More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4774 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  70.38 
 
 
524 aa  756    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3989  carboxyl transferase  60.97 
 
 
534 aa  656    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.356314 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4230  carboxyl transferase  67.17 
 
 
552 aa  734    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551859  normal  0.395293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0821  carboxyl transferase  69.96 
 
 
536 aa  743    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588825  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  65.97 
 
 
551 aa  706    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  71.46 
 
 
534 aa  763    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  69.1 
 
 
529 aa  747    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13309  propionyl-CoA carboxylase beta subunit 5 accD5  88.27 
 
 
548 aa  974    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0850  carboxyl transferase  64.77 
 
 
526 aa  692    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000103034  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  70.26 
 
 
530 aa  755    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25440  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  66.03 
 
 
532 aa  699    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199435  normal  0.360386 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  64.96 
 
 
531 aa  706    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  69.38 
 
 
527 aa  740    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1041  carboxyl transferase  66.35 
 
 
542 aa  690    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  67.78 
 
 
537 aa  728    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  74.72 
 
 
546 aa  820    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.35884 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4364  carboxyl transferase  70 
 
 
541 aa  741    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1152  carboxyl transferase  65.06 
 
 
529 aa  703    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579492  normal  0.513821 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1294  carboxyl transferase  90.89 
 
 
556 aa  1013    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1281  carboxyl transferase  62.66 
 
 
527 aa  660    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1043  carboxyl transferase  79.32 
 
 
549 aa  880    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.282671  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6390  carboxyl transferase  72.98 
 
 
543 aa  802    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0531526  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  69.75 
 
 
530 aa  731    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1325  carboxyl transferase  64.65 
 
 
527 aa  688    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000015031 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3495  carboxyl transferase  70.04 
 
 
540 aa  753    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1311  carboxyl transferase  90.89 
 
 
556 aa  1013    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0791098  normal  0.306854 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1021  carboxyl transferase  63.89 
 
 
531 aa  673    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1677  carboxyl transferase  96.47 
 
 
542 aa  1058    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  69.96 
 
 
536 aa  750    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1330  carboxyl transferase  90.89 
 
 
556 aa  1013    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  69.32 
 
 
527 aa  742    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1840  carboxyl transferase  86.23 
 
 
542 aa  939    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21120  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  63.62 
 
 
529 aa  691    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0918457  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  63.01 
 
 
527 aa  678    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4774  carboxyl transferase  100 
 
 
538 aa  1096    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  59.13 
 
 
550 aa  622  1e-177  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  61.03 
 
 
516 aa  620  1e-176  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  60.84 
 
 
522 aa  617  1e-175  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  60.16 
 
 
516 aa  612  9.999999999999999e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  59.32 
 
 
518 aa  609  1e-173  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  60.16 
 
 
516 aa  603  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  56.57 
 
 
531 aa  592  1e-168  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  57.31 
 
 
516 aa  592  1e-168  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0639  carboxyl transferase  55.75 
 
 
513 aa  589  1e-167  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.629685 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  56.15 
 
 
520 aa  590  1e-167  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  55.05 
 
 
514 aa  582  1.0000000000000001e-165  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2974  carboxyl transferase  56.79 
 
 
519 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  56.24 
 
 
516 aa  584  1.0000000000000001e-165  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  55.17 
 
 
531 aa  578  1e-164  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  55.81 
 
 
516 aa  576  1.0000000000000001e-163  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  57.64 
 
 
508 aa  578  1.0000000000000001e-163  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  56.24 
 
 
518 aa  577  1.0000000000000001e-163  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4697  carboxyl transferase  54.89 
 
 
528 aa  577  1.0000000000000001e-163  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2348  carboxyl transferase  55.47 
 
 
512 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  56.43 
 
 
515 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2189  propionyl-CoA carboxylase beta chain  56.15 
 
 
510 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124404  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  56.78 
 
 
512 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2305  propionyl-CoA carboxylase  56.15 
 
 
510 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1621  Propionyl-CoA carboxylase  56.81 
 
 
513 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  56.43 
 
 
515 aa  575  1.0000000000000001e-162  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0861  carboxyl transferase  56.15 
 
 
510 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.833574  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11343  propionlyl-CoA carboxylase  54.58 
 
 
513 aa  574  1.0000000000000001e-162  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  57.39 
 
 
517 aa  568  1e-161  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0271  carboxyl transferase  56.83 
 
 
520 aa  568  1e-161  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.435103  normal  0.1429 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  57.82 
 
 
513 aa  571  1e-161  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0326  carboxyl transferase  55.77 
 
 
510 aa  568  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  0.0697048 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3092  carboxyl transferase  56.44 
 
 
516 aa  569  1e-161  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.391297  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1632  carboxyl transferase  53.9 
 
 
522 aa  568  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4004  carboxyl transferase  54.05 
 
 
511 aa  565  1e-160  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.680854 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0282  carboxyl transferase  55.77 
 
 
510 aa  568  1e-160  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1877  propionyl-CoA carboxylase  55.19 
 
 
510 aa  566  1e-160  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0358  carboxyl transferase  55.58 
 
 
510 aa  567  1e-160  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3787  Propionyl-CoA carboxylase  53.46 
 
 
510 aa  565  1e-160  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3688  carboxyl transferase  54.81 
 
 
510 aa  566  1e-160  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.618461  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2513  carboxyl transferase  54.51 
 
 
510 aa  566  1e-160  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152871  normal  0.332227 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2835  carboxyl transferase  55.53 
 
 
510 aa  568  1e-160  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.497575  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  53.55 
 
 
516 aa  565  1.0000000000000001e-159  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1880  carboxyl transferase  54.81 
 
 
510 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0295366 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0424  carboxyl transferase  54.32 
 
 
516 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0808  carboxyl transferase  54.88 
 
 
508 aa  563  1.0000000000000001e-159  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3374  carboxyl transferase  55.58 
 
 
510 aa  565  1.0000000000000001e-159  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.778087  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2894  carboxyl transferase  55.64 
 
 
510 aa  564  1.0000000000000001e-159  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.437903 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1735  carboxyl transferase  54.32 
 
 
510 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2003  carboxyl transferase  54.04 
 
 
510 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0912  carboxyl transferase  56.32 
 
 
510 aa  563  1.0000000000000001e-159  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5024  putative propionyl-CoA carboxylase beta chain  55.05 
 
 
510 aa  561  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.541202 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2082  carboxyl transferase  54.42 
 
 
510 aa  560  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.122916  normal  0.0739179 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1579  carboxyl transferase  55.45 
 
 
523 aa  560  1e-158  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0377813  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0386  propionyl-CoA carboxylase  54.37 
 
 
514 aa  561  1e-158  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1851  carboxyl transferase  53.93 
 
 
510 aa  559  1e-158  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0930  carboxyl transferase  55.73 
 
 
518 aa  560  1e-158  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  52.87 
 
 
516 aa  559  1e-158  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0447  acyl CoA biotin-dependant carboxyltransferase  53.55 
 
 
516 aa  556  1e-157  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0718  carboxyl transferase  55.21 
 
 
510 aa  555  1e-157  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.267542  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5510  carboxyl transferase  55 
 
 
510 aa  556  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3122  carboxyl transferase  54.65 
 
 
510 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.629263  normal  0.624995 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3811  carboxyl transferase  54.62 
 
 
510 aa  557  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3755  carboxyl transferase  53.64 
 
 
510 aa  557  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0296123  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2381  carboxyl transferase  54.04 
 
 
510 aa  556  1e-157  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2042  carboxyl transferase  54.13 
 
 
510 aa  558  1e-157  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0884189  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>