More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2771 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2771  carboxyl transferase  100 
 
 
549 aa  1112    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.145735  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1215  methylmalonyl-CoA decarboxylase alpha chain  68.11 
 
 
519 aa  699    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.336846  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6502  carboxyl transferase  68.65 
 
 
529 aa  694    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838117  normal  0.279453 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3541  carboxyl transferase  72.41 
 
 
514 aa  751    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6937  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  65.31 
 
 
559 aa  674    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100753  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  62.02 
 
 
518 aa  642    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  56.16 
 
 
516 aa  616  1e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  56.77 
 
 
516 aa  605  9.999999999999999e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  57.59 
 
 
550 aa  600  1e-170  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  54.37 
 
 
518 aa  592  1e-168  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2284  carboxyl transferase  57.61 
 
 
522 aa  590  1e-167  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00152526  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  53.99 
 
 
531 aa  586  1e-166  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  55.4 
 
 
516 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  54.67 
 
 
531 aa  584  1.0000000000000001e-165  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  54.07 
 
 
522 aa  579  1e-164  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  55.15 
 
 
515 aa  579  1e-164  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  57 
 
 
516 aa  578  1e-164  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  54.23 
 
 
516 aa  576  1.0000000000000001e-163  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  54.76 
 
 
515 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  55.42 
 
 
508 aa  575  1.0000000000000001e-163  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  57.4 
 
 
516 aa  577  1.0000000000000001e-163  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0447  acyl CoA biotin-dependant carboxyltransferase  52.72 
 
 
516 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_389  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  52.8 
 
 
516 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.839187  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  52.82 
 
 
516 aa  573  1.0000000000000001e-162  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  54.42 
 
 
512 aa  570  1e-161  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0424  carboxyl transferase  52.42 
 
 
516 aa  568  1e-161  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0307  carboxyl transferase  57.4 
 
 
516 aa  571  1e-161  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  54.79 
 
 
517 aa  566  1e-160  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  55.81 
 
 
517 aa  567  1e-160  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0250  carboxyl transferase  56.41 
 
 
519 aa  566  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.135558  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4697  carboxyl transferase  53.79 
 
 
528 aa  566  1e-160  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  57.2 
 
 
516 aa  565  1e-160  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  52.92 
 
 
514 aa  568  1e-160  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0271  Propionyl-CoA carboxylase  56.02 
 
 
519 aa  562  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.846145  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0260  carboxyl transferase  56.21 
 
 
519 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  54.56 
 
 
512 aa  560  1e-158  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  54.3 
 
 
531 aa  561  1e-158  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  54.26 
 
 
551 aa  558  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1621  Propionyl-CoA carboxylase  54.56 
 
 
513 aa  558  1e-157  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3166  carboxyl transferase  54.36 
 
 
521 aa  558  1e-157  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0567033  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0271  carboxyl transferase  55.03 
 
 
520 aa  556  1e-157  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.435103  normal  0.1429 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1223  carboxyl transferase  52.77 
 
 
517 aa  553  1e-156  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00883657  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0077  carboxyl transferase  52.82 
 
 
517 aa  549  1e-155  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.371983  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  53.26 
 
 
534 aa  549  1e-155  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  54.73 
 
 
530 aa  549  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  53.65 
 
 
530 aa  550  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  52.82 
 
 
529 aa  549  1e-155  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1632  carboxyl transferase  52.54 
 
 
522 aa  550  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1375  propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit alpha / propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit beta  49.71 
 
 
524 aa  548  1e-154  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0140013 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0950  carboxyl transferase  54.79 
 
 
514 aa  545  1e-154  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.216274 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3092  carboxyl transferase  55.17 
 
 
516 aa  547  1e-154  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.391297  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  52.88 
 
 
524 aa  546  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0386  propionyl-CoA carboxylase  50.96 
 
 
514 aa  547  1e-154  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1316  carboxyl transferase  52.53 
 
 
514 aa  548  1e-154  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3495  carboxyl transferase  53.42 
 
 
540 aa  546  1e-154  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0821  carboxyl transferase  53.52 
 
 
536 aa  546  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588825  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  53.93 
 
 
527 aa  546  1e-154  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0268  carboxyl transferase  50.2 
 
 
523 aa  543  1e-153  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  52.42 
 
 
537 aa  543  1e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11343  propionlyl-CoA carboxylase  52.86 
 
 
513 aa  542  1e-153  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  53.74 
 
 
527 aa  543  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2974  carboxyl transferase  52.15 
 
 
519 aa  539  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0272  carboxyl transferase  49.8 
 
 
515 aa  541  9.999999999999999e-153  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00889461 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0489  carboxyl transferase  52.66 
 
 
520 aa  539  9.999999999999999e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2361  carboxyl transferase  52.4 
 
 
513 aa  541  9.999999999999999e-153  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000738755  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0553  carboxyl transferase  52.02 
 
 
518 aa  536  1e-151  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.965666  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  53.86 
 
 
520 aa  536  1e-151  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3811  carboxyl transferase  52.46 
 
 
510 aa  535  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0291  carboxyl transferase  52.26 
 
 
519 aa  535  1e-151  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1325  carboxyl transferase  53.91 
 
 
527 aa  536  1e-151  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000015031 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3755  carboxyl transferase  53.28 
 
 
510 aa  536  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0296123  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2999  carboxyl transferase  51.87 
 
 
510 aa  532  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3695  carboxyl transferase  53.08 
 
 
538 aa  534  1e-150  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0411544 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0326  carboxyl transferase  51.47 
 
 
510 aa  531  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  0.0697048 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4725  carboxyl transferase  53.07 
 
 
510 aa  533  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.48705  normal  0.0648736 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  53.23 
 
 
536 aa  534  1e-150  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1157  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  49.61 
 
 
508 aa  530  1e-149  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.167256  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1705  carboxyl transferase  51.28 
 
 
510 aa  530  1e-149  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.514847  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0282  carboxyl transferase  51.28 
 
 
510 aa  530  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1840  carboxyl transferase  53.57 
 
 
542 aa  528  1e-149  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1579  carboxyl transferase  51.08 
 
 
523 aa  529  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0377813  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0358  carboxyl transferase  51.28 
 
 
510 aa  531  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1281  carboxyl transferase  53.71 
 
 
527 aa  530  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  54.62 
 
 
527 aa  530  1e-149  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5024  putative propionyl-CoA carboxylase beta chain  52.87 
 
 
510 aa  531  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.541202 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1248  carboxyl transferase  52.02 
 
 
522 aa  529  1e-149  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2513  carboxyl transferase  50.88 
 
 
510 aa  531  1e-149  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152871  normal  0.332227 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1152  carboxyl transferase  54.14 
 
 
529 aa  528  1e-148  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579492  normal  0.513821 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  52.55 
 
 
513 aa  528  1e-148  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5510  carboxyl transferase  49.9 
 
 
510 aa  527  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4364  carboxyl transferase  50.92 
 
 
541 aa  526  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1877  propionyl-CoA carboxylase  51.23 
 
 
510 aa  528  1e-148  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1851  carboxyl transferase  52.46 
 
 
510 aa  525  1e-148  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3688  carboxyl transferase  51.43 
 
 
510 aa  525  1e-148  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.618461  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2835  carboxyl transferase  52.25 
 
 
510 aa  528  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.497575  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2042  carboxyl transferase  52.66 
 
 
510 aa  527  1e-148  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0884189  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3401  carboxyl transferase  50.86 
 
 
510 aa  525  1e-148  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0850  carboxyl transferase  54.82 
 
 
526 aa  528  1e-148  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000103034  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2003  carboxyl transferase  51.02 
 
 
510 aa  525  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5659  carboxyl transferase  51.84 
 
 
510 aa  527  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>