More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_05890 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0821  carboxyl transferase  77.69 
 
 		 536 aa  837    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588825  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  79.25 
 
 		 530 aa  854    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1621  Propionyl-CoA carboxylase  65.15 
 
 		 513 aa  635    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  66.17 
 
 		 527 aa  723    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  63.95 
 
 		 516 aa  674    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1325  carboxyl transferase  67.36 
 
 		 527 aa  741    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000015031 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  77.17 
 
 		 524 aa  846    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  77.55 
 
 		 527 aa  832    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  79.82 
 
 		 534 aa  880    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1152  carboxyl transferase  71.54 
 
 		 529 aa  766    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579492  normal  0.513821 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0850  carboxyl transferase  69.81 
 
 		 526 aa  754    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000103034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3989  carboxyl transferase  68.49 
 
 		 534 aa  723    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.356314 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  65.54 
 
 		 516 aa  677    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1021  carboxyl transferase  69.48 
 
 		 531 aa  743    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4364  carboxyl transferase  77.97 
 
 		 541 aa  834    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  69.92 
 
 		 531 aa  766    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  70.2 
 
 		 551 aa  771    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4230  carboxyl transferase  76.47 
 
 		 552 aa  858    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551859  normal  0.395293 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21120  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  70.59 
 
 		 529 aa  750    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0918457  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  59.39 
 
 		 531 aa  635    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1840  carboxyl transferase  78.15 
 
 		 542 aa  850    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  77.53 
 
 		 529 aa  842    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  65.48 
 
 		 516 aa  667    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  75.51 
 
 		 537 aa  826    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1294  carboxyl transferase  73.99 
 
 		 556 aa  825    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  64.71 
 
 		 550 aa  686    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1281  carboxyl transferase  67.36 
 
 		 527 aa  729    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25440  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  68.68 
 
 		 532 aa  761    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199435  normal  0.360386 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  100 
 
 		 546 aa  1118    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.35884 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  76.88 
 
 		 536 aa  859    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1041  carboxyl transferase  70.45 
 
 		 542 aa  751    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  75.56 
 
 		 530 aa  818    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3495  carboxyl transferase  79.96 
 
 		 540 aa  882    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1311  carboxyl transferase  73.99 
 
 		 556 aa  825    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0791098  normal  0.306854 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6390  carboxyl transferase  85.01 
 
 		 543 aa  963    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0531526  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1677  carboxyl transferase  73.99 
 
 		 542 aa  815    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  63.67 
 
 		 522 aa  669    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  62.71 
 
 		 518 aa  645    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1043  carboxyl transferase  72.31 
 
 		 549 aa  806    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.282671  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1330  carboxyl transferase  73.99 
 
 		 556 aa  825    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13309  propionyl-CoA carboxylase beta subunit 5 accD5  74.53 
 
 		 548 aa  811    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4774  carboxyl transferase  74.72 
 
 		 538 aa  820    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  77.74 
 
 		 527 aa  837    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  60.43 
 
 		 520 aa  629  1e-179  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0250  carboxyl transferase  61.12 
 
 		 519 aa  630  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.135558  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0271  Propionyl-CoA carboxylase  62.06 
 
 		 519 aa  628  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.846145  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0260  carboxyl transferase  62.26 
 
 		 519 aa  628  1e-179  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0271  carboxyl transferase  61.09 
 
 		 520 aa  629  1e-179  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.435103  normal  0.1429 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  60.15 
 
 		 516 aa  630  1e-179  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  59.46 
 
 		 515 aa  625  1e-178  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  59.27 
 
 		 515 aa  624  1e-177  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  59.77 
 
 		 516 aa  624  1e-177  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  58.96 
 
 		 508 aa  617  1e-175  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4697  carboxyl transferase  57.93 
 
 		 528 aa  617  1e-175  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3688  carboxyl transferase  59.13 
 
 		 510 aa  615  1e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.618461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0326  carboxyl transferase  58.62 
 
 		 510 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  0.0697048 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2305  propionyl-CoA carboxylase  59.2 
 
 		 510 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1877  propionyl-CoA carboxylase  59.24 
 
 		 510 aa  613  9.999999999999999e-175  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0358  carboxyl transferase  58.62 
 
 		 510 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2835  carboxyl transferase  58.75 
 
 		 510 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.497575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2189  propionyl-CoA carboxylase beta chain  59 
 
 		 510 aa  611  1e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124404  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  57.74 
 
 		 517 aa  608  1e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1632  carboxyl transferase  57.5 
 
 		 522 aa  610  1e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2974  carboxyl transferase  59.05 
 
 		 519 aa  611  1e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  57.74 
 
 		 516 aa  609  1e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0861  carboxyl transferase  59 
 
 		 510 aa  611  1e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.833574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0282  carboxyl transferase  58.43 
 
 		 510 aa  611  1e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2003  carboxyl transferase  57.52 
 
 		 510 aa  605  9.999999999999999e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3811  carboxyl transferase  58.62 
 
 		 510 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0077  carboxyl transferase  55.22 
 
 		 517 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.371983  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0639  carboxyl transferase  57.63 
 
 		 513 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.629685 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4004  carboxyl transferase  57.5 
 
 		 511 aa  605  1.0000000000000001e-171  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.680854 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  59.14 
 
 		 513 aa  604  1.0000000000000001e-171  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  57.25 
 
 		 512 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  57.36 
 
 		 512 aa  603  1.0000000000000001e-171  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1016  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  58.62 
 
 		 510 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  56.74 
 
 		 516 aa  603  1.0000000000000001e-171  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  56.98 
 
 		 518 aa  602  1.0000000000000001e-171  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2130  carboxyl transferase  57.85 
 
 		 514 aa  600  1e-170  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.955323  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5510  carboxyl transferase  58.43 
 
 		 510 aa  601  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  55.45 
 
 		 514 aa  599  1e-170  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2513  carboxyl transferase  56.32 
 
 		 510 aa  599  1e-170  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152871  normal  0.332227 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2381  carboxyl transferase  57.28 
 
 		 510 aa  601  1e-170  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5024  putative propionyl-CoA carboxylase beta chain  57.47 
 
 		 510 aa  597  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.541202 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1401  carboxyl transferase  57.36 
 
 		 510 aa  595  1e-169  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0947587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2164  carboxyl transferase  57.28 
 
 		 510 aa  597  1e-169  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.158421  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1579  carboxyl transferase  56.58 
 
 		 523 aa  597  1e-169  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0377813  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1851  carboxyl transferase  57.09 
 
 		 510 aa  596  1e-169  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3484  carboxyl transferase  58.38 
 
 		 510 aa  595  1e-169  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5659  carboxyl transferase  58.24 
 
 		 510 aa  596  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0930  carboxyl transferase  58.27 
 
 		 518 aa  595  1e-169  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2042  carboxyl transferase  57.47 
 
 		 510 aa  595  1e-169  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0884189  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11343  propionlyl-CoA carboxylase  56.74 
 
 		 513 aa  595  1e-169  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3755  carboxyl transferase  56.32 
 
 		 510 aa  592  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0296123  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2284  carboxyl transferase  57.17 
 
 		 522 aa  592  1e-168  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00152526  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3374  carboxyl transferase  57.14 
 
 		 510 aa  592  1e-168  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.778087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1223  carboxyl transferase  54.37 
 
 		 517 aa  592  1e-168  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00883657  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0912  carboxyl transferase  58.27 
 
 		 510 aa  594  1e-168  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1880  carboxyl transferase  58.05 
 
 		 510 aa  590  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0295366 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1735  carboxyl transferase  57.28 
 
 		 510 aa  591  1e-167  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>