More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4102 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5680  propionyl-CoA carboxylase  61.96 
 
 		 510 aa  637    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1632  carboxyl transferase  62.04 
 
 		 522 aa  642    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  62.86 
 
 		 517 aa  670    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  69.44 
 
 		 530 aa  739    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  66.09 
 
 		 530 aa  695    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0282  carboxyl transferase  60.82 
 
 		 510 aa  637    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1705  carboxyl transferase  62.55 
 
 		 510 aa  636    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.514847  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4230  carboxyl transferase  61.48 
 
 		 552 aa  669    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551859  normal  0.395293 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  61.88 
 
 		 527 aa  644    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2305  propionyl-CoA carboxylase  61.99 
 
 		 510 aa  645    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2999  carboxyl transferase  63.14 
 
 		 510 aa  642    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2130  carboxyl transferase  64.6 
 
 		 514 aa  664    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.955323  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4004  carboxyl transferase  64.19 
 
 		 511 aa  672    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.680854 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  79.65 
 
 		 516 aa  867    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1041  carboxyl transferase  63.23 
 
 		 542 aa  651    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  64.93 
 
 		 534 aa  691    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0326  carboxyl transferase  61.01 
 
 		 510 aa  639    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  0.0697048 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1152  carboxyl transferase  62.84 
 
 		 529 aa  668    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579492  normal  0.513821 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  67.95 
 
 		 518 aa  688    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2189  propionyl-CoA carboxylase beta chain  61.79 
 
 		 510 aa  643    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124404  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  61.58 
 
 		 515 aa  665    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  61.86 
 
 		 513 aa  652    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  66.02 
 
 		 531 aa  702    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  61.94 
 
 		 516 aa  664    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0358  carboxyl transferase  60.82 
 
 		 510 aa  638    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0053  carboxyl transferase  61.99 
 
 		 510 aa  641    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  59.77 
 
 		 517 aa  635    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6390  carboxyl transferase  62.64 
 
 		 543 aa  674    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0531526  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0250  carboxyl transferase  69.53 
 
 		 519 aa  699    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.135558  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2894  carboxyl transferase  61.96 
 
 		 510 aa  636    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.437903 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  62.16 
 
 		 515 aa  668    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  70.35 
 
 		 531 aa  738    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0077  carboxyl transferase  58.22 
 
 		 517 aa  642    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.371983  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  67.44 
 
 		 522 aa  719    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2003  carboxyl transferase  62.18 
 
 		 510 aa  653    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0260  carboxyl transferase  69.53 
 
 		 519 aa  698    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1621  Propionyl-CoA carboxylase  68.49 
 
 		 513 aa  722    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4364  carboxyl transferase  64.83 
 
 		 541 aa  688    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2803  propionyl-CoA carboxylase  63.33 
 
 		 510 aa  654    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.342128  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1021  carboxyl transferase  62.55 
 
 		 531 aa  656    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2974  carboxyl transferase  61.22 
 
 		 519 aa  640    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2164  carboxyl transferase  63.73 
 
 		 510 aa  660    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.158421  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1840  carboxyl transferase  61.63 
 
 		 542 aa  651    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1851  carboxyl transferase  63.53 
 
 		 510 aa  665    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  63.89 
 
 		 546 aa  682    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.35884 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4697  carboxyl transferase  62.5 
 
 		 528 aa  659    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0271  Propionyl-CoA carboxylase  69.53 
 
 		 519 aa  698    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.846145  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1877  propionyl-CoA carboxylase  63.94 
 
 		 510 aa  664    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0271  carboxyl transferase  67.89 
 
 		 520 aa  688    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.435103  normal  0.1429 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  67.43 
 
 		 529 aa  714    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  71.46 
 
 		 551 aa  726    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  60.82 
 
 		 518 aa  672    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  62.57 
 
 		 536 aa  667    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  71.51 
 
 		 550 aa  765    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  63.29 
 
 		 508 aa  676    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  66.47 
 
 		 524 aa  719    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1316  carboxyl transferase  61.06 
 
 		 514 aa  650    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  60.04 
 
 		 514 aa  659    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0821  carboxyl transferase  63.83 
 
 		 536 aa  692    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588825  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1223  carboxyl transferase  58.99 
 
 		 517 aa  646    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00883657  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0386  propionyl-CoA carboxylase  63.35 
 
 		 514 aa  667    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3811  carboxyl transferase  61.01 
 
 		 510 aa  636    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  58.98 
 
 		 516 aa  639    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  62.72 
 
 		 516 aa  672    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6139  carboxyl transferase  61.6 
 
 		 510 aa  639    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.222288 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3688  carboxyl transferase  63.16 
 
 		 510 aa  658    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.618461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21120  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  62.76 
 
 		 529 aa  654    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0918457  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3484  carboxyl transferase  63.53 
 
 		 510 aa  662    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  63.76 
 
 		 516 aa  667    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3495  carboxyl transferase  64.44 
 
 		 540 aa  699    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3092  carboxyl transferase  65.92 
 
 		 516 aa  651    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.391297  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  100 
 
 		 516 aa  1056    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0850  carboxyl transferase  63.48 
 
 		 526 aa  672    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000103034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  65.19 
 
 		 520 aa  687    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25440  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  63.53 
 
 		 532 aa  666    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199435  normal  0.360386 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  98.06 
 
 		 516 aa  1039    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0930  carboxyl transferase  61.21 
 
 		 518 aa  640    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2513  carboxyl transferase  63.53 
 
 		 510 aa  667    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152871  normal  0.332227 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2381  carboxyl transferase  62.96 
 
 		 510 aa  659    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2042  carboxyl transferase  63.53 
 
 		 510 aa  666    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0884189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3401  carboxyl transferase  62.55 
 
 		 510 aa  649    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1016  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  64.31 
 
 		 510 aa  664    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  62.37 
 
 		 516 aa  649    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0861  carboxyl transferase  61.79 
 
 		 510 aa  643    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.833574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3755  carboxyl transferase  64.31 
 
 		 510 aa  669    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0296123  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  63.95 
 
 		 537 aa  696    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  60.2 
 
 		 531 aa  637    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2694  carboxyl transferase  62.72 
 
 		 510 aa  649    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  67.82 
 
 		 527 aa  719    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0291  carboxyl transferase  60.97 
 
 		 519 aa  642    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0912  carboxyl transferase  61.01 
 
 		 510 aa  639    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  68.4 
 
 		 527 aa  729    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1043  carboxyl transferase  60.19 
 
 		 549 aa  633  1e-180  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.282671  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5510  carboxyl transferase  60.82 
 
 		 510 aa  631  1e-180  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0639  carboxyl transferase  60.23 
 
 		 513 aa  631  1e-180  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.629685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1294  carboxyl transferase  60.04 
 
 		 556 aa  633  1e-180  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1325  carboxyl transferase  59.77 
 
 		 527 aa  632  1e-180  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000015031 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  58.11 
 
 		 512 aa  632  1e-180  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1311  carboxyl transferase  60.04 
 
 		 556 aa  633  1e-180  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0791098  normal  0.306854 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1330  carboxyl transferase  60.04 
 
 		 556 aa  633  1e-180  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>