More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0156 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  62.28 
 
 
508 aa  652    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0156  carboxyl transferase  100 
 
 
513 aa  1040    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.344953  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1316  carboxyl transferase  61.28 
 
 
514 aa  632  1e-180  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  59.81 
 
 
515 aa  622  1e-177  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  59.81 
 
 
515 aa  622  1e-177  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  58.75 
 
 
514 aa  619  1e-176  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  57.91 
 
 
518 aa  615  1e-175  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  58.53 
 
 
516 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  58.14 
 
 
512 aa  608  1e-173  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  59.68 
 
 
512 aa  610  1e-173  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  59.84 
 
 
516 aa  605  9.999999999999999e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0077  carboxyl transferase  56.03 
 
 
517 aa  600  1e-170  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.371983  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  55.75 
 
 
516 aa  593  1e-168  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  56.37 
 
 
516 aa  592  1e-168  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1621  Propionyl-CoA carboxylase  58.01 
 
 
513 aa  591  1e-168  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  57.89 
 
 
520 aa  588  1e-167  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  55.73 
 
 
517 aa  585  1e-166  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  56.14 
 
 
517 aa  585  1e-166  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  57.46 
 
 
550 aa  585  1e-166  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  59.56 
 
 
516 aa  584  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  57.52 
 
 
522 aa  584  1.0000000000000001e-165  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0268  carboxyl transferase  56.53 
 
 
523 aa  580  1e-164  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0291  carboxyl transferase  56.39 
 
 
519 aa  580  1e-164  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0999  carboxyl transferase  57.5 
 
 
527 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2284  carboxyl transferase  57.36 
 
 
522 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00152526  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1375  propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit alpha / propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit beta  53.38 
 
 
524 aa  577  1.0000000000000001e-163  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0140013 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  58.54 
 
 
530 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  57.35 
 
 
531 aa  572  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4697  carboxyl transferase  57.06 
 
 
528 aa  572  1.0000000000000001e-162  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  55.45 
 
 
531 aa  574  1.0000000000000001e-162  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  56.71 
 
 
513 aa  570  1e-161  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  55.06 
 
 
516 aa  568  1e-161  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  57.35 
 
 
551 aa  567  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1521  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  57.32 
 
 
513 aa  566  1e-160  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  54.84 
 
 
516 aa  567  1e-160  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1223  carboxyl transferase  52.72 
 
 
517 aa  566  1e-160  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00883657  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0947  carboxyl transferase  56.1 
 
 
513 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.592853  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  56.86 
 
 
529 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0553  carboxyl transferase  56.25 
 
 
518 aa  561  1.0000000000000001e-159  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.965666  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2881  carboxyl transferase  53.71 
 
 
514 aa  558  1e-158  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2907  propionyl-CoA carboxylase  53.98 
 
 
514 aa  561  1e-158  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  55.38 
 
 
534 aa  561  1e-158  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3025  carboxyl transferase  54.95 
 
 
532 aa  558  1e-158  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.432014 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0386  propionyl-CoA carboxylase  56.03 
 
 
514 aa  561  1e-158  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1593  carboxyl transferase  56.01 
 
 
514 aa  559  1e-158  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0139637  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0379  carboxyl transferase  57.14 
 
 
514 aa  560  1e-158  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2513  carboxyl transferase  54.93 
 
 
510 aa  558  1e-158  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152871  normal  0.332227 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  53.89 
 
 
516 aa  558  1e-157  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  57 
 
 
527 aa  556  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4004  carboxyl transferase  55.92 
 
 
511 aa  555  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.680854 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4364  carboxyl transferase  56.01 
 
 
541 aa  555  1e-157  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2130  carboxyl transferase  54.89 
 
 
514 aa  555  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.955323  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2164  carboxyl transferase  56.65 
 
 
510 aa  555  1e-157  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.158421  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0307  carboxyl transferase  56.89 
 
 
516 aa  557  1e-157  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  55.88 
 
 
530 aa  556  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1248  carboxyl transferase  53.61 
 
 
522 aa  557  1e-157  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0821  carboxyl transferase  56.02 
 
 
536 aa  557  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588825  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6390  carboxyl transferase  56.44 
 
 
543 aa  553  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0531526  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0250  carboxyl transferase  56.85 
 
 
519 aa  553  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.135558  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0271  Propionyl-CoA carboxylase  56.65 
 
 
519 aa  551  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.846145  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3484  carboxyl transferase  56.03 
 
 
510 aa  555  1e-156  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  56.39 
 
 
527 aa  554  1e-156  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0260  carboxyl transferase  56.65 
 
 
519 aa  553  1e-156  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2381  carboxyl transferase  56.24 
 
 
510 aa  554  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2042  carboxyl transferase  54.46 
 
 
510 aa  553  1e-156  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0884189  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3401  carboxyl transferase  55.83 
 
 
510 aa  553  1e-156  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  55.58 
 
 
524 aa  553  1e-156  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1851  carboxyl transferase  54.46 
 
 
510 aa  552  1e-156  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2803  propionyl-CoA carboxylase  55.62 
 
 
510 aa  550  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.342128  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  52.72 
 
 
531 aa  550  1e-155  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  54.64 
 
 
518 aa  551  1e-155  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1041  carboxyl transferase  55.53 
 
 
542 aa  550  1e-155  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2361  carboxyl transferase  54.65 
 
 
513 aa  550  1e-155  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000738755  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11343  propionlyl-CoA carboxylase  55.96 
 
 
513 aa  549  1e-155  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0051  carboxyl transferase  53.83 
 
 
517 aa  546  1e-154  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.253581  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  55.44 
 
 
536 aa  548  1e-154  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  54.56 
 
 
546 aa  546  1e-154  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.35884 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0272  carboxyl transferase  51.83 
 
 
515 aa  546  1e-154  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00889461 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3755  carboxyl transferase  55.42 
 
 
510 aa  545  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0296123  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2694  carboxyl transferase  55.21 
 
 
510 aa  545  1e-154  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0335  carboxyl transferase  55.53 
 
 
514 aa  545  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.868559  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1016  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  56.24 
 
 
510 aa  548  1e-154  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0912  carboxyl transferase  55.42 
 
 
510 aa  547  1e-154  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1157  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  55.15 
 
 
508 aa  542  1e-153  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.167256  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2999  carboxyl transferase  55.21 
 
 
510 aa  542  1e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0930  carboxyl transferase  54.81 
 
 
518 aa  542  1e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3092  carboxyl transferase  56.65 
 
 
516 aa  544  1e-153  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.391297  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0053  carboxyl transferase  55.92 
 
 
510 aa  544  1e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0271  carboxyl transferase  54.44 
 
 
520 aa  541  1e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.435103  normal  0.1429 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0889  carboxyl transferase  54.88 
 
 
564 aa  543  1e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0317  carboxyl transferase  55.12 
 
 
514 aa  542  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  53.27 
 
 
537 aa  542  1e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1877  propionyl-CoA carboxylase  56.03 
 
 
510 aa  542  1e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1152  carboxyl transferase  55.82 
 
 
529 aa  543  1e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579492  normal  0.513821 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2003  carboxyl transferase  53.19 
 
 
510 aa  540  9.999999999999999e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0034  carboxyl transferase  55.6 
 
 
516 aa  540  9.999999999999999e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182676  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3083  carboxyl transferase  55.6 
 
 
516 aa  540  9.999999999999999e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0002503  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3166  carboxyl transferase  53.66 
 
 
521 aa  539  9.999999999999999e-153  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0567033  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_002936  DET0447  acyl CoA biotin-dependant carboxyltransferase  52.35 
 
 
516 aa  535  1e-151  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_389  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  52.56 
 
 
516 aa  537  1e-151  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.839187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>