100 
 
 		 407 aa  838    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2607  hypothetical protein  35 
 
 		 439 aa  241  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7724  putative biotin carboxylase  35.11 
 
 		 430 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0791  biotin carboxylase  33.23 
 
 		 411 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0874  nikkomycin biosynthesis domain protein  24.92 
 
 		 417 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6150  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  24.28 
 
 		 410 aa  77  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2023  hypothetical protein  27.11 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4524  Biotin carboxylase-like protein  29.1 
 
 		 403 aa  76.6  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.799309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06054  hypothetical protein  26.21 
 
 		 329 aa  76.6  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2026  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.69 
 
 		 423 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0875  hypothetical protein  24.23 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6148  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.09 
 
 		 408 aa  67  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.631903 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0162  hypothetical protein  22.49 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2846  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain- containing protein  25.74 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.435021  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  25.08 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  25.78 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0875  hypothetical protein  24.28 
 
 		 420 aa  57  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3673  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.75 
 
 		 407 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3245  hypothetical protein  21.95 
 
 		 419 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.837509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2986  carbamoyl-phosphate synthase large chain  22.65 
 
 		 431 aa  53.9  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.556183  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0877  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  30.91 
 
 		 386 aa  53.1  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.656066  normal  0.993359 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  23.87 
 
 		 412 aa  52.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3256  putative carbamoyl-phosphate synthase large chain  22.36 
 
 		 420 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.077916  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  24.06 
 
 		 409 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  21.79 
 
 		 399 aa  52  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  22.94 
 
 		 437 aa  50.8  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0730  hypothetical protein  22.73 
 
 		 436 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0202  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.59 
 
 		 388 aa  50.1  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.72 
 
 		 420 aa  49.7  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0177  hypothetical protein  25.23 
 
 		 411 aa  48.9  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2144  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.6 
 
 		 416 aa  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  27.63 
 
 		 432 aa  47  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1432  hypothetical protein  24.1 
 
 		 424 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502147  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  22.83 
 
 		 407 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  22.83 
 
 		 407 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.76 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2148  hypothetical protein  31.82 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3242  hypothetical protein  25.2 
 
 		 432 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0996  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.46 
 
 		 541 aa  44.3  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037072 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4747  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase ATPase subunit  27.68 
 
 		 420 aa  43.9  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0540439  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>