More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0699 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2974  carboxyl transferase  62.08 
 
 		 519 aa  651    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  61.43 
 
 		 517 aa  671    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  64.53 
 
 		 515 aa  697    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0271  Propionyl-CoA carboxylase  61.42 
 
 		 519 aa  647    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.846145  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3092  carboxyl transferase  62.78 
 
 		 516 aa  636    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.391297  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2284  carboxyl transferase  64.41 
 
 		 522 aa  697    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00152526  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  66.41 
 
 		 514 aa  719    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3166  carboxyl transferase  60.68 
 
 		 521 aa  653    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0567033  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  69.53 
 
 		 516 aa  760    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  67.19 
 
 		 518 aa  745    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  63.11 
 
 		 517 aa  693    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0250  carboxyl transferase  60.83 
 
 		 519 aa  642    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.135558  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  59.73 
 
 		 529 aa  635    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0291  carboxyl transferase  61.66 
 
 		 519 aa  655    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0077  carboxyl transferase  62.7 
 
 		 517 aa  688    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.371983  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4697  carboxyl transferase  60.66 
 
 		 528 aa  664    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  66.54 
 
 		 508 aa  719    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  61.09 
 
 		 516 aa  653    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  64.1 
 
 		 512 aa  675    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  58.95 
 
 		 550 aa  642    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0307  carboxyl transferase  64.27 
 
 		 516 aa  677    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2348  carboxyl transferase  59.26 
 
 		 512 aa  637    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  64.92 
 
 		 515 aa  701    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0271  carboxyl transferase  61.24 
 
 		 520 aa  651    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.435103  normal  0.1429 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2361  carboxyl transferase  59.96 
 
 		 513 aa  642    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000738755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  58.2 
 
 		 531 aa  642    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0553  carboxyl transferase  62.26 
 
 		 518 aa  649    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.965666  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1223  carboxyl transferase  59.38 
 
 		 517 aa  654    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00883657  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  60.66 
 
 		 516 aa  666    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1621  Propionyl-CoA carboxylase  59.69 
 
 		 513 aa  637    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  74.81 
 
 		 516 aa  829    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  61.33 
 
 		 520 aa  653    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  61.33 
 
 		 522 aa  656    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  64.64 
 
 		 512 aa  683    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  62.11 
 
 		 531 aa  680    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0260  carboxyl transferase  61.22 
 
 		 519 aa  647    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  62.37 
 
 		 516 aa  648    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  100 
 
 		 516 aa  1050    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  59.11 
 
 		 516 aa  660    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1316  carboxyl transferase  67.77 
 
 		 514 aa  714    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  60.86 
 
 		 530 aa  638    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  58.28 
 
 		 537 aa  632  1e-180  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  58.4 
 
 		 531 aa  633  1e-180  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  62.27 
 
 		 516 aa  634  1e-180  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1632  carboxyl transferase  58.75 
 
 		 522 aa  632  1e-180  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0272  carboxyl transferase  58.4 
 
 		 515 aa  634  1e-180  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00889461 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_389  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  58.45 
 
 		 516 aa  632  1e-180  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.839187  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0447  acyl CoA biotin-dependant carboxyltransferase  58.25 
 
 		 516 aa  629  1e-179  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4004  carboxyl transferase  58.67 
 
 		 511 aa  631  1e-179  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.680854 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1851  carboxyl transferase  59.18 
 
 		 510 aa  628  1e-179  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0053  carboxyl transferase  59.96 
 
 		 510 aa  629  1e-179  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3755  carboxyl transferase  58.79 
 
 		 510 aa  630  1e-179  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0296123  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  58.84 
 
 		 518 aa  630  1e-179  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0947  carboxyl transferase  59.28 
 
 		 513 aa  631  1e-179  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.592853  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11343  propionlyl-CoA carboxylase  59.17 
 
 		 513 aa  628  1e-179  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0639  carboxyl transferase  58.95 
 
 		 513 aa  628  1e-179  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.629685 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0386  propionyl-CoA carboxylase  59.26 
 
 		 514 aa  629  1e-179  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0424  carboxyl transferase  57.48 
 
 		 516 aa  630  1e-179  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2513  carboxyl transferase  58.98 
 
 		 510 aa  631  1e-179  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152871  normal  0.332227 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2042  carboxyl transferase  58.98 
 
 		 510 aa  629  1e-179  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0884189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3401  carboxyl transferase  59.18 
 
 		 510 aa  629  1e-179  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  58.48 
 
 		 527 aa  631  1e-179  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  57.31 
 
 		 530 aa  625  1e-178  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2803  propionyl-CoA carboxylase  58.98 
 
 		 510 aa  627  1e-178  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.342128  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2381  carboxyl transferase  59.76 
 
 		 510 aa  625  1e-178  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3484  carboxyl transferase  58.4 
 
 		 510 aa  624  1e-177  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  57.98 
 
 		 527 aa  622  1e-177  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1521  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  58.2 
 
 		 513 aa  623  1e-177  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0326  carboxyl transferase  59.37 
 
 		 510 aa  623  1e-177  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  0.0697048 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3811  carboxyl transferase  59.57 
 
 		 510 aa  623  1e-177  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  57.89 
 
 		 524 aa  623  1e-177  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2694  carboxyl transferase  58.86 
 
 		 510 aa  624  1e-177  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2130  carboxyl transferase  59.3 
 
 		 514 aa  622  1e-177  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.955323  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  57.03 
 
 		 551 aa  624  1e-177  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0358  carboxyl transferase  59.17 
 
 		 510 aa  622  1e-177  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0282  carboxyl transferase  59.17 
 
 		 510 aa  621  1e-176  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2164  carboxyl transferase  58.79 
 
 		 510 aa  620  1e-176  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.158421  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0489  carboxyl transferase  57.25 
 
 		 520 aa  618  1e-176  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5510  carboxyl transferase  59.18 
 
 		 510 aa  619  1e-176  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5659  carboxyl transferase  59.34 
 
 		 510 aa  618  1e-176  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  58.09 
 
 		 534 aa  614  1e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  57.49 
 
 		 513 aa  615  1e-175  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0999  carboxyl transferase  59.96 
 
 		 527 aa  617  1e-175  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2835  carboxyl transferase  58.64 
 
 		 510 aa  616  1e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.497575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3495  carboxyl transferase  57.5 
 
 		 540 aa  615  1e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1317  carboxyl transferase  58.19 
 
 		 510 aa  614  1e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.182185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1016  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  58.01 
 
 		 510 aa  615  1e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5024  putative propionyl-CoA carboxylase beta chain  58.98 
 
 		 510 aa  613  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.541202 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2894  carboxyl transferase  58.78 
 
 		 510 aa  612  9.999999999999999e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.437903 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2305  propionyl-CoA carboxylase  58.38 
 
 		 510 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0889  carboxyl transferase  57.06 
 
 		 564 aa  611  9.999999999999999e-175  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1157  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  57.79 
 
 		 508 aa  611  1e-173  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.167256  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0821  carboxyl transferase  56.56 
 
 		 536 aa  609  1e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588825  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  57.74 
 
 		 546 aa  609  1e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.35884 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3025  carboxyl transferase  58.2 
 
 		 532 aa  610  1e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.432014 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1877  propionyl-CoA carboxylase  57.81 
 
 		 510 aa  610  1e-173  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3541  carboxyl transferase  56.03 
 
 		 514 aa  610  1e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1248  carboxyl transferase  57.53 
 
 		 522 aa  609  1e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2999  carboxyl transferase  57.99 
 
 		 510 aa  605  9.999999999999999e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1705  carboxyl transferase  57.99 
 
 		 510 aa  607  9.999999999999999e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.514847  normal  0.247972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>