More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0797 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  59.5 
 
 
516 aa  659    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_002936  DET0447  acyl CoA biotin-dependant carboxyltransferase  57.95 
 
 
516 aa  642    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2003  carboxyl transferase  62.26 
 
 
510 aa  662    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  62.75 
 
 
517 aa  667    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  69.82 
 
 
508 aa  748    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2999  carboxyl transferase  61.09 
 
 
510 aa  646    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  62.11 
 
 
512 aa  666    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2835  carboxyl transferase  60.51 
 
 
510 aa  648    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.497575  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1705  carboxyl transferase  61.28 
 
 
510 aa  647    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.514847  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0282  carboxyl transferase  60.89 
 
 
510 aa  650    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6139  carboxyl transferase  61.64 
 
 
510 aa  643    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.222288 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  63.93 
 
 
516 aa  656    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1621  Propionyl-CoA carboxylase  64.09 
 
 
513 aa  679    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2305  propionyl-CoA carboxylase  60.89 
 
 
510 aa  646    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  59.88 
 
 
516 aa  664    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4004  carboxyl transferase  61.17 
 
 
511 aa  660    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.680854 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5680  propionyl-CoA carboxylase  61.25 
 
 
510 aa  643    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  60.35 
 
 
534 aa  635    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0999  carboxyl transferase  60.42 
 
 
527 aa  640    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3484  carboxyl transferase  62.06 
 
 
510 aa  666    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0260  carboxyl transferase  62.04 
 
 
519 aa  660    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  62.11 
 
 
529 aa  645    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2189  propionyl-CoA carboxylase beta chain  60.7 
 
 
510 aa  644    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124404  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0291  carboxyl transferase  64.4 
 
 
519 aa  711    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  60.23 
 
 
513 aa  644    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1521  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  60.23 
 
 
513 aa  635    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  62.84 
 
 
512 aa  678    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  100 
 
 
516 aa  1060    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  69.73 
 
 
518 aa  759    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0053  carboxyl transferase  61.48 
 
 
510 aa  655    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  67.65 
 
 
517 aa  719    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0250  carboxyl transferase  61.93 
 
 
519 aa  656    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.135558  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1851  carboxyl transferase  62.45 
 
 
510 aa  664    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  65.31 
 
 
515 aa  705    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  59.49 
 
 
531 aa  647    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  63.14 
 
 
516 aa  668    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  58.91 
 
 
537 aa  635    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  60.15 
 
 
520 aa  650    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2284  carboxyl transferase  63.57 
 
 
522 aa  687    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00152526  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0889  carboxyl transferase  59.5 
 
 
564 aa  638    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3374  carboxyl transferase  60.55 
 
 
510 aa  642    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.778087  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2803  propionyl-CoA carboxylase  61.87 
 
 
510 aa  662    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.342128  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  66.73 
 
 
514 aa  746    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2164  carboxyl transferase  61.67 
 
 
510 aa  657    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.158421  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  65.89 
 
 
515 aa  710    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1632  carboxyl transferase  62.04 
 
 
522 aa  657    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11343  propionlyl-CoA carboxylase  61.84 
 
 
513 aa  638    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_389  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  58.14 
 
 
516 aa  644    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.839187  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3025  carboxyl transferase  61.28 
 
 
532 aa  652    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.432014 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4697  carboxyl transferase  62.98 
 
 
528 aa  681    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0489  carboxyl transferase  62.26 
 
 
520 aa  648    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1877  propionyl-CoA carboxylase  61.87 
 
 
510 aa  650    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  65.89 
 
 
516 aa  748    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0077  carboxyl transferase  64.85 
 
 
517 aa  722    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.371983  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0358  carboxyl transferase  61.09 
 
 
510 aa  652    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  62.72 
 
 
550 aa  664    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0307  carboxyl transferase  62.98 
 
 
516 aa  662    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0271  carboxyl transferase  61.84 
 
 
520 aa  660    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.435103  normal  0.1429 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2771  carboxyl transferase  60.94 
 
 
510 aa  642    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.110182 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  64.08 
 
 
516 aa  644    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  62.94 
 
 
530 aa  659    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0947  carboxyl transferase  59.84 
 
 
513 aa  643    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.592853  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1223  carboxyl transferase  62.65 
 
 
517 aa  697    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00883657  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0386  propionyl-CoA carboxylase  60.7 
 
 
514 aa  656    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0424  carboxyl transferase  58.33 
 
 
516 aa  644    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0553  carboxyl transferase  61.37 
 
 
518 aa  649    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.965666  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4725  carboxyl transferase  60.12 
 
 
510 aa  643    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.48705  normal  0.0648736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2974  carboxyl transferase  63.01 
 
 
519 aa  663    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0639  carboxyl transferase  62.11 
 
 
513 aa  645    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.629685 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1593  carboxyl transferase  58.69 
 
 
514 aa  640    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0139637  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3688  carboxyl transferase  60.31 
 
 
510 aa  636    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.618461  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  60.58 
 
 
531 aa  667    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  62.02 
 
 
531 aa  677    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3755  carboxyl transferase  62.45 
 
 
510 aa  665    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0296123  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  62.4 
 
 
522 aa  667    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2694  carboxyl transferase  60.7 
 
 
510 aa  645    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2361  carboxyl transferase  62.3 
 
 
513 aa  651    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000738755  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0271  Propionyl-CoA carboxylase  62.04 
 
 
519 aa  658    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.846145  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  60.74 
 
 
527 aa  644    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3092  carboxyl transferase  60.27 
 
 
516 aa  639    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.391297  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1316  carboxyl transferase  66.27 
 
 
514 aa  703    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2130  carboxyl transferase  62.16 
 
 
514 aa  656    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.955323  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0930  carboxyl transferase  61.09 
 
 
518 aa  651    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2513  carboxyl transferase  61.87 
 
 
510 aa  667    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152871  normal  0.332227 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2381  carboxyl transferase  61.67 
 
 
510 aa  657    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2042  carboxyl transferase  62.26 
 
 
510 aa  662    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0884189  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3401  carboxyl transferase  61.28 
 
 
510 aa  660    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1016  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  62.84 
 
 
510 aa  665    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  69.53 
 
 
516 aa  760    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0861  carboxyl transferase  60.7 
 
 
510 aa  644    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.833574  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5024  putative propionyl-CoA carboxylase beta chain  60.7 
 
 
510 aa  640    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.541202 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5510  carboxyl transferase  60.12 
 
 
510 aa  644    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3166  carboxyl transferase  62.3 
 
 
521 aa  650    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0567033  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  59.57 
 
 
524 aa  638    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3811  carboxyl transferase  60.31 
 
 
510 aa  647    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5659  carboxyl transferase  59.92 
 
 
510 aa  636    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0718  carboxyl transferase  61.09 
 
 
510 aa  636    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.267542  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0326  carboxyl transferase  61.09 
 
 
510 aa  652    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  0.0697048 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0912  carboxyl transferase  61.48 
 
 
510 aa  655    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  59.77 
 
 
527 aa  633  1e-180  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>