More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0335 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0335  carboxyl transferase  100 
 
 		 514 aa  1050    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.868559  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0999  carboxyl transferase  64.08 
 
 		 527 aa  686    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0317  carboxyl transferase  97.86 
 
 		 514 aa  1030    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3025  carboxyl transferase  67.19 
 
 		 532 aa  731    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.432014 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0034  carboxyl transferase  68.09 
 
 		 516 aa  729    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182676  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3083  carboxyl transferase  68.09 
 
 		 516 aa  729    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0002503  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1593  carboxyl transferase  72.37 
 
 		 514 aa  796    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0139637  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1248  carboxyl transferase  66.99 
 
 		 522 aa  721    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  57.92 
 
 		 516 aa  631  1e-180  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  57.7 
 
 		 518 aa  622  1e-177  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  57.09 
 
 		 515 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  57.96 
 
 		 508 aa  614  9.999999999999999e-175  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  57.48 
 
 		 515 aa  614  9.999999999999999e-175  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  57 
 
 		 512 aa  604  1.0000000000000001e-171  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  56.92 
 
 		 512 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  56.59 
 
 		 516 aa  604  1.0000000000000001e-171  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  56.31 
 
 		 514 aa  597  1e-169  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  55.86 
 
 		 516 aa  595  1e-169  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1316  carboxyl transferase  57.89 
 
 		 514 aa  592  1e-168  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3307  propionyl-CoA carboxylase  57.45 
 
 		 517 aa  591  1e-167  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  55.84 
 
 		 517 aa  590  1e-167  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0051  carboxyl transferase  57.64 
 
 		 517 aa  580  1e-164  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.253581  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1817  Methylmalonyl-CoA carboxytransferase  56.53 
 
 		 517 aa  581  1e-164  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0553  carboxyl transferase  54.21 
 
 		 518 aa  578  1.0000000000000001e-163  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.965666  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2284  carboxyl transferase  55.95 
 
 		 522 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00152526  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0386  propionyl-CoA carboxylase  54.47 
 
 		 514 aa  577  1.0000000000000001e-163  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0077  carboxyl transferase  53.98 
 
 		 517 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.371983  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0291  carboxyl transferase  54.47 
 
 		 519 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0201  carboxyl transferase  54.51 
 
 		 521 aa  572  1.0000000000000001e-162  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0217258  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  55.58 
 
 		 530 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  56.71 
 
 		 531 aa  563  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  53.29 
 
 		 531 aa  562  1.0000000000000001e-159  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4697  carboxyl transferase  53.29 
 
 		 528 aa  563  1.0000000000000001e-159  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0307  carboxyl transferase  55.75 
 
 		 516 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  52.73 
 
 		 517 aa  560  1e-158  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  56.91 
 
 		 516 aa  559  1e-158  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3755  carboxyl transferase  53.29 
 
 		 510 aa  559  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0296123  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  53.1 
 
 		 516 aa  561  1e-158  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3484  carboxyl transferase  53.1 
 
 		 510 aa  560  1e-158  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1223  carboxyl transferase  52.33 
 
 		 517 aa  560  1e-158  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00883657  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2974  carboxyl transferase  54.3 
 
 		 519 aa  555  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  52.61 
 
 		 531 aa  556  1e-157  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0053  carboxyl transferase  53.11 
 
 		 510 aa  555  1e-157  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2130  carboxyl transferase  53.08 
 
 		 514 aa  557  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.955323  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  54.1 
 
 		 516 aa  557  1e-157  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0268  carboxyl transferase  53.14 
 
 		 523 aa  555  1e-156  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4004  carboxyl transferase  52.8 
 
 		 511 aa  553  1e-156  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.680854 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0912  carboxyl transferase  52.92 
 
 		 510 aa  553  1e-156  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  54.56 
 
 		 522 aa  554  1e-156  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  55.66 
 
 		 551 aa  553  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2164  carboxyl transferase  53.38 
 
 		 510 aa  554  1e-156  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.158421  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  54 
 
 		 529 aa  551  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  55.34 
 
 		 524 aa  554  1e-156  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2694  carboxyl transferase  53.05 
 
 		 510 aa  552  1e-156  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  51.94 
 
 		 516 aa  552  1e-156  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2513  carboxyl transferase  52.91 
 
 		 510 aa  552  1e-156  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152871  normal  0.332227 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  54 
 
 		 527 aa  551  1e-156  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1621  Propionyl-CoA carboxylase  53.47 
 
 		 513 aa  551  1e-155  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1375  propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit alpha / propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit beta  52.83 
 
 		 524 aa  549  1e-155  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0140013 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2803  propionyl-CoA carboxylase  53.53 
 
 		 510 aa  551  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.342128  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2381  carboxyl transferase  52.72 
 
 		 510 aa  550  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2042  carboxyl transferase  52.71 
 
 		 510 aa  550  1e-155  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0884189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1851  carboxyl transferase  52.52 
 
 		 510 aa  549  1e-155  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  52.91 
 
 		 513 aa  545  1e-154  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1632  carboxyl transferase  52.75 
 
 		 522 aa  548  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0156  carboxyl transferase  55.53 
 
 		 513 aa  545  1e-154  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.344953  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2361  carboxyl transferase  54.37 
 
 		 513 aa  545  1e-154  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000738755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0639  carboxyl transferase  52.83 
 
 		 513 aa  545  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.629685 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0930  carboxyl transferase  52.33 
 
 		 518 aa  546  1e-154  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1016  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  52.93 
 
 		 510 aa  547  1e-154  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  53.41 
 
 		 527 aa  547  1e-154  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0271  carboxyl transferase  54.44 
 
 		 520 aa  542  1e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.435103  normal  0.1429 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0947  carboxyl transferase  53.41 
 
 		 513 aa  544  1e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.592853  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0808  carboxyl transferase  52.64 
 
 		 508 aa  541  1e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0379  carboxyl transferase  52.34 
 
 		 514 aa  541  1e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2894  carboxyl transferase  52.16 
 
 		 510 aa  542  1e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.437903 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  56.85 
 
 		 516 aa  544  1e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11343  propionlyl-CoA carboxylase  52.16 
 
 		 513 aa  539  9.999999999999999e-153  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  54.42 
 
 		 518 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  55.6 
 
 		 550 aa  540  9.999999999999999e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  52.82 
 
 		 520 aa  541  9.999999999999999e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3166  carboxyl transferase  54.17 
 
 		 521 aa  537  1e-151  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0567033  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0250  carboxyl transferase  53.73 
 
 		 519 aa  538  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.135558  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  52.42 
 
 		 537 aa  537  1e-151  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0489  carboxyl transferase  52.33 
 
 		 520 aa  535  1e-151  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0889  carboxyl transferase  51.64 
 
 		 564 aa  536  1e-151  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0271  Propionyl-CoA carboxylase  53.65 
 
 		 519 aa  537  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.846145  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0260  carboxyl transferase  53.65 
 
 		 519 aa  537  1e-151  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0282  carboxyl transferase  51.17 
 
 		 510 aa  533  1e-150  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1705  carboxyl transferase  51.95 
 
 		 510 aa  533  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.514847  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2835  carboxyl transferase  50.97 
 
 		 510 aa  533  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.497575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1521  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  52.66 
 
 		 513 aa  531  1e-150  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2999  carboxyl transferase  51.16 
 
 		 510 aa  533  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  53.02 
 
 		 530 aa  534  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0358  carboxyl transferase  51.36 
 
 		 510 aa  534  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0326  carboxyl transferase  51.17 
 
 		 510 aa  534  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  0.0697048 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3401  carboxyl transferase  52.65 
 
 		 510 aa  534  1e-150  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0447  acyl CoA biotin-dependant carboxyltransferase  50.97 
 
 		 516 aa  529  1e-149  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3374  carboxyl transferase  51.37 
 
 		 510 aa  529  1e-149  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.778087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1877  propionyl-CoA carboxylase  50.58 
 
 		 510 aa  530  1e-149  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>