More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1021 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0821  carboxyl transferase  68.32 
 
 		 536 aa  719    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588825  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  63.04 
 
 		 516 aa  647    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  70.29 
 
 		 527 aa  735    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3989  carboxyl transferase  69.14 
 
 		 534 aa  707    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.356314 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25440  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  80.38 
 
 		 532 aa  876    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199435  normal  0.360386 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1325  carboxyl transferase  68.7 
 
 		 527 aa  731    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000015031 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  71.21 
 
 		 534 aa  743    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  69.48 
 
 		 546 aa  743    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.35884 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  62.55 
 
 		 516 aa  660    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  65.46 
 
 		 551 aa  684    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  69.1 
 
 		 529 aa  722    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  71.24 
 
 		 530 aa  761    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1043  carboxyl transferase  62.71 
 
 		 549 aa  673    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.282671  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  64.83 
 
 		 527 aa  695    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13309  propionyl-CoA carboxylase beta subunit 5 accD5  63.26 
 
 		 548 aa  668    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4364  carboxyl transferase  69.85 
 
 		 541 aa  723    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  65.33 
 
 		 531 aa  683    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0850  carboxyl transferase  79.58 
 
 		 526 aa  857    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000103034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  69.29 
 
 		 530 aa  720    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1294  carboxyl transferase  64.2 
 
 		 556 aa  684    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  60.92 
 
 		 550 aa  634    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1021  carboxyl transferase  100 
 
 		 531 aa  1068    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1281  carboxyl transferase  67.94 
 
 		 527 aa  712    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6390  carboxyl transferase  70.41 
 
 		 543 aa  742    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0531526  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  71.65 
 
 		 536 aa  746    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21120  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  71.46 
 
 		 529 aa  754    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0918457  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3495  carboxyl transferase  69.75 
 
 		 540 aa  756    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1311  carboxyl transferase  64.2 
 
 		 556 aa  684    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0791098  normal  0.306854 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1677  carboxyl transferase  64.2 
 
 		 542 aa  677    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  63.96 
 
 		 516 aa  642    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  68.83 
 
 		 524 aa  726    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4230  carboxyl transferase  68.54 
 
 		 552 aa  722    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551859  normal  0.395293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1330  carboxyl transferase  64.2 
 
 		 556 aa  684    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  71.48 
 
 		 537 aa  766    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1041  carboxyl transferase  81.89 
 
 		 542 aa  832    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4774  carboxyl transferase  63.89 
 
 		 538 aa  673    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1840  carboxyl transferase  64.78 
 
 		 542 aa  687    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  70.86 
 
 		 527 aa  742    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1152  carboxyl transferase  80.04 
 
 		 529 aa  838    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579492  normal  0.513821 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  57.39 
 
 		 508 aa  612  9.999999999999999e-175  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  59.46 
 
 		 522 aa  613  9.999999999999999e-175  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  58.08 
 
 		 531 aa  610  1e-173  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  58.67 
 
 		 515 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  59.07 
 
 		 515 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  59.07 
 
 		 520 aa  602  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  57.48 
 
 		 516 aa  603  1.0000000000000001e-171  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  59.8 
 
 		 518 aa  598  1e-170  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1621  Propionyl-CoA carboxylase  59.2 
 
 		 513 aa  598  1e-170  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  56.54 
 
 		 516 aa  595  1e-169  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  56.09 
 
 		 516 aa  594  1e-168  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  57.14 
 
 		 516 aa  589  1e-167  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0326  carboxyl transferase  57.8 
 
 		 510 aa  585  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  0.0697048 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  55.11 
 
 		 516 aa  587  1e-166  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  57.17 
 
 		 517 aa  582  1.0000000000000001e-165  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0271  carboxyl transferase  59.56 
 
 		 520 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.435103  normal  0.1429 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  56.23 
 
 		 531 aa  582  1.0000000000000001e-165  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0250  carboxyl transferase  59.64 
 
 		 519 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.135558  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4697  carboxyl transferase  55.02 
 
 		 528 aa  583  1.0000000000000001e-165  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0282  carboxyl transferase  57.64 
 
 		 510 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0358  carboxyl transferase  57.61 
 
 		 510 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2835  carboxyl transferase  57.45 
 
 		 510 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.497575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3811  carboxyl transferase  57.25 
 
 		 510 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0447  acyl CoA biotin-dependant carboxyltransferase  55.6 
 
 		 516 aa  580  1e-164  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  57.11 
 
 		 513 aa  581  1e-164  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3374  carboxyl transferase  56.76 
 
 		 510 aa  580  1e-164  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.778087  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  53.37 
 
 		 514 aa  579  1e-164  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5510  carboxyl transferase  56.87 
 
 		 510 aa  580  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1735  carboxyl transferase  56.81 
 
 		 510 aa  578  1e-164  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3787  Propionyl-CoA carboxylase  54.74 
 
 		 510 aa  580  1e-164  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0271  Propionyl-CoA carboxylase  59.64 
 
 		 519 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.846145  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0260  carboxyl transferase  59.64 
 
 		 519 aa  581  1e-164  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_389  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  55.41 
 
 		 516 aa  578  1e-164  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.839187  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1401  carboxyl transferase  56.03 
 
 		 510 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0947587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2003  carboxyl transferase  54.93 
 
 		 510 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2164  carboxyl transferase  55.71 
 
 		 510 aa  575  1.0000000000000001e-163  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.158421  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0424  carboxyl transferase  55.3 
 
 		 516 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3092  carboxyl transferase  57.86 
 
 		 516 aa  577  1.0000000000000001e-163  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.391297  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5680  propionyl-CoA carboxylase  56.29 
 
 		 510 aa  577  1.0000000000000001e-163  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4725  carboxyl transferase  56.54 
 
 		 510 aa  573  1.0000000000000001e-162  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.48705  normal  0.0648736 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2189  propionyl-CoA carboxylase beta chain  56.29 
 
 		 510 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124404  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1579  carboxyl transferase  55.9 
 
 		 523 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0377813  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1877  propionyl-CoA carboxylase  56.09 
 
 		 510 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5024  putative propionyl-CoA carboxylase beta chain  55.51 
 
 		 510 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.541202 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3688  carboxyl transferase  56.29 
 
 		 510 aa  572  1.0000000000000001e-162  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.618461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5659  carboxyl transferase  58.15 
 
 		 510 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1317  carboxyl transferase  57.37 
 
 		 510 aa  573  1.0000000000000001e-162  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.182185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2381  carboxyl transferase  55.32 
 
 		 510 aa  573  1.0000000000000001e-162  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1016  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  56.48 
 
 		 510 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0861  carboxyl transferase  56.29 
 
 		 510 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.833574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2305  propionyl-CoA carboxylase  56.48 
 
 		 510 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1316  carboxyl transferase  54.25 
 
 		 514 aa  571  1e-161  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4239  carboxyl transferase  55.58 
 
 		 510 aa  571  1e-161  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.540833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0077  carboxyl transferase  52.95 
 
 		 517 aa  571  1e-161  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.371983  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2130  carboxyl transferase  55.05 
 
 		 514 aa  568  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.955323  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0947  carboxyl transferase  55.71 
 
 		 513 aa  570  1e-161  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.592853  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6139  carboxyl transferase  55.25 
 
 		 510 aa  569  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.222288 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  55.85 
 
 		 512 aa  570  1e-161  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2082  carboxyl transferase  56.67 
 
 		 510 aa  570  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.122916  normal  0.0739179 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1851  carboxyl transferase  55.13 
 
 		 510 aa  568  1e-161  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1880  carboxyl transferase  56.67 
 
 		 510 aa  570  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0295366 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>