More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2692 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3940  biotin carboxylase  58.97 
 
 		 1095 aa  1251    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1073  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  56.7 
 
 		 1097 aa  1164    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.398596 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2692  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  100 
 
 		 1091 aa  2213    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.246578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2413  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  59.89 
 
 		 1103 aa  1298    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.370889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1862  carboxyl transferase  60.63 
 
 		 602 aa  685    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00333639  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1889  propionyl-CoA carboxylase  63.39 
 
 		 519 aa  701    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1636  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  62.16 
 
 		 1103 aa  1304    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2997  pyruvate carboxylase., propionyl-CoA carboxylase  58.4 
 
 		 1112 aa  1205    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.717985  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3892  pyruvate carboxylase., propionyl-CoA carboxylase  54.93 
 
 		 1105 aa  1145    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.222877  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2867  pyruvate carboxylase, propionyl-CoA carboxylase  52.56 
 
 		 1094 aa  1156    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0228  pyruvate carboxylase  61.04 
 
 		 1102 aa  1306    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2019  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  59.62 
 
 		 1103 aa  1263    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3899  propionyl-CoA carboxylase  57.75 
 
 		 610 aa  706    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0325  putative carbamoyl-phosphate synthase/carboxyltransferase  47.3 
 
 		 1033 aa  967    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00413632  normal  0.277217 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0602  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  61.31 
 
 		 1102 aa  1296    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4792  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  57.04 
 
 		 1098 aa  1199    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4464  pyruvate carboxylase., methylmalonyl-CoA carboxytransferase  55.09 
 
 		 1067 aa  1083    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0495259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1682  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  56.74 
 
 		 1097 aa  1154    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4069  acetyl-CoA carboxylase (biotin carboxylase and carboxyl transferase domains) / biotin carboxyl carrier protein  55.94 
 
 		 1126 aa  1169    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0299228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4971  putative carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  55.23 
 
 		 1152 aa  1129    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.266349  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46320  putative pyruvate carboxylase  60.07 
 
 		 1095 aa  1246    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.948302  normal  0.0234216 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1872  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding protein  49.31 
 
 		 1054 aa  915    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3842  pyruvate carboxylase., propionyl-CoA carboxylase  59.85 
 
 		 1090 aa  1279    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.735507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2712  carboxyl transferase  52.31 
 
 		 524 aa  531  1e-149  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0757047  normal  0.0196449 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0066  propionyl-CoA carboxylase  50.1 
 
 		 519 aa  513  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2710  propionyl-CoA carboxylase  51.47 
 
 		 503 aa  510  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.595961  normal  0.61988 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2679  propionyl-CoA carboxylase  51.27 
 
 		 503 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1271  propionyl-CoA carboxylase  45.59 
 
 		 600 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2724  propionyl-CoA carboxylase  51.27 
 
 		 503 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173098 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0781  propionyl-CoA carboxylase  50.86 
 
 		 518 aa  498  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.576525  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5381  biotin carboxylase/biotin carboxyl carrier protein  43.06 
 
 		 579 aa  390  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0500  carbamoyl-phosphate synthase subunit L  43.61 
 
 		 577 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.193791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1043  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  45.35 
 
 		 476 aa  387  1e-106  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3962  pyruvate carboxylase  46.51 
 
 		 1148 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2028  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  47.71 
 
 		 446 aa  385  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.256761  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3994  pyruvate carboxylase  46.29 
 
 		 1148 aa  380  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.882525  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3859  pyruvate carboxylase  46.51 
 
 		 1148 aa  383  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3690  pyruvate carboxylase  46.51 
 
 		 1148 aa  383  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3707  pyruvate carboxylase  46.29 
 
 		 1148 aa  383  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.863258  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0980  pyruvate carboxylase  47.16 
 
 		 1147 aa  383  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.125957  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4050  pyruvate carboxylase  46.29 
 
 		 1148 aa  381  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.898796  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4157  pyruvate carboxylase  46.51 
 
 		 1148 aa  383  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.820084  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1190  pyruvate carboxylase  46.29 
 
 		 1148 aa  381  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2649  pyruvate carboxylase  45.85 
 
 		 1148 aa  379  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00733169  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3773  pyruvate carboxylase  46.51 
 
 		 1148 aa  378  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.333  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00681  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.26 
 
 		 448 aa  379  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2485  pyruvate carboxylase  46.51 
 
 		 1145 aa  377  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4065  pyruvate carboxylase  46.29 
 
 		 1148 aa  379  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164116  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1196  pyruvate carboxylase  45 
 
 		 1150 aa  374  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0792  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  39.5 
 
 		 583 aa  374  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00727726 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1423  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.26 
 
 		 447 aa  376  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0675  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  48.78 
 
 		 452 aa  374  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0516  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.78 
 
 		 447 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0701369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0622  biotin carboxylase-like  43.2 
 
 		 485 aa  376  1e-102  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01241  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.46 
 
 		 447 aa  375  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.114391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1826  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  45.76 
 
 		 446 aa  376  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000136846  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2028  pyruvate carboxylase  46.94 
 
 		 1146 aa  375  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0677  pyruvate carboxylase  47.06 
 
 		 1154 aa  375  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418471 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0051  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase  46.56 
 
 		 448 aa  374  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1174  pyruvate carboxylase  45 
 
 		 1150 aa  374  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.810456  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2022  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  45.01 
 
 		 446 aa  375  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0711095  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4233  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  40.07 
 
 		 594 aa  373  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.213527  normal  0.607428 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0704  pyruvate carboxylase  44.35 
 
 		 1147 aa  372  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5845  biotin carboxylase  41.39 
 
 		 578 aa  372  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.249832  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2090  pyruvate carboxylase  47.06 
 
 		 1154 aa  372  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4784  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  39.43 
 
 		 599 aa  372  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.324654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2259  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.59 
 
 		 448 aa  372  1e-101  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.571536  normal  0.652272 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0244  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  47.62 
 
 		 451 aa  373  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0765  pyruvate carboxylase  47.06 
 
 		 1154 aa  372  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.531635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6500  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  39.83 
 
 		 589 aa  372  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.450636  normal  0.501395 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0696  pyruvate carboxylase  45.73 
 
 		 1137 aa  372  1e-101  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1852  pyruvate carboxylase  46.07 
 
 		 1147 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2019  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  44.03 
 
 		 446 aa  369  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274625  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3538  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  41.33 
 
 		 591 aa  369  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1598  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  44.35 
 
 		 446 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000269909  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05850  acetyl/propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  38.96 
 
 		 591 aa  368  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0984  biotin carboxylase / acetyl-coenzyme A carboxylase carboxyl transferase subunit alpha  44.77 
 
 		 446 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000016105  normal  0.0128167 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08190  acetyl/propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  39.64 
 
 		 593 aa  370  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.253328  normal  0.580973 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00721  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  43.54 
 
 		 449 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.249054  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2781  pyruvate carboxylase  46.52 
 
 		 1146 aa  368  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.34557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1093  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  45.51 
 
 		 459 aa  369  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0809  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  41.25 
 
 		 587 aa  369  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4207  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  41.07 
 
 		 588 aa  369  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03221  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.02 
 
 		 448 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4144  pyruvate carboxylase  46.05 
 
 		 1144 aa  367  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0029  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  45.81 
 
 		 450 aa  367  1e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00270537  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2591  pyruvate carboxylase subunit A  43.05 
 
 		 471 aa  366  1e-99  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2451  carbamoyl-phosphate synthase subunit L  41.73 
 
 		 576 aa  366  1e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0140517  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2669  pyruvate carboxylase  46.1 
 
 		 1164 aa  366  1e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0529984  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00711  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  43.54 
 
 		 449 aa  367  1e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1511  pyruvate carboxylase subunit A  44.81 
 
 		 472 aa  365  2e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.473143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1016  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  47.23 
 
 		 446 aa  366  2e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000161184  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0062  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  43.33 
 
 		 448 aa  365  3e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0972  pyruvate carboxylase  46.8 
 
 		 1165 aa  365  3e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0428493 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0691  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding protein  39.66 
 
 		 581 aa  365  3e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1121  pyruvate carboxylase  47.29 
 
 		 1153 aa  364  4e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1749  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  44.08 
 
 		 448 aa  364  4e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00691  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.27 
 
 		 449 aa  364  4e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.36167  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1455  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  43.89 
 
 		 449 aa  364  4e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3292  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  41.54 
 
 		 577 aa  364  5.0000000000000005e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>