More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0718 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0326  carboxyl transferase  73.14 
 
 		 510 aa  792    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  0.0697048 
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  62.01 
 
 		 517 aa  659    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1157  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  64.69 
 
 		 508 aa  695    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.167256  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  62.01 
 
 		 530 aa  639    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  61.09 
 
 		 516 aa  649    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1705  carboxyl transferase  73.33 
 
 		 510 aa  792    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.514847  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0282  carboxyl transferase  73.14 
 
 		 510 aa  791    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0718  carboxyl transferase  100 
 
 		 510 aa  1050    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.267542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4239  carboxyl transferase  79.02 
 
 		 510 aa  857    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.540833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2771  carboxyl transferase  76.27 
 
 		 510 aa  831    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110182 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0271  carboxyl transferase  62.52 
 
 		 520 aa  653    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.435103  normal  0.1429 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0271  Propionyl-CoA carboxylase  63.51 
 
 		 519 aa  659    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.846145  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4004  carboxyl transferase  71.62 
 
 		 511 aa  768    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.680854 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0437  carboxyl transferase  59.76 
 
 		 509 aa  639    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.137321  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1401  carboxyl transferase  71.96 
 
 		 510 aa  770    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0947587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2189  propionyl-CoA carboxylase beta chain  85.49 
 
 		 510 aa  921    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124404  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  62.04 
 
 		 513 aa  667    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1521  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  61.57 
 
 		 513 aa  660    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2003  carboxyl transferase  80.78 
 
 		 510 aa  880    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2999  carboxyl transferase  73.53 
 
 		 510 aa  791    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0947  carboxyl transferase  58.9 
 
 		 513 aa  637    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.592853  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0053  carboxyl transferase  75.69 
 
 		 510 aa  796    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0250  carboxyl transferase  63.12 
 
 		 519 aa  655    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.135558  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0358  carboxyl transferase  73.14 
 
 		 510 aa  792    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1851  carboxyl transferase  73.14 
 
 		 510 aa  795    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2342  carboxyl transferase  70.98 
 
 		 510 aa  759    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.150986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0808  carboxyl transferase  73.41 
 
 		 508 aa  770    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5510  carboxyl transferase  74.9 
 
 		 510 aa  812    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3374  carboxyl transferase  85.88 
 
 		 510 aa  921    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.778087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2803  propionyl-CoA carboxylase  72.16 
 
 		 510 aa  784    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.342128  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3397  carboxyl transferase  71.18 
 
 		 510 aa  768    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2164  carboxyl transferase  72.16 
 
 		 510 aa  790    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.158421  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3122  carboxyl transferase  70.98 
 
 		 510 aa  756    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.629263  normal  0.624995 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1579  carboxyl transferase  72.55 
 
 		 523 aa  777    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0377813  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4697  carboxyl transferase  61.42 
 
 		 528 aa  645    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2348  carboxyl transferase  62.28 
 
 		 512 aa  658    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1877  propionyl-CoA carboxylase  87.25 
 
 		 510 aa  939    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2974  carboxyl transferase  61.61 
 
 		 519 aa  660    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3755  carboxyl transferase  72.94 
 
 		 510 aa  787    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0296123  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0639  carboxyl transferase  61.48 
 
 		 513 aa  652    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.629685 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1735  carboxyl transferase  72.35 
 
 		 510 aa  775    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1754  carboxyl transferase  74.51 
 
 		 510 aa  799    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.218371  normal  0.119502 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3787  Propionyl-CoA carboxylase  70.78 
 
 		 510 aa  768    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  63.02 
 
 		 520 aa  651    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0386  propionyl-CoA carboxylase  67.32 
 
 		 514 aa  722    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3484  carboxyl transferase  72.75 
 
 		 510 aa  781    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2130  carboxyl transferase  72.18 
 
 		 514 aa  781    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.955323  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3618  carboxyl transferase  71.76 
 
 		 510 aa  766    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207692  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0889  carboxyl transferase  61 
 
 		 564 aa  664    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45886  predicted protein  64.17 
 
 		 581 aa  679    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3688  carboxyl transferase  85.49 
 
 		 510 aa  919    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.618461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1880  carboxyl transferase  72.75 
 
 		 510 aa  786    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0295366 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0260  carboxyl transferase  63.71 
 
 		 519 aa  660    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4725  carboxyl transferase  73.33 
 
 		 510 aa  797    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.48705  normal  0.0648736 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5659  carboxyl transferase  74.31 
 
 		 510 aa  798    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1317  carboxyl transferase  72.16 
 
 		 510 aa  778    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.182185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1632  carboxyl transferase  62.01 
 
 		 522 aa  671    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5024  putative propionyl-CoA carboxylase beta chain  73.53 
 
 		 510 aa  786    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.541202 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0930  carboxyl transferase  67.84 
 
 		 518 aa  743    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2513  carboxyl transferase  72.35 
 
 		 510 aa  784    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152871  normal  0.332227 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2381  carboxyl transferase  71.57 
 
 		 510 aa  785    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2042  carboxyl transferase  73.14 
 
 		 510 aa  794    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0884189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2894  carboxyl transferase  74.9 
 
 		 510 aa  795    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.437903 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3401  carboxyl transferase  71.96 
 
 		 510 aa  779    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1016  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  72.16 
 
 		 510 aa  778    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0861  carboxyl transferase  85.49 
 
 		 510 aa  921    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.833574  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2082  carboxyl transferase  72.16 
 
 		 510 aa  780    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.122916  normal  0.0739179 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2835  carboxyl transferase  73.14 
 
 		 510 aa  798    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.497575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6139  carboxyl transferase  80 
 
 		 510 aa  864    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.222288 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2694  carboxyl transferase  70.98 
 
 		 510 aa  779    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2305  propionyl-CoA carboxylase  85.69 
 
 		 510 aa  922    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  59.53 
 
 		 531 aa  646    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0912  carboxyl transferase  68.43 
 
 		 510 aa  747    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3811  carboxyl transferase  75.29 
 
 		 510 aa  814    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11343  propionlyl-CoA carboxylase  62.91 
 
 		 513 aa  689    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5680  propionyl-CoA carboxylase  80.59 
 
 		 510 aa  867    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  61.95 
 
 		 531 aa  634  1e-180  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  57.59 
 
 		 514 aa  632  1e-180  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  63.32 
 
 		 516 aa  631  1e-180  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  59.81 
 
 		 537 aa  629  1e-179  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  58.48 
 
 		 518 aa  628  1e-179  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0796  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  60.41 
 
 		 518 aa  626  1e-178  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0599  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  59.21 
 
 		 510 aa  626  1e-178  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  58.37 
 
 		 516 aa  626  1e-178  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  60.23 
 
 		 529 aa  626  1e-178  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0424  carboxyl transferase  57.98 
 
 		 516 aa  627  1e-178  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_389  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  57.98 
 
 		 516 aa  622  1e-177  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.839187  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  63.47 
 
 		 516 aa  622  1e-177  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0447  acyl CoA biotin-dependant carboxyltransferase  58.37 
 
 		 516 aa  620  1e-176  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  59.65 
 
 		 522 aa  620  1e-176  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  60.76 
 
 		 551 aa  619  1e-176  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  59.45 
 
 		 516 aa  620  1e-176  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  59.84 
 
 		 524 aa  616  1e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  57.2 
 
 		 516 aa  614  1e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  59.72 
 
 		 530 aa  617  1e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1621  Propionyl-CoA carboxylase  57.78 
 
 		 513 aa  611  9.999999999999999e-175  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  59.22 
 
 		 534 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  57.48 
 
 		 516 aa  613  9.999999999999999e-175  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  58.19 
 
 		 550 aa  612  9.999999999999999e-175  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  55.45 
 
 		 531 aa  612  9.999999999999999e-175  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>