More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2712 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2712  carboxyl transferase  100 
 
 
524 aa  1025    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0757047  normal  0.0196449 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2679  propionyl-CoA carboxylase  76.67 
 
 
503 aa  750    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0781  propionyl-CoA carboxylase  79.04 
 
 
518 aa  755    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.576525  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2724  propionyl-CoA carboxylase  76.67 
 
 
503 aa  750    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173098 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2710  propionyl-CoA carboxylase  76.86 
 
 
503 aa  752    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.595961  normal  0.61988 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0066  propionyl-CoA carboxylase  76.67 
 
 
519 aa  762    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1636  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  55.75 
 
 
1103 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0602  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  54.62 
 
 
1102 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3940  biotin carboxylase  59.85 
 
 
1095 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2019  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  55.53 
 
 
1103 aa  567  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0228  pyruvate carboxylase  54.23 
 
 
1102 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2413  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  55.34 
 
 
1103 aa  566  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.370889  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46320  putative pyruvate carboxylase  59.27 
 
 
1095 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.948302  normal  0.0234216 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1862  carboxyl transferase  61.04 
 
 
602 aa  558  1e-158  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00333639  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1682  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  55.96 
 
 
1097 aa  560  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3842  pyruvate carboxylase., propionyl-CoA carboxylase  54.83 
 
 
1090 aa  551  1e-156  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.735507  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2997  pyruvate carboxylase., propionyl-CoA carboxylase  55.56 
 
 
1112 aa  549  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.717985  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2692  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  52.5 
 
 
1091 aa  545  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.246578  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4069  acetyl-CoA carboxylase (biotin carboxylase and carboxyl transferase domains) / biotin carboxyl carrier protein  55.68 
 
 
1126 aa  543  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0299228  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4464  pyruvate carboxylase., methylmalonyl-CoA carboxytransferase  55.38 
 
 
1067 aa  537  1e-151  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0495259  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2867  pyruvate carboxylase, propionyl-CoA carboxylase  50.77 
 
 
1094 aa  533  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1889  propionyl-CoA carboxylase  50 
 
 
519 aa  518  1e-146  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1073  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  55.15 
 
 
1097 aa  516  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.398596 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4792  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  52.85 
 
 
1098 aa  515  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3899  propionyl-CoA carboxylase  52.01 
 
 
610 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0325  putative carbamoyl-phosphate synthase/carboxyltransferase  53.24 
 
 
1033 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00413632  normal  0.277217 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4971  putative carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  53.46 
 
 
1152 aa  507  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.266349  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3892  pyruvate carboxylase., propionyl-CoA carboxylase  53.27 
 
 
1105 aa  503  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.222877  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1872  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding protein  54.91 
 
 
1054 aa  490  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1271  propionyl-CoA carboxylase  46.89 
 
 
600 aa  457  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1593  Propionyl-CoA carboxylase  33.4 
 
 
525 aa  247  4e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  30.93 
 
 
515 aa  246  6e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  30.8 
 
 
515 aa  243  5e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0379  carboxyl transferase  33.07 
 
 
514 aa  242  1e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  33.33 
 
 
537 aa  241  2.9999999999999997e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  30.69 
 
 
512 aa  239  8e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1346  Propionyl-CoA carboxylase  35.8 
 
 
508 aa  238  2e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3307  propionyl-CoA carboxylase  30.3 
 
 
517 aa  236  6e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448446  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0335  carboxyl transferase  33.54 
 
 
514 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.868559  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1593  carboxyl transferase  30.8 
 
 
514 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0139637  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0317  carboxyl transferase  33.82 
 
 
514 aa  234  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  32.77 
 
 
520 aa  233  4.0000000000000004e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0272  carboxyl transferase  30.47 
 
 
515 aa  231  2e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00889461 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3025  carboxyl transferase  32.05 
 
 
532 aa  231  3e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.432014 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0034  carboxyl transferase  33.47 
 
 
516 aa  230  6e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182676  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3083  carboxyl transferase  33.47 
 
 
516 aa  230  6e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0002503  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0291  carboxyl transferase  32.03 
 
 
519 aa  229  6e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1817  Methylmalonyl-CoA carboxytransferase  32.17 
 
 
517 aa  229  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0553  carboxyl transferase  29.7 
 
 
518 aa  227  5.0000000000000005e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.965666  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  29.41 
 
 
512 aa  226  6e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1248  carboxyl transferase  32.75 
 
 
522 aa  226  8e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  31.75 
 
 
516 aa  225  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0051  carboxyl transferase  32.74 
 
 
517 aa  224  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.253581  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1807  propionyl-CoA carboxylase  30.74 
 
 
513 aa  224  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.171719  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6415  Propionyl-CoA carboxylase  33.81 
 
 
506 aa  225  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1906  carboxyl transferase  36.47 
 
 
527 aa  224  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.187431  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  32.75 
 
 
534 aa  224  3e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5639  carboxyl transferase  32.88 
 
 
516 aa  223  7e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1836  Propionyl-CoA carboxylase  32.24 
 
 
520 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.101625  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0999  carboxyl transferase  31.26 
 
 
527 aa  222  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  32.15 
 
 
530 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_389  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  32.36 
 
 
516 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.839187  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1021  carboxyl transferase  33.2 
 
 
531 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  31.54 
 
 
516 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21120  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  32.5 
 
 
529 aa  221  3e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0918457  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  30.83 
 
 
508 aa  221  3e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1041  carboxyl transferase  33 
 
 
542 aa  221  3e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  32.48 
 
 
531 aa  220  3.9999999999999997e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  32.45 
 
 
516 aa  220  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_002936  DET0447  acyl CoA biotin-dependant carboxyltransferase  32.54 
 
 
516 aa  220  5e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2445  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  33.75 
 
 
517 aa  219  7e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2284  carboxyl transferase  29.47 
 
 
522 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00152526  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0027  propionyl-CoA carboxylase  33.47 
 
 
510 aa  219  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  33.73 
 
 
530 aa  219  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2291  propionyl-CoA carboxylase  30.71 
 
 
513 aa  218  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0918842  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2052  Propionyl-CoA carboxylase  32.54 
 
 
518 aa  218  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00336851  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2565  carboxyl transferase domain protein  30.02 
 
 
513 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.89145e-17 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  32.3 
 
 
550 aa  218  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1735  carboxyl transferase  31.72 
 
 
510 aa  218  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1170  carboxyl transferase  32.68 
 
 
516 aa  218  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.336373  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  32.73 
 
 
518 aa  218  2e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3495  carboxyl transferase  32.55 
 
 
540 aa  218  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1198  carboxyl transferase domain protein  32.54 
 
 
548 aa  218  2e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000462076 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0424  carboxyl transferase  30.78 
 
 
516 aa  218  2e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  27.76 
 
 
514 aa  218  2.9999999999999998e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0821  carboxyl transferase  32.22 
 
 
536 aa  218  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588825  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2186  Propionyl-CoA carboxylase  33.73 
 
 
523 aa  218  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2553  carboxyl transferase domain-containing protein  30.5 
 
 
513 aa  217  5e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2375  carboxyl transferase domain-containing protein  30.5 
 
 
513 aa  217  5e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2332  propionyl-CoA carboxylase  30.5 
 
 
513 aa  217  5e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2608  carboxyl transferase domain protein  30.5 
 
 
513 aa  217  5e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.444131  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2552  carboxyl transferase domain-containing protein  30.5 
 
 
513 aa  217  5e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.953071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2807  carboxyl transferase domain protein  30.71 
 
 
513 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000977821 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2516  carboxyl transferase domain protein  30.71 
 
 
513 aa  216  7e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0260  carboxyl transferase  33.61 
 
 
519 aa  216  8e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  28.71 
 
 
516 aa  216  8e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0950  carboxyl transferase  33.14 
 
 
514 aa  216  8e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.216274 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  29.25 
 
 
516 aa  216  9e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0250  carboxyl transferase  33.4 
 
 
519 aa  216  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.135558  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  29.35 
 
 
518 aa  215  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>