More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0700 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4230  carboxyl transferase  67.22 
 
 		 552 aa  740    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551859  normal  0.395293 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  71.86 
 
 		 516 aa  733    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4364  carboxyl transferase  71.91 
 
 		 541 aa  787    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1632  carboxyl transferase  60 
 
 		 522 aa  647    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  90.02 
 
 		 551 aa  997    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  58.79 
 
 		 515 aa  637    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  66.86 
 
 		 516 aa  719    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2974  carboxyl transferase  60.85 
 
 		 519 aa  654    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  76.35 
 
 		 530 aa  828    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  60.85 
 
 		 531 aa  645    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  61.61 
 
 		 508 aa  653    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  73.27 
 
 		 534 aa  785    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  75.76 
 
 		 527 aa  832    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  69.92 
 
 		 546 aa  766    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.35884 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2189  propionyl-CoA carboxylase beta chain  62.37 
 
 		 510 aa  637    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124404  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21120  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  66.41 
 
 		 529 aa  702    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0918457  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1840  carboxyl transferase  67.35 
 
 		 542 aa  744    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0250  carboxyl transferase  63.22 
 
 		 519 aa  668    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.135558  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  71.6 
 
 		 516 aa  722    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1325  carboxyl transferase  63.36 
 
 		 527 aa  679    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000015031 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  100 
 
 		 531 aa  1089    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  76.25 
 
 		 527 aa  823    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  75.19 
 
 		 524 aa  820    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1043  carboxyl transferase  63.25 
 
 		 549 aa  694    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.282671  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  64.47 
 
 		 518 aa  677    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0271  carboxyl transferase  61.54 
 
 		 520 aa  655    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.435103  normal  0.1429 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  76.27 
 
 		 530 aa  830    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0821  carboxyl transferase  72.25 
 
 		 536 aa  795    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588825  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0850  carboxyl transferase  64.89 
 
 		 526 aa  697    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000103034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  59.49 
 
 		 516 aa  647    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  62.72 
 
 		 520 aa  661    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2305  propionyl-CoA carboxylase  62.98 
 
 		 510 aa  642    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0271  Propionyl-CoA carboxylase  63.03 
 
 		 519 aa  664    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.846145  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4697  carboxyl transferase  61.13 
 
 		 528 aa  656    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1621  Propionyl-CoA carboxylase  64.06 
 
 		 513 aa  668    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1877  propionyl-CoA carboxylase  60.47 
 
 		 510 aa  635    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1294  carboxyl transferase  64.46 
 
 		 556 aa  704    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  63.24 
 
 		 527 aa  669    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  65.96 
 
 		 550 aa  717    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  59.38 
 
 		 516 aa  646    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3989  carboxyl transferase  63.6 
 
 		 534 aa  658    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.356314 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1281  carboxyl transferase  63.17 
 
 		 527 aa  669    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  67.95 
 
 		 522 aa  737    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25440  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  65.22 
 
 		 532 aa  707    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199435  normal  0.360386 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6390  carboxyl transferase  72.56 
 
 		 543 aa  786    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0531526  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  72.76 
 
 		 537 aa  797    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3688  carboxyl transferase  61.99 
 
 		 510 aa  651    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.618461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1152  carboxyl transferase  68.14 
 
 		 529 aa  716    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579492  normal  0.513821 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3495  carboxyl transferase  72.34 
 
 		 540 aa  802    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1311  carboxyl transferase  64.46 
 
 		 556 aa  704    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0791098  normal  0.306854 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  59.88 
 
 		 516 aa  635    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1677  carboxyl transferase  65.03 
 
 		 542 aa  704    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  75.58 
 
 		 529 aa  821    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1041  carboxyl transferase  67.05 
 
 		 542 aa  697    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0861  carboxyl transferase  62.37 
 
 		 510 aa  637    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.833574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1330  carboxyl transferase  64.46 
 
 		 556 aa  704    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0260  carboxyl transferase  63.22 
 
 		 519 aa  667    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13309  propionyl-CoA carboxylase beta subunit 5 accD5  64.46 
 
 		 548 aa  703    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1021  carboxyl transferase  65.33 
 
 		 531 aa  683    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4774  carboxyl transferase  64.96 
 
 		 538 aa  706    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  71.19 
 
 		 536 aa  779    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1316  carboxyl transferase  59.18 
 
 		 514 aa  632  1e-180  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11343  propionlyl-CoA carboxylase  59.72 
 
 		 513 aa  633  1e-180  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  58.01 
 
 		 515 aa  632  1e-180  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  58.4 
 
 		 516 aa  633  1e-180  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  58.59 
 
 		 517 aa  629  1e-179  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2835  carboxyl transferase  59.56 
 
 		 510 aa  628  1e-179  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.497575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4004  carboxyl transferase  59.18 
 
 		 511 aa  628  1e-179  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.680854 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3755  carboxyl transferase  59.3 
 
 		 510 aa  628  1e-179  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0296123  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  56.25 
 
 		 514 aa  630  1e-179  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2513  carboxyl transferase  58.71 
 
 		 510 aa  628  1e-179  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152871  normal  0.332227 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2348  carboxyl transferase  61.03 
 
 		 512 aa  630  1e-179  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1851  carboxyl transferase  58.32 
 
 		 510 aa  625  1e-178  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2164  carboxyl transferase  58.71 
 
 		 510 aa  626  1e-178  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.158421  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2130  carboxyl transferase  59.14 
 
 		 514 aa  625  1e-178  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.955323  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  57.82 
 
 		 531 aa  628  1e-178  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1223  carboxyl transferase  57.28 
 
 		 517 aa  625  1e-178  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00883657  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3484  carboxyl transferase  59.1 
 
 		 510 aa  625  1e-178  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5510  carboxyl transferase  58.32 
 
 		 510 aa  625  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2042  carboxyl transferase  58.32 
 
 		 510 aa  626  1e-178  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0884189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0639  carboxyl transferase  60.24 
 
 		 513 aa  627  1e-178  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.629685 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  57.81 
 
 		 518 aa  627  1e-178  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  59.3 
 
 		 516 aa  627  1e-178  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0326  carboxyl transferase  58.12 
 
 		 510 aa  622  1e-177  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  0.0697048 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  60 
 
 		 513 aa  624  1e-177  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2003  carboxyl transferase  59.88 
 
 		 510 aa  623  1e-177  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0808  carboxyl transferase  59.53 
 
 		 508 aa  624  1e-177  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2803  propionyl-CoA carboxylase  58.32 
 
 		 510 aa  621  1e-177  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.342128  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2381  carboxyl transferase  58.95 
 
 		 510 aa  622  1e-177  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1016  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  58.71 
 
 		 510 aa  622  1e-177  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3811  carboxyl transferase  59.36 
 
 		 510 aa  624  1e-177  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0282  carboxyl transferase  57.93 
 
 		 510 aa  620  1e-176  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2082  carboxyl transferase  59.3 
 
 		 510 aa  619  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.122916  normal  0.0739179 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3374  carboxyl transferase  60.56 
 
 		 510 aa  619  1e-176  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.778087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0358  carboxyl transferase  57.73 
 
 		 510 aa  620  1e-176  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1735  carboxyl transferase  59.3 
 
 		 510 aa  619  1e-176  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  57.73 
 
 		 512 aa  619  1e-176  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4725  carboxyl transferase  59.56 
 
 		 510 aa  620  1e-176  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.48705  normal  0.0648736 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5659  carboxyl transferase  58.12 
 
 		 510 aa  620  1e-176  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3401  carboxyl transferase  57.53 
 
 		 510 aa  619  1e-176  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>