More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0889 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  61.18 
 
 		 508 aa  643    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11343  propionlyl-CoA carboxylase  60.04 
 
 		 513 aa  641    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  69.9 
 
 		 517 aa  762    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2305  propionyl-CoA carboxylase  62.93 
 
 		 510 aa  680    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1705  carboxyl transferase  60.93 
 
 		 510 aa  657    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.514847  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  59.5 
 
 		 516 aa  638    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3811  carboxyl transferase  59.07 
 
 		 510 aa  639    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4004  carboxyl transferase  61.09 
 
 		 511 aa  665    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.680854 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  59.62 
 
 		 520 aa  669    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2189  propionyl-CoA carboxylase beta chain  62.55 
 
 		 510 aa  676    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124404  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  86.94 
 
 		 513 aa  941    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1521  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  79.53 
 
 		 513 aa  852    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2999  carboxyl transferase  61.32 
 
 		 510 aa  668    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0889  carboxyl transferase  100 
 
 		 564 aa  1170    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0053  carboxyl transferase  61.99 
 
 		 510 aa  678    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2003  carboxyl transferase  61.48 
 
 		 510 aa  666    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0808  carboxyl transferase  62.13 
 
 		 508 aa  651    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1632  carboxyl transferase  62.75 
 
 		 522 aa  659    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0639  carboxyl transferase  61.9 
 
 		 513 aa  657    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.629685 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3374  carboxyl transferase  59.84 
 
 		 510 aa  650    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.778087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2803  propionyl-CoA carboxylase  61.99 
 
 		 510 aa  675    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.342128  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0358  carboxyl transferase  58.61 
 
 		 510 aa  634    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2164  carboxyl transferase  62.38 
 
 		 510 aa  674    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.158421  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4239  carboxyl transferase  60.31 
 
 		 510 aa  650    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.540833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5680  propionyl-CoA carboxylase  61.48 
 
 		 510 aa  658    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4697  carboxyl transferase  60.04 
 
 		 528 aa  673    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1877  propionyl-CoA carboxylase  63.51 
 
 		 510 aa  681    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2974  carboxyl transferase  63.94 
 
 		 519 aa  664    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2130  carboxyl transferase  61.7 
 
 		 514 aa  676    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.955323  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6139  carboxyl transferase  61.25 
 
 		 510 aa  656    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.222288 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1754  carboxyl transferase  61.51 
 
 		 510 aa  662    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.218371  normal  0.119502 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0386  propionyl-CoA carboxylase  63.35 
 
 		 514 aa  688    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3755  carboxyl transferase  61.79 
 
 		 510 aa  682    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0296123  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0947  carboxyl transferase  85.96 
 
 		 513 aa  926    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.592853  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3688  carboxyl transferase  62.16 
 
 		 510 aa  672    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.618461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3484  carboxyl transferase  61.99 
 
 		 510 aa  678    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2771  carboxyl transferase  60.04 
 
 		 510 aa  639    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110182 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2348  carboxyl transferase  62.23 
 
 		 512 aa  645    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2694  carboxyl transferase  60.27 
 
 		 510 aa  667    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1851  carboxyl transferase  61.6 
 
 		 510 aa  672    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0718  carboxyl transferase  61 
 
 		 510 aa  649    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.267542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2894  carboxyl transferase  61.99 
 
 		 510 aa  664    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.437903 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0930  carboxyl transferase  61.7 
 
 		 518 aa  669    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2513  carboxyl transferase  62.57 
 
 		 510 aa  681    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152871  normal  0.332227 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2381  carboxyl transferase  62.18 
 
 		 510 aa  677    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2042  carboxyl transferase  61.99 
 
 		 510 aa  678    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0884189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3401  carboxyl transferase  60.62 
 
 		 510 aa  658    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1016  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  61.6 
 
 		 510 aa  674    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0861  carboxyl transferase  62.55 
 
 		 510 aa  676    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.833574  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  57.82 
 
 		 531 aa  636    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5510  carboxyl transferase  59.07 
 
 		 510 aa  639    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0912  carboxyl transferase  61.9 
 
 		 510 aa  668    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2835  carboxyl transferase  59.07 
 
 		 510 aa  634    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.497575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0282  carboxyl transferase  58.22 
 
 		 510 aa  632  1e-180  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0326  carboxyl transferase  58.41 
 
 		 510 aa  633  1e-180  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  0.0697048 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5659  carboxyl transferase  59.07 
 
 		 510 aa  632  1e-180  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45886  predicted protein  59.34 
 
 		 581 aa  630  1e-179  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0271  carboxyl transferase  59.41 
 
 		 520 aa  629  1e-179  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.435103  normal  0.1429 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  57.56 
 
 		 518 aa  628  1e-179  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0250  carboxyl transferase  58.17 
 
 		 519 aa  629  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.135558  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0260  carboxyl transferase  58.81 
 
 		 519 aa  630  1e-179  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3397  carboxyl transferase  57.25 
 
 		 510 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1621  Propionyl-CoA carboxylase  59.34 
 
 		 513 aa  627  1e-178  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1317  carboxyl transferase  57.89 
 
 		 510 aa  625  1e-178  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.182185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0271  Propionyl-CoA carboxylase  58.61 
 
 		 519 aa  627  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.846145  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1401  carboxyl transferase  57.64 
 
 		 510 aa  621  1e-177  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0947587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5024  putative propionyl-CoA carboxylase beta chain  58.03 
 
 		 510 aa  622  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.541202 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  57.14 
 
 		 516 aa  623  1e-177  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1880  carboxyl transferase  57.83 
 
 		 510 aa  622  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0295366 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  58.17 
 
 		 516 aa  622  1e-177  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2082  carboxyl transferase  57.64 
 
 		 510 aa  624  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.122916  normal  0.0739179 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  57.34 
 
 		 516 aa  623  1e-177  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_002978  WD1157  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  58.45 
 
 		 508 aa  620  1e-176  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.167256  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1579  carboxyl transferase  57.25 
 
 		 523 aa  619  1e-176  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0377813  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1316  carboxyl transferase  58.45 
 
 		 514 aa  620  1e-176  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4725  carboxyl transferase  57.14 
 
 		 510 aa  617  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.48705  normal  0.0648736 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  57.5 
 
 		 517 aa  615  1e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2284  carboxyl transferase  58.28 
 
 		 522 aa  616  1e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00152526  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1735  carboxyl transferase  57.72 
 
 		 510 aa  613  9.999999999999999e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3618  carboxyl transferase  57.64 
 
 		 510 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207692  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  57.06 
 
 		 516 aa  611  9.999999999999999e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  55.56 
 
 		 531 aa  614  9.999999999999999e-175  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3787  Propionyl-CoA carboxylase  55.9 
 
 		 510 aa  609  1e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  59.96 
 
 		 516 aa  610  1e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2342  carboxyl transferase  56.29 
 
 		 510 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.150986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3122  carboxyl transferase  56.48 
 
 		 510 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.629263  normal  0.624995 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  57.92 
 
 		 522 aa  607  9.999999999999999e-173  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  59.12 
 
 		 529 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  57.06 
 
 		 512 aa  603  1.0000000000000001e-171  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  56.39 
 
 		 531 aa  602  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  57.36 
 
 		 515 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  57.5 
 
 		 512 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  59.61 
 
 		 530 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  54.46 
 
 		 537 aa  600  1e-170  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  60.37 
 
 		 516 aa  599  1e-170  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  57.17 
 
 		 515 aa  601  1e-170  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3092  carboxyl transferase  59 
 
 		 516 aa  601  1e-170  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.391297  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0307  carboxyl transferase  57.31 
 
 		 516 aa  600  1e-170  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0424  carboxyl transferase  55.93 
 
 		 516 aa  600  1e-170  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0437  carboxyl transferase  56.12 
 
 		 509 aa  595  1e-169  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.137321  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>