More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6937 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  64.99 
 
 
518 aa  674    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1215  methylmalonyl-CoA decarboxylase alpha chain  66.73 
 
 
519 aa  696    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.336846  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2771  carboxyl transferase  64.24 
 
 
549 aa  677    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.145735  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6937  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  100 
 
 
559 aa  1137    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100753  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6502  carboxyl transferase  63.91 
 
 
529 aa  662    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838117  normal  0.279453 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3541  carboxyl transferase  67.99 
 
 
514 aa  701    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  59.45 
 
 
522 aa  629  1e-179  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  59.08 
 
 
550 aa  630  1e-179  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  57.77 
 
 
530 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  58.01 
 
 
529 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  56.27 
 
 
531 aa  605  9.999999999999999e-173  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1621  Propionyl-CoA carboxylase  58.82 
 
 
513 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  56.33 
 
 
531 aa  602  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  59.43 
 
 
516 aa  599  1e-170  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  56.33 
 
 
551 aa  598  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  59.05 
 
 
517 aa  601  1e-170  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  56.97 
 
 
516 aa  599  1e-170  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  53.97 
 
 
516 aa  598  1e-170  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  58.59 
 
 
527 aa  599  1e-170  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  58.09 
 
 
527 aa  595  1e-169  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  53.97 
 
 
516 aa  595  1e-169  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  57.06 
 
 
530 aa  597  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  58.52 
 
 
524 aa  593  1e-168  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  60.04 
 
 
516 aa  594  1e-168  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  56.75 
 
 
516 aa  593  1e-168  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  56.69 
 
 
534 aa  591  1e-167  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1632  carboxyl transferase  56.09 
 
 
522 aa  590  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2284  carboxyl transferase  54.31 
 
 
522 aa  587  1e-166  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00152526  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  52.92 
 
 
518 aa  588  1e-166  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3495  carboxyl transferase  55.95 
 
 
540 aa  585  1e-166  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  55.97 
 
 
546 aa  588  1e-166  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.35884 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  54.51 
 
 
531 aa  586  1e-166  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  56.42 
 
 
536 aa  581  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0250  carboxyl transferase  59.48 
 
 
519 aa  581  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.135558  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  57.59 
 
 
520 aa  583  1.0000000000000001e-165  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0307  carboxyl transferase  55.1 
 
 
516 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  54.62 
 
 
516 aa  583  1.0000000000000001e-165  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  55.26 
 
 
537 aa  584  1.0000000000000001e-165  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3688  carboxyl transferase  54.4 
 
 
510 aa  583  1.0000000000000001e-165  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.618461  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3484  carboxyl transferase  56.27 
 
 
510 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11343  propionlyl-CoA carboxylase  55.45 
 
 
513 aa  582  1.0000000000000001e-165  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  55.9 
 
 
517 aa  581  1e-164  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0271  carboxyl transferase  56.11 
 
 
520 aa  581  1e-164  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.435103  normal  0.1429 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0271  Propionyl-CoA carboxylase  59.48 
 
 
519 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.846145  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0386  propionyl-CoA carboxylase  55.25 
 
 
514 aa  580  1e-164  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0260  carboxyl transferase  59.48 
 
 
519 aa  581  1e-164  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1316  carboxyl transferase  54.9 
 
 
514 aa  580  1e-164  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2513  carboxyl transferase  56.03 
 
 
510 aa  579  1e-164  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152871  normal  0.332227 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3092  carboxyl transferase  56.45 
 
 
516 aa  576  1.0000000000000001e-163  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.391297  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2974  carboxyl transferase  55.09 
 
 
519 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  55.53 
 
 
516 aa  577  1.0000000000000001e-163  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4230  carboxyl transferase  54.18 
 
 
552 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551859  normal  0.395293 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4004  carboxyl transferase  55.47 
 
 
511 aa  574  1.0000000000000001e-162  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.680854 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2305  propionyl-CoA carboxylase  54.4 
 
 
510 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1877  propionyl-CoA carboxylase  54.01 
 
 
510 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2003  carboxyl transferase  54.47 
 
 
510 aa  574  1.0000000000000001e-162  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0821  carboxyl transferase  54.56 
 
 
536 aa  573  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588825  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1851  carboxyl transferase  55.06 
 
 
510 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2381  carboxyl transferase  54.86 
 
 
510 aa  572  1.0000000000000001e-162  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2042  carboxyl transferase  55.45 
 
 
510 aa  574  1.0000000000000001e-162  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0884189  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1157  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  51.74 
 
 
508 aa  571  1e-161  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.167256  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  54.6 
 
 
508 aa  570  1e-161  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1705  carboxyl transferase  54.86 
 
 
510 aa  570  1e-161  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.514847  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2771  carboxyl transferase  54.79 
 
 
510 aa  571  1e-161  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.110182 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  53.33 
 
 
514 aa  570  1e-161  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2164  carboxyl transferase  54.86 
 
 
510 aa  571  1e-161  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.158421  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2348  carboxyl transferase  53.41 
 
 
512 aa  569  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2130  carboxyl transferase  54.83 
 
 
514 aa  568  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.955323  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3755  carboxyl transferase  54.86 
 
 
510 aa  569  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0296123  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2694  carboxyl transferase  53.82 
 
 
510 aa  571  1e-161  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3401  carboxyl transferase  55.36 
 
 
510 aa  570  1e-161  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5024  putative propionyl-CoA carboxylase beta chain  55.42 
 
 
510 aa  568  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.541202 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4364  carboxyl transferase  55.81 
 
 
541 aa  567  1e-160  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5680  propionyl-CoA carboxylase  54.3 
 
 
510 aa  566  1e-160  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2999  carboxyl transferase  55.64 
 
 
510 aa  568  1e-160  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2189  propionyl-CoA carboxylase beta chain  53.82 
 
 
510 aa  567  1e-160  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124404  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  53.63 
 
 
515 aa  565  1e-160  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2803  propionyl-CoA carboxylase  54.86 
 
 
510 aa  567  1e-160  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.342128  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4697  carboxyl transferase  52.88 
 
 
528 aa  566  1e-160  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21120  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  55.41 
 
 
529 aa  567  1e-160  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0918457  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6139  carboxyl transferase  54.17 
 
 
510 aa  566  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.222288 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0861  carboxyl transferase  53.82 
 
 
510 aa  567  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.833574  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0447  acyl CoA biotin-dependant carboxyltransferase  51.84 
 
 
516 aa  564  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5510  carboxyl transferase  54.4 
 
 
510 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0053  carboxyl transferase  54.82 
 
 
510 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3811  carboxyl transferase  54.79 
 
 
510 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_389  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  51.64 
 
 
516 aa  564  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.839187  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2082  carboxyl transferase  54.09 
 
 
510 aa  561  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.122916  normal  0.0739179 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1521  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  53.58 
 
 
513 aa  560  1e-158  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1880  carboxyl transferase  53.89 
 
 
510 aa  560  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0295366 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0291  carboxyl transferase  53.77 
 
 
519 aa  559  1e-158  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1579  carboxyl transferase  54.42 
 
 
523 aa  558  1e-158  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0377813  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  53.05 
 
 
515 aa  561  1e-158  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0282  carboxyl transferase  53.23 
 
 
510 aa  558  1e-158  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0326  carboxyl transferase  53.42 
 
 
510 aa  560  1e-158  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  0.0697048 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0358  carboxyl transferase  53.62 
 
 
510 aa  560  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0424  carboxyl transferase  50.87 
 
 
516 aa  560  1e-158  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2835  carboxyl transferase  53.23 
 
 
510 aa  561  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.497575  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5659  carboxyl transferase  55.06 
 
 
510 aa  560  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0850  carboxyl transferase  55.21 
 
 
526 aa  555  1e-157  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000103034  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>