More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1223 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  62.65 
 
 		 516 aa  697    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  59.38 
 
 		 515 aa  648    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  59.38 
 
 		 515 aa  648    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  58.22 
 
 		 517 aa  641    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  63.28 
 
 		 518 aa  690    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  61.32 
 
 		 516 aa  662    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  61.05 
 
 		 516 aa  641    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0291  carboxyl transferase  58.64 
 
 		 519 aa  637    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  60.98 
 
 		 512 aa  650    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1223  carboxyl transferase  100 
 
 		 517 aa  1068    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00883657  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  59.18 
 
 		 522 aa  634    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1316  carboxyl transferase  59.53 
 
 		 514 aa  653    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  61.32 
 
 		 512 aa  651    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  57.81 
 
 		 516 aa  641    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  59.57 
 
 		 508 aa  656    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  59.38 
 
 		 516 aa  654    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0077  carboxyl transferase  69.05 
 
 		 517 aa  768    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.371983  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  58.59 
 
 		 531 aa  633  1e-180  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  57.28 
 
 		 531 aa  625  1e-178  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4697  carboxyl transferase  57.93 
 
 		 528 aa  626  1e-178  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  58.37 
 
 		 530 aa  627  1e-178  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0250  carboxyl transferase  58.09 
 
 		 519 aa  621  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.135558  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0260  carboxyl transferase  58.58 
 
 		 519 aa  622  1e-177  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  61.05 
 
 		 516 aa  623  1e-177  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  58.06 
 
 		 551 aa  623  1e-177  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0271  Propionyl-CoA carboxylase  58.58 
 
 		 519 aa  620  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.846145  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1632  carboxyl transferase  57.59 
 
 		 522 aa  620  1e-176  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  56.61 
 
 		 516 aa  619  1e-176  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0553  carboxyl transferase  58.51 
 
 		 518 aa  614  9.999999999999999e-175  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.965666  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  57.84 
 
 		 550 aa  612  9.999999999999999e-175  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  56.25 
 
 		 514 aa  614  9.999999999999999e-175  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0271  carboxyl transferase  57.2 
 
 		 520 aa  609  1e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.435103  normal  0.1429 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1621  Propionyl-CoA carboxylase  56.95 
 
 		 513 aa  608  1e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  56.78 
 
 		 529 aa  609  1e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  57.48 
 
 		 530 aa  608  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2361  carboxyl transferase  56.94 
 
 		 513 aa  610  1e-173  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000738755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2974  carboxyl transferase  57.62 
 
 		 519 aa  610  1e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  57.14 
 
 		 527 aa  610  1e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  56.45 
 
 		 517 aa  605  9.999999999999999e-173  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2284  carboxyl transferase  55.49 
 
 		 522 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00152526  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  55.25 
 
 		 531 aa  607  9.999999999999999e-173  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  57.03 
 
 		 527 aa  607  9.999999999999999e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  56.09 
 
 		 524 aa  604  1.0000000000000001e-171  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  55.66 
 
 		 520 aa  601  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3166  carboxyl transferase  56.75 
 
 		 521 aa  598  1e-170  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0567033  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  56.12 
 
 		 534 aa  600  1e-170  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3025  carboxyl transferase  55.25 
 
 		 532 aa  599  1e-170  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.432014 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0272  carboxyl transferase  54.4 
 
 		 515 aa  600  1e-170  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00889461 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2694  carboxyl transferase  55.47 
 
 		 510 aa  599  1e-170  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  56.45 
 
 		 518 aa  596  1e-169  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3495  carboxyl transferase  55.96 
 
 		 540 aa  597  1e-169  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  54.69 
 
 		 516 aa  592  1e-168  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3484  carboxyl transferase  54.67 
 
 		 510 aa  592  1e-168  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2305  propionyl-CoA carboxylase  54.3 
 
 		 510 aa  592  1e-168  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  55.36 
 
 		 513 aa  592  1e-168  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3092  carboxyl transferase  57.66 
 
 		 516 aa  593  1e-168  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.391297  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  55.32 
 
 		 536 aa  594  1e-168  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2003  carboxyl transferase  53.33 
 
 		 510 aa  593  1e-168  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1877  propionyl-CoA carboxylase  54.88 
 
 		 510 aa  593  1e-168  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0307  carboxyl transferase  56.26 
 
 		 516 aa  592  1e-168  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  54.37 
 
 		 546 aa  592  1e-168  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.35884 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2513  carboxyl transferase  54.69 
 
 		 510 aa  594  1e-168  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152871  normal  0.332227 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2042  carboxyl transferase  54.3 
 
 		 510 aa  592  1e-168  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0884189  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2130  carboxyl transferase  54.47 
 
 		 514 aa  588  1e-167  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.955323  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0447  acyl CoA biotin-dependant carboxyltransferase  54.56 
 
 		 516 aa  589  1e-167  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0424  carboxyl transferase  54.37 
 
 		 516 aa  589  1e-167  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0889  carboxyl transferase  54.42 
 
 		 564 aa  590  1e-167  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2189  propionyl-CoA carboxylase beta chain  54.3 
 
 		 510 aa  589  1e-167  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124404  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1521  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  56.27 
 
 		 513 aa  588  1e-167  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6139  carboxyl transferase  54.24 
 
 		 510 aa  591  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.222288 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4230  carboxyl transferase  54.37 
 
 		 552 aa  589  1e-167  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551859  normal  0.395293 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1851  carboxyl transferase  54.1 
 
 		 510 aa  588  1e-167  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2348  carboxyl transferase  55.45 
 
 		 512 aa  589  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0386  propionyl-CoA carboxylase  53.86 
 
 		 514 aa  591  1e-167  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  54.81 
 
 		 537 aa  590  1e-167  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0326  carboxyl transferase  54.49 
 
 		 510 aa  590  1e-167  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  0.0697048 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2381  carboxyl transferase  54.51 
 
 		 510 aa  590  1e-167  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0861  carboxyl transferase  54.3 
 
 		 510 aa  589  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.833574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5680  propionyl-CoA carboxylase  54.51 
 
 		 510 aa  590  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0358  carboxyl transferase  54.3 
 
 		 510 aa  589  1e-167  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0282  carboxyl transferase  54.49 
 
 		 510 aa  589  1e-167  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_389  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  54.76 
 
 		 516 aa  591  1e-167  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.839187  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2835  carboxyl transferase  53.71 
 
 		 510 aa  587  1e-166  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.497575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1705  carboxyl transferase  54.31 
 
 		 510 aa  585  1e-166  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.514847  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2164  carboxyl transferase  54.69 
 
 		 510 aa  587  1e-166  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.158421  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0821  carboxyl transferase  54.76 
 
 		 536 aa  587  1e-166  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588825  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2907  propionyl-CoA carboxylase  54.07 
 
 		 514 aa  585  1e-166  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3755  carboxyl transferase  53.52 
 
 		 510 aa  585  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0296123  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4364  carboxyl transferase  55.11 
 
 		 541 aa  587  1e-166  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11343  propionlyl-CoA carboxylase  55.4 
 
 		 513 aa  587  1e-166  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1016  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  54.1 
 
 		 510 aa  585  1e-166  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0912  carboxyl transferase  54.12 
 
 		 510 aa  585  1e-166  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2881  carboxyl transferase  53.88 
 
 		 514 aa  582  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6390  carboxyl transferase  54.18 
 
 		 543 aa  583  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0531526  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0947  carboxyl transferase  55.36 
 
 		 513 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.592853  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3811  carboxyl transferase  52.93 
 
 		 510 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3688  carboxyl transferase  53.52 
 
 		 510 aa  584  1.0000000000000001e-165  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.618461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0053  carboxyl transferase  53.73 
 
 		 510 aa  580  1e-164  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0489  carboxyl transferase  55.88 
 
 		 520 aa  579  1e-164  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0930  carboxyl transferase  53.4 
 
 		 518 aa  578  1e-164  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>