More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6502 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3541  carboxyl transferase  68.99 
 
 		 514 aa  686    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1215  methylmalonyl-CoA decarboxylase alpha chain  67.15 
 
 		 519 aa  667    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.336846  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2771  carboxyl transferase  66.21 
 
 		 549 aa  697    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.145735  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6937  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  65.37 
 
 		 559 aa  658    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6502  carboxyl transferase  100 
 
 		 529 aa  1065    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838117  normal  0.279453 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  61.07 
 
 		 518 aa  611  1e-173  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  57.99 
 
 		 550 aa  594  1e-168  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  54.3 
 
 		 516 aa  576  1.0000000000000001e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  56.15 
 
 		 516 aa  569  1e-161  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  55.01 
 
 		 516 aa  571  1e-161  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  52.95 
 
 		 516 aa  569  1e-161  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  53.48 
 
 		 518 aa  568  1e-160  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1621  Propionyl-CoA carboxylase  55.17 
 
 		 513 aa  565  1e-160  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  52.25 
 
 		 516 aa  566  1e-160  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2284  carboxyl transferase  52.52 
 
 		 522 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00152526  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  55.12 
 
 		 522 aa  564  1.0000000000000001e-159  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0447  acyl CoA biotin-dependant carboxyltransferase  51.69 
 
 		 516 aa  559  1e-158  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_389  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  51.69 
 
 		 516 aa  561  1e-158  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.839187  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  51.44 
 
 		 531 aa  561  1e-158  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0424  carboxyl transferase  51.09 
 
 		 516 aa  558  1e-158  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  55.78 
 
 		 529 aa  555  1e-157  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  51.94 
 
 		 531 aa  553  1e-156  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  50 
 
 		 514 aa  550  1e-155  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  53.02 
 
 		 516 aa  548  1e-155  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0307  carboxyl transferase  52.71 
 
 		 516 aa  550  1e-155  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  51.29 
 
 		 516 aa  551  1e-155  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  56.35 
 
 		 516 aa  547  1e-154  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  53.79 
 
 		 517 aa  548  1e-154  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0250  carboxyl transferase  55.19 
 
 		 519 aa  546  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.135558  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  55.33 
 
 		 530 aa  548  1e-154  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0260  carboxyl transferase  55.19 
 
 		 519 aa  545  1e-154  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0271  Propionyl-CoA carboxylase  55.19 
 
 		 519 aa  545  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.846145  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  55.71 
 
 		 530 aa  542  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  54.13 
 
 		 534 aa  543  1e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0268  carboxyl transferase  50.61 
 
 		 523 aa  541  9.999999999999999e-153  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  53.28 
 
 		 517 aa  541  9.999999999999999e-153  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  52.61 
 
 		 537 aa  540  9.999999999999999e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2974  carboxyl transferase  51.06 
 
 		 519 aa  538  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0291  carboxyl transferase  53.68 
 
 		 519 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  55.1 
 
 		 524 aa  540  9.999999999999999e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0271  carboxyl transferase  54.4 
 
 		 520 aa  539  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.435103  normal  0.1429 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1632  carboxyl transferase  51.27 
 
 		 522 aa  540  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  51.78 
 
 		 508 aa  536  1e-151  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  55.08 
 
 		 536 aa  534  1e-150  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  53.77 
 
 		 520 aa  533  1e-150  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  54.67 
 
 		 527 aa  534  1e-150  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3495  carboxyl transferase  52.63 
 
 		 540 aa  533  1e-150  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1375  propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit alpha / propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit beta  48.64 
 
 		 524 aa  534  1e-150  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0140013 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  50.96 
 
 		 531 aa  530  1e-149  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  50.39 
 
 		 515 aa  530  1e-149  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  54.18 
 
 		 527 aa  531  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2003  carboxyl transferase  50.4 
 
 		 510 aa  527  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  49.81 
 
 		 515 aa  528  1e-148  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4697  carboxyl transferase  50.41 
 
 		 528 aa  526  1e-148  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  50.2 
 
 		 512 aa  527  1e-148  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3092  carboxyl transferase  53.28 
 
 		 516 aa  526  1e-148  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.391297  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  53.6 
 
 		 546 aa  526  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.35884 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3688  carboxyl transferase  50.4 
 
 		 510 aa  526  1e-148  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.618461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0639  carboxyl transferase  51.02 
 
 		 513 aa  526  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.629685 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1316  carboxyl transferase  50.19 
 
 		 514 aa  526  1e-148  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11343  propionlyl-CoA carboxylase  49.71 
 
 		 513 aa  528  1e-148  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1521  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  51.28 
 
 		 513 aa  523  1e-147  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1041  carboxyl transferase  54.86 
 
 		 542 aa  524  1e-147  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1877  propionyl-CoA carboxylase  50.2 
 
 		 510 aa  524  1e-147  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0386  propionyl-CoA carboxylase  50.4 
 
 		 514 aa  522  1e-147  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3484  carboxyl transferase  50.69 
 
 		 510 aa  523  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0821  carboxyl transferase  53.06 
 
 		 536 aa  524  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588825  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21120  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  53.04 
 
 		 529 aa  520  1e-146  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0918457  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4004  carboxyl transferase  50 
 
 		 511 aa  520  1e-146  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.680854 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0272  carboxyl transferase  47.63 
 
 		 515 aa  519  1e-146  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00889461 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2999  carboxyl transferase  51.19 
 
 		 510 aa  519  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1579  carboxyl transferase  51.39 
 
 		 523 aa  521  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0377813  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2305  propionyl-CoA carboxylase  50.2 
 
 		 510 aa  518  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1223  carboxyl transferase  49.03 
 
 		 517 aa  519  1e-146  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00883657  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0156  carboxyl transferase  51.94 
 
 		 513 aa  520  1e-146  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.344953  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1043  carboxyl transferase  49.64 
 
 		 549 aa  516  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.282671  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1401  carboxyl transferase  51.18 
 
 		 510 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0947587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2189  propionyl-CoA carboxylase beta chain  50.4 
 
 		 510 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124404  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  51.12 
 
 		 513 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4725  carboxyl transferase  51.58 
 
 		 510 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.48705  normal  0.0648736 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0850  carboxyl transferase  52.15 
 
 		 526 aa  516  1.0000000000000001e-145  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000103034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1021  carboxyl transferase  51.02 
 
 		 531 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3397  carboxyl transferase  51.19 
 
 		 510 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4230  carboxyl transferase  51.76 
 
 		 552 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551859  normal  0.395293 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6139  carboxyl transferase  50.59 
 
 		 510 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.222288 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0489  carboxyl transferase  49.41 
 
 		 520 aa  518  1.0000000000000001e-145  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2907  propionyl-CoA carboxylase  51.13 
 
 		 514 aa  516  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0861  carboxyl transferase  50.4 
 
 		 510 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.833574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1325  carboxyl transferase  51.37 
 
 		 527 aa  515  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000015031 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1152  carboxyl transferase  54.05 
 
 		 529 aa  515  1.0000000000000001e-145  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579492  normal  0.513821 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2881  carboxyl transferase  50.72 
 
 		 514 aa  512  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  51.53 
 
 		 551 aa  512  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1705  carboxyl transferase  49.41 
 
 		 510 aa  513  1e-144  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.514847  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5510  carboxyl transferase  50 
 
 		 510 aa  512  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5680  propionyl-CoA carboxylase  50.2 
 
 		 510 aa  513  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4364  carboxyl transferase  52.92 
 
 		 541 aa  514  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  50.2 
 
 		 512 aa  513  1e-144  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2771  carboxyl transferase  50.88 
 
 		 510 aa  513  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110182 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25440  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  52.46 
 
 		 532 aa  513  1e-144  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199435  normal  0.360386 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5024  putative propionyl-CoA carboxylase beta chain  51.19 
 
 		 510 aa  514  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.541202 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>