More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1593 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_0335  carboxyl transferase  72.37 
 
 
514 aa  796    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.868559  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  58.69 
 
 
516 aa  640    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0317  carboxyl transferase  72.96 
 
 
514 aa  800    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  58.45 
 
 
515 aa  640    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0999  carboxyl transferase  67.18 
 
 
527 aa  706    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3025  carboxyl transferase  71.09 
 
 
532 aa  778    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.432014 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0034  carboxyl transferase  72.76 
 
 
516 aa  776    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182676  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3083  carboxyl transferase  72.76 
 
 
516 aa  776    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0002503  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1593  carboxyl transferase  100 
 
 
514 aa  1057    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0139637  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1248  carboxyl transferase  66.02 
 
 
522 aa  719    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  58.64 
 
 
515 aa  642    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  59.14 
 
 
508 aa  625  1e-178  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  58.06 
 
 
518 aa  623  1e-177  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  57.12 
 
 
512 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  56.81 
 
 
512 aa  608  1e-173  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  57 
 
 
516 aa  607  9.999999999999999e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  56.67 
 
 
516 aa  603  1.0000000000000001e-171  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3307  propionyl-CoA carboxylase  57.65 
 
 
517 aa  597  1e-169  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448446  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  56.5 
 
 
517 aa  597  1e-169  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0553  carboxyl transferase  56.14 
 
 
518 aa  592  1e-168  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.965666  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  56.81 
 
 
514 aa  593  1e-168  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1817  Methylmalonyl-CoA carboxytransferase  58.43 
 
 
517 aa  593  1e-168  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0051  carboxyl transferase  58.04 
 
 
517 aa  586  1e-166  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.253581  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4697  carboxyl transferase  55.23 
 
 
528 aa  585  1e-166  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1316  carboxyl transferase  56.01 
 
 
514 aa  585  1e-166  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0201  carboxyl transferase  55.66 
 
 
521 aa  583  1.0000000000000001e-165  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0217258  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0291  carboxyl transferase  55.84 
 
 
519 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  55.95 
 
 
529 aa  578  1e-164  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  54.84 
 
 
531 aa  581  1e-164  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2284  carboxyl transferase  57.06 
 
 
522 aa  580  1e-164  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00152526  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  55.58 
 
 
530 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1223  carboxyl transferase  53.68 
 
 
517 aa  577  1.0000000000000001e-163  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00883657  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0307  carboxyl transferase  57.25 
 
 
516 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0386  propionyl-CoA carboxylase  54.71 
 
 
514 aa  572  1.0000000000000001e-162  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0077  carboxyl transferase  53.2 
 
 
517 aa  569  1e-161  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.371983  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0639  carboxyl transferase  54.39 
 
 
513 aa  568  1e-161  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.629685 
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  53.41 
 
 
517 aa  567  1e-160  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1705  carboxyl transferase  53.14 
 
 
510 aa  566  1e-160  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.514847  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  54.39 
 
 
527 aa  565  1e-160  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  57.52 
 
 
516 aa  567  1e-160  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0268  carboxyl transferase  53.2 
 
 
523 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  55.17 
 
 
530 aa  564  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  52.71 
 
 
531 aa  558  1e-158  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  54.78 
 
 
524 aa  560  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  53.91 
 
 
531 aa  560  1e-158  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2361  carboxyl transferase  55.75 
 
 
513 aa  559  1e-158  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000738755  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1621  Propionyl-CoA carboxylase  54.25 
 
 
513 aa  559  1e-158  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1375  propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit alpha / propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit beta  52.33 
 
 
524 aa  561  1e-158  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0140013 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0156  carboxyl transferase  56.01 
 
 
513 aa  559  1e-158  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.344953  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  57.26 
 
 
516 aa  555  1e-157  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  53.61 
 
 
527 aa  557  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  52.52 
 
 
516 aa  556  1e-157  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  54.69 
 
 
516 aa  557  1e-157  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3166  carboxyl transferase  56.13 
 
 
521 aa  557  1e-157  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0567033  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2130  carboxyl transferase  52.32 
 
 
514 aa  556  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.955323  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11343  propionlyl-CoA carboxylase  53.62 
 
 
513 aa  558  1e-157  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  55.78 
 
 
518 aa  557  1e-157  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  53.49 
 
 
516 aa  557  1e-157  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0821  carboxyl transferase  54 
 
 
536 aa  554  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588825  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  52.63 
 
 
513 aa  551  1e-156  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0947  carboxyl transferase  52.44 
 
 
513 aa  554  1e-156  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.592853  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1632  carboxyl transferase  52.05 
 
 
522 aa  553  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  56.01 
 
 
550 aa  551  1e-156  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  53.91 
 
 
551 aa  554  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2974  carboxyl transferase  52.16 
 
 
519 aa  554  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  53.88 
 
 
520 aa  553  1e-156  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0379  carboxyl transferase  53.28 
 
 
514 aa  551  1e-156  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2999  carboxyl transferase  51.57 
 
 
510 aa  549  1e-155  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2907  propionyl-CoA carboxylase  52.14 
 
 
514 aa  550  1e-155  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0250  carboxyl transferase  54.19 
 
 
519 aa  549  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.135558  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2881  carboxyl transferase  52.33 
 
 
514 aa  550  1e-155  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3484  carboxyl transferase  53.33 
 
 
510 aa  551  1e-155  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0260  carboxyl transferase  54.39 
 
 
519 aa  550  1e-155  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0271  Propionyl-CoA carboxylase  54.39 
 
 
519 aa  549  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.846145  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2513  carboxyl transferase  52.16 
 
 
510 aa  550  1e-155  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152871  normal  0.332227 
 
 
-
 
NC_002936  DET0447  acyl CoA biotin-dependant carboxyltransferase  51.74 
 
 
516 aa  545  1e-154  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  53.59 
 
 
522 aa  546  1e-154  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0271  carboxyl transferase  53.29 
 
 
520 aa  547  1e-154  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.435103  normal  0.1429 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0912  carboxyl transferase  52.75 
 
 
510 aa  548  1e-154  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2164  carboxyl transferase  53.33 
 
 
510 aa  546  1e-154  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.158421  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0424  carboxyl transferase  51.35 
 
 
516 aa  545  1e-154  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0358  carboxyl transferase  52.55 
 
 
510 aa  545  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0326  carboxyl transferase  52.55 
 
 
510 aa  544  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  0.0697048 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4004  carboxyl transferase  52.45 
 
 
511 aa  544  1e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.680854 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0282  carboxyl transferase  52.55 
 
 
510 aa  544  1e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3688  carboxyl transferase  52.56 
 
 
510 aa  542  1e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.618461  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3495  carboxyl transferase  52.51 
 
 
540 aa  541  1e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_389  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  51.74 
 
 
516 aa  545  1e-153  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.839187  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0930  carboxyl transferase  52.55 
 
 
518 aa  541  1e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2381  carboxyl transferase  52.84 
 
 
510 aa  544  1e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1016  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  53.14 
 
 
510 aa  545  1e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3755  carboxyl transferase  51.96 
 
 
510 aa  542  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0296123  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  52.77 
 
 
546 aa  540  9.999999999999999e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.35884 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1521  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  51.27 
 
 
513 aa  538  9.999999999999999e-153  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0053  carboxyl transferase  52.16 
 
 
510 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3374  carboxyl transferase  51.56 
 
 
510 aa  540  9.999999999999999e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.778087  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1851  carboxyl transferase  51.96 
 
 
510 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0489  carboxyl transferase  52.92 
 
 
520 aa  540  9.999999999999999e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  52.03 
 
 
537 aa  541  9.999999999999999e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2694  carboxyl transferase  51.47 
 
 
510 aa  538  9.999999999999999e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>