More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1489 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1632  carboxyl transferase  59.53 
 
 
522 aa  647    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_002936  DET0447  acyl CoA biotin-dependant carboxyltransferase  56.92 
 
 
516 aa  635    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  62.3 
 
 
517 aa  671    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  61.35 
 
 
520 aa  673    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3755  carboxyl transferase  59.45 
 
 
510 aa  650    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0296123  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  65.69 
 
 
515 aa  710    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  69.73 
 
 
516 aa  759    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0307  carboxyl transferase  65.43 
 
 
516 aa  687    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  61.82 
 
 
516 aa  677    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4004  carboxyl transferase  59.34 
 
 
511 aa  644    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.680854 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  65.89 
 
 
515 aa  711    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2284  carboxyl transferase  64.86 
 
 
522 aa  709    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00152526  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3092  carboxyl transferase  63.98 
 
 
516 aa  653    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.391297  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  59.48 
 
 
518 aa  636    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0424  carboxyl transferase  57.89 
 
 
516 aa  645    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  63.16 
 
 
522 aa  682    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  60.43 
 
 
513 aa  645    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1521  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  59.84 
 
 
513 aa  639    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0053  carboxyl transferase  60.27 
 
 
510 aa  644    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  66.02 
 
 
517 aa  720    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1621  Propionyl-CoA carboxylase  61.06 
 
 
513 aa  657    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0250  carboxyl transferase  61.08 
 
 
519 aa  671    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.135558  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  63.19 
 
 
516 aa  669    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  66.6 
 
 
516 aa  731    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2974  carboxyl transferase  60.67 
 
 
519 aa  647    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0271  Propionyl-CoA carboxylase  61.27 
 
 
519 aa  671    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.846145  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2803  propionyl-CoA carboxylase  58.59 
 
 
510 aa  638    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.342128  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2164  carboxyl transferase  59.65 
 
 
510 aa  644    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.158421  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  63.48 
 
 
531 aa  704    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0291  carboxyl transferase  64.09 
 
 
519 aa  692    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  62.96 
 
 
514 aa  696    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4697  carboxyl transferase  61.9 
 
 
528 aa  682    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0489  carboxyl transferase  61.14 
 
 
520 aa  640    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1877  propionyl-CoA carboxylase  59.65 
 
 
510 aa  641    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0639  carboxyl transferase  59.06 
 
 
513 aa  635    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.629685 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0947  carboxyl transferase  58.87 
 
 
513 aa  641    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.592853  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  61.06 
 
 
550 aa  670    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2361  carboxyl transferase  61.03 
 
 
513 aa  649    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000738755  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0271  carboxyl transferase  62.75 
 
 
520 aa  676    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.435103  normal  0.1429 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  100 
 
 
518 aa  1066    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1223  carboxyl transferase  63.28 
 
 
517 aa  690    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00883657  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0386  propionyl-CoA carboxylase  60.39 
 
 
514 aa  648    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0553  carboxyl transferase  63.35 
 
 
518 aa  652    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.965666  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  64.31 
 
 
512 aa  680    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  60.43 
 
 
516 aa  674    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11343  propionlyl-CoA carboxylase  60.95 
 
 
513 aa  642    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_389  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  57.31 
 
 
516 aa  639    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.839187  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  63.01 
 
 
512 aa  676    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2130  carboxyl transferase  58.27 
 
 
514 aa  642    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.955323  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2694  carboxyl transferase  59.06 
 
 
510 aa  642    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1316  carboxyl transferase  63.48 
 
 
514 aa  681    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0077  carboxyl transferase  63.3 
 
 
517 aa  694    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.371983  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2348  carboxyl transferase  59.77 
 
 
512 aa  635    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0930  carboxyl transferase  58.67 
 
 
518 aa  636    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2513  carboxyl transferase  60.04 
 
 
510 aa  658    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152871  normal  0.332227 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2381  carboxyl transferase  59.88 
 
 
510 aa  640    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2042  carboxyl transferase  60.51 
 
 
510 aa  653    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0884189  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0912  carboxyl transferase  58.91 
 
 
510 aa  635    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3401  carboxyl transferase  60.35 
 
 
510 aa  650    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1016  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  58.59 
 
 
510 aa  636    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3484  carboxyl transferase  60.43 
 
 
510 aa  655    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  67.19 
 
 
516 aa  745    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  62.57 
 
 
516 aa  692    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  68.7 
 
 
508 aa  736    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1851  carboxyl transferase  59.92 
 
 
510 aa  650    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3166  carboxyl transferase  60.83 
 
 
521 aa  652    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0567033  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  63.47 
 
 
516 aa  653    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0260  carboxyl transferase  61.27 
 
 
519 aa  672    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  60.35 
 
 
531 aa  665    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  59.1 
 
 
530 aa  633  1e-180  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0999  carboxyl transferase  60 
 
 
527 aa  631  1e-180  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  58.48 
 
 
529 aa  628  1e-179  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0889  carboxyl transferase  57.56 
 
 
564 aa  628  1e-179  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5510  carboxyl transferase  57.89 
 
 
510 aa  629  1e-179  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3811  carboxyl transferase  57.89 
 
 
510 aa  630  1e-179  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0358  carboxyl transferase  58.09 
 
 
510 aa  629  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3025  carboxyl transferase  58.72 
 
 
532 aa  630  1e-179  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.432014 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0326  carboxyl transferase  58.28 
 
 
510 aa  630  1e-179  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  0.0697048 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1248  carboxyl transferase  58.2 
 
 
522 aa  630  1e-179  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2894  carboxyl transferase  59.88 
 
 
510 aa  629  1e-179  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.437903 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0282  carboxyl transferase  58.09 
 
 
510 aa  628  1e-179  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3541  carboxyl transferase  58.12 
 
 
514 aa  625  1e-178  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  57.81 
 
 
531 aa  627  1e-178  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2999  carboxyl transferase  57.65 
 
 
510 aa  624  1e-177  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2835  carboxyl transferase  57.7 
 
 
510 aa  624  1e-177  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.497575  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1375  propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit alpha / propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit beta  54.79 
 
 
524 aa  623  1e-177  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0140013 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3374  carboxyl transferase  57.03 
 
 
510 aa  621  1e-177  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.778087  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0272  carboxyl transferase  55.88 
 
 
515 aa  624  1e-177  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00889461 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0335  carboxyl transferase  57.7 
 
 
514 aa  622  1e-177  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.868559  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1754  carboxyl transferase  58.67 
 
 
510 aa  623  1e-177  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.218371  normal  0.119502 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1593  carboxyl transferase  58.06 
 
 
514 aa  623  1e-177  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0139637  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  57.31 
 
 
530 aa  621  1e-177  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2771  carboxyl transferase  58.67 
 
 
510 aa  623  1e-177  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.110182 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5659  carboxyl transferase  57.7 
 
 
510 aa  624  1e-177  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  58.17 
 
 
534 aa  619  1e-176  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  56.9 
 
 
537 aa  619  1e-176  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4725  carboxyl transferase  57.89 
 
 
510 aa  618  1e-176  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.48705  normal  0.0648736 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0317  carboxyl transferase  58.12 
 
 
514 aa  620  1e-176  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6139  carboxyl transferase  58.04 
 
 
510 aa  621  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.222288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  58.01 
 
 
551 aa  620  1e-176  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>