More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1906 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1906  carboxyl transferase  100 
 
 		 527 aa  1048    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.187431  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  40.16 
 
 		 508 aa  357  3.9999999999999996e-97  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1593  Propionyl-CoA carboxylase  39.52 
 
 		 525 aa  352  8e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  39.88 
 
 		 530 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  35.77 
 
 		 518 aa  328  2.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  38.95 
 
 		 527 aa  326  6e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  35.76 
 
 		 516 aa  322  7e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  39.31 
 
 		 534 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0250  carboxyl transferase  38.54 
 
 		 519 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.135558  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  36.69 
 
 		 531 aa  321  1.9999999999999998e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  39.38 
 
 		 529 aa  320  3e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  38.62 
 
 		 516 aa  320  3.9999999999999996e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  38.57 
 
 		 527 aa  320  5e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  36.17 
 
 		 531 aa  319  7.999999999999999e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  36.42 
 
 		 516 aa  318  1e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1041  carboxyl transferase  38.77 
 
 		 542 aa  318  1e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0379  carboxyl transferase  38.74 
 
 		 514 aa  318  1e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  40.12 
 
 		 530 aa  318  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0260  carboxyl transferase  38.34 
 
 		 519 aa  318  2e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0271  Propionyl-CoA carboxylase  38.54 
 
 		 519 aa  317  3e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.846145  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  35.69 
 
 		 516 aa  317  4e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1294  carboxyl transferase  39.62 
 
 		 556 aa  316  6e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1311  carboxyl transferase  39.62 
 
 		 556 aa  316  6e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0791098  normal  0.306854 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1330  carboxyl transferase  39.62 
 
 		 556 aa  316  6e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2771  carboxyl transferase  36.84 
 
 		 510 aa  315  1.9999999999999998e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110182 
 
 
-
 
NC_002978  WD1157  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  36.22 
 
 		 508 aa  314  2.9999999999999996e-84  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.167256  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3092  carboxyl transferase  36.9 
 
 		 516 aa  313  4.999999999999999e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.391297  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1677  carboxyl transferase  39.24 
 
 		 542 aa  313  4.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0077  carboxyl transferase  35.43 
 
 		 517 aa  312  1e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.371983  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4774  carboxyl transferase  39.31 
 
 		 538 aa  311  1e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  36.17 
 
 		 516 aa  311  2e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  38.01 
 
 		 536 aa  311  2e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  38.95 
 
 		 516 aa  310  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  35.27 
 
 		 512 aa  310  4e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  37.83 
 
 		 517 aa  310  5e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  35.42 
 
 		 512 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  36.9 
 
 		 516 aa  310  5.9999999999999995e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6502  carboxyl transferase  39.51 
 
 		 529 aa  309  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838117  normal  0.279453 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13309  propionyl-CoA carboxylase beta subunit 5 accD5  39.37 
 
 		 548 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  35.91 
 
 		 515 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0850  carboxyl transferase  38.19 
 
 		 526 aa  308  2.0000000000000002e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000103034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2003  carboxyl transferase  35.83 
 
 		 510 aa  307  3e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2361  carboxyl transferase  36.82 
 
 		 513 aa  307  4.0000000000000004e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000738755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4364  carboxyl transferase  38.36 
 
 		 541 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2348  carboxyl transferase  36.29 
 
 		 512 aa  306  5.0000000000000004e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1021  carboxyl transferase  37.01 
 
 		 531 aa  306  5.0000000000000004e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  38.1 
 
 		 524 aa  305  1.0000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1632  carboxyl transferase  36.22 
 
 		 522 aa  305  1.0000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3166  carboxyl transferase  37.15 
 
 		 521 aa  305  2.0000000000000002e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0567033  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0999  carboxyl transferase  38.31 
 
 		 527 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  34.95 
 
 		 514 aa  305  2.0000000000000002e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1152  carboxyl transferase  37.62 
 
 		 529 aa  304  2.0000000000000002e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579492  normal  0.513821 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1840  carboxyl transferase  38.02 
 
 		 542 aa  304  3.0000000000000004e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2999  carboxyl transferase  36.59 
 
 		 510 aa  303  4.0000000000000003e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2974  carboxyl transferase  37.02 
 
 		 519 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3374  carboxyl transferase  35.02 
 
 		 510 aa  303  5.000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.778087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  35.74 
 
 		 516 aa  303  5.000000000000001e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  35.14 
 
 		 515 aa  302  8.000000000000001e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0271  carboxyl transferase  35.55 
 
 		 520 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.435103  normal  0.1429 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3618  carboxyl transferase  35.73 
 
 		 510 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207692  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_389  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  35.56 
 
 		 516 aa  301  2e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.839187  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6139  carboxyl transferase  35.43 
 
 		 510 aa  301  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.222288 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3025  carboxyl transferase  37.97 
 
 		 532 aa  300  4e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.432014 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1754  carboxyl transferase  36.45 
 
 		 510 aa  300  4e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.218371  normal  0.119502 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0912  carboxyl transferase  35.63 
 
 		 510 aa  300  4e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  36.29 
 
 		 518 aa  300  5e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  36.54 
 
 		 550 aa  300  5e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1877  propionyl-CoA carboxylase  35.02 
 
 		 510 aa  299  7e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0424  carboxyl transferase  34.95 
 
 		 516 aa  299  7e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0447  acyl CoA biotin-dependant carboxyltransferase  36.07 
 
 		 516 aa  299  8e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3122  carboxyl transferase  36.12 
 
 		 510 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.629263  normal  0.624995 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1248  carboxyl transferase  38.26 
 
 		 522 aa  298  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5680  propionyl-CoA carboxylase  35.63 
 
 		 510 aa  298  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2284  carboxyl transferase  34.86 
 
 		 522 aa  299  1e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00152526  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1705  carboxyl transferase  36.01 
 
 		 510 aa  298  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.514847  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0930  carboxyl transferase  35.43 
 
 		 518 aa  298  2e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4725  carboxyl transferase  35.08 
 
 		 510 aa  298  2e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.48705  normal  0.0648736 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1579  carboxyl transferase  36.03 
 
 		 523 aa  297  2e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0377813  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0821  carboxyl transferase  36.93 
 
 		 536 aa  298  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588825  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25440  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  36.65 
 
 		 532 aa  297  3e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199435  normal  0.360386 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1401  carboxyl transferase  36.03 
 
 		 510 aa  297  3e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0947587  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11343  propionlyl-CoA carboxylase  36.22 
 
 		 513 aa  297  3e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4239  carboxyl transferase  35.43 
 
 		 510 aa  297  3e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.540833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0950  carboxyl transferase  37.52 
 
 		 514 aa  297  3e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.216274 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2342  carboxyl transferase  35.92 
 
 		 510 aa  296  5e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.150986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0272  carboxyl transferase  34.55 
 
 		 515 aa  296  5e-79  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00889461 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1223  carboxyl transferase  34.12 
 
 		 517 aa  296  5e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00883657  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3989  carboxyl transferase  36.64 
 
 		 534 aa  296  6e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.356314 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5024  putative propionyl-CoA carboxylase beta chain  35.76 
 
 		 510 aa  296  6e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.541202 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1043  carboxyl transferase  37.2 
 
 		 549 aa  296  8e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.282671  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1735  carboxyl transferase  35.87 
 
 		 510 aa  296  8e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3541  carboxyl transferase  38.51 
 
 		 514 aa  296  9e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1593  carboxyl transferase  37.1 
 
 		 514 aa  296  9e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0139637  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1317  carboxyl transferase  35.6 
 
 		 510 aa  295  1e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.182185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  36.33 
 
 		 513 aa  295  1e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1621  Propionyl-CoA carboxylase  35.84 
 
 		 513 aa  295  2e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0639  carboxyl transferase  34.3 
 
 		 513 aa  295  2e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.629685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5510  carboxyl transferase  36.36 
 
 		 510 aa  295  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  38.04 
 
 		 551 aa  295  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  36.61 
 
 		 546 aa  294  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.35884 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>