More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2186 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_2553  carboxyl transferase domain-containing protein  62.2 
 
 
513 aa  642    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2375  carboxyl transferase domain-containing protein  62.4 
 
 
513 aa  644    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2332  propionyl-CoA carboxylase  62.2 
 
 
513 aa  642    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2291  propionyl-CoA carboxylase  62.2 
 
 
513 aa  641    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0918842  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2360  propionyl-CoA carboxylase  62.3 
 
 
513 aa  649    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.306025  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2807  carboxyl transferase domain protein  61.91 
 
 
513 aa  644    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000977821 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2552  carboxyl transferase domain-containing protein  62.4 
 
 
513 aa  644    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.953071  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6415  Propionyl-CoA carboxylase  76.82 
 
 
506 aa  786    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2516  carboxyl transferase domain protein  61.91 
 
 
513 aa  645    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2052  Propionyl-CoA carboxylase  63.85 
 
 
518 aa  644    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00336851  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1807  propionyl-CoA carboxylase  62.7 
 
 
513 aa  652    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.171719  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0033  propionyl-CoA carboxylase  79.77 
 
 
510 aa  816    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0027  propionyl-CoA carboxylase  79.18 
 
 
510 aa  822    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2186  Propionyl-CoA carboxylase  100 
 
 
523 aa  1063    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2445  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  64.19 
 
 
517 aa  654    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0403  propionyl-CoA carboxylase  73.47 
 
 
510 aa  743    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2565  carboxyl transferase domain protein  62.43 
 
 
513 aa  640    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.89145e-17 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1346  Propionyl-CoA carboxylase  67.08 
 
 
508 aa  647    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2608  carboxyl transferase domain protein  62.2 
 
 
513 aa  642    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.444131  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1836  Propionyl-CoA carboxylase  62.43 
 
 
520 aa  644    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.101625  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2164  propionyl-CoA carboxylase  62.6 
 
 
522 aa  630  1e-179  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.207678  normal  0.196324 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2300  Sigma 54 interacting domain protein  63.64 
 
 
513 aa  622  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.535149  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2212  Propionyl-CoA carboxylase  63.56 
 
 
513 aa  624  1e-177  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.000980367  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1646  propionyl-CoA carboxylase  63.44 
 
 
524 aa  617  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08220  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  61.24 
 
 
537 aa  607  9.999999999999999e-173  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.394862 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0008  Propionyl-CoA carboxylase  46.55 
 
 
607 aa  463  1e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2913  Propionyl-CoA carboxylase  46.36 
 
 
586 aa  455  1.0000000000000001e-126  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.615692  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2122  Propionyl-CoA carboxylase  45.28 
 
 
625 aa  445  1e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.893863  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2454  carboxyl transferase  43.99 
 
 
612 aa  438  1e-121  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  41.89 
 
 
508 aa  392  1e-108  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1593  Propionyl-CoA carboxylase  43.48 
 
 
525 aa  394  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  41.04 
 
 
531 aa  379  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  41.57 
 
 
531 aa  375  1e-103  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  42.09 
 
 
516 aa  378  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  40 
 
 
516 aa  374  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  42.15 
 
 
550 aa  369  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  39.38 
 
 
518 aa  369  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  39.81 
 
 
534 aa  365  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  40.38 
 
 
517 aa  368  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  39.52 
 
 
527 aa  366  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  39.16 
 
 
516 aa  367  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  39.31 
 
 
516 aa  368  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2361  carboxyl transferase  40.39 
 
 
513 aa  368  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000738755  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  41.9 
 
 
516 aa  365  1e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  42.09 
 
 
516 aa  365  2e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1223  carboxyl transferase  39.81 
 
 
517 aa  364  3e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00883657  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  39.04 
 
 
514 aa  364  3e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0268  carboxyl transferase  39.51 
 
 
523 aa  362  1e-98  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  38.3 
 
 
516 aa  361  2e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  39.15 
 
 
512 aa  360  4e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0379  carboxyl transferase  40.58 
 
 
514 aa  360  5e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  39.26 
 
 
531 aa  358  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  38.18 
 
 
512 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  39.16 
 
 
537 aa  357  2.9999999999999997e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  40.78 
 
 
518 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  39.07 
 
 
527 aa  357  3.9999999999999996e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0489  carboxyl transferase  39.17 
 
 
520 aa  357  3.9999999999999996e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11343  propionlyl-CoA carboxylase  41.12 
 
 
513 aa  356  5e-97  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  38 
 
 
515 aa  356  5.999999999999999e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2348  carboxyl transferase  40.58 
 
 
512 aa  356  5.999999999999999e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0317  carboxyl transferase  40.08 
 
 
514 aa  355  1e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0077  carboxyl transferase  38.34 
 
 
517 aa  355  1e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.371983  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  38.55 
 
 
516 aa  355  2e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1593  carboxyl transferase  39.11 
 
 
514 aa  354  2e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0139637  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  39.54 
 
 
551 aa  354  2e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  38.15 
 
 
517 aa  354  2.9999999999999997e-96  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0335  carboxyl transferase  39.07 
 
 
514 aa  354  2.9999999999999997e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.868559  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2974  carboxyl transferase  39.31 
 
 
519 aa  354  2.9999999999999997e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3025  carboxyl transferase  39.66 
 
 
532 aa  352  7e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.432014 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  39.46 
 
 
530 aa  352  8e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0260  carboxyl transferase  39.06 
 
 
519 aa  352  1e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0291  carboxyl transferase  38.46 
 
 
519 aa  352  1e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  37.81 
 
 
515 aa  352  1e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0271  carboxyl transferase  39.96 
 
 
520 aa  352  1e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.435103  normal  0.1429 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3166  carboxyl transferase  39.84 
 
 
521 aa  352  1e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0567033  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0271  Propionyl-CoA carboxylase  39.06 
 
 
519 aa  351  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.846145  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1215  methylmalonyl-CoA decarboxylase alpha chain  42.51 
 
 
519 aa  349  7e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.336846  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2907  propionyl-CoA carboxylase  39.22 
 
 
514 aa  349  8e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0272  carboxyl transferase  37.7 
 
 
515 aa  348  1e-94  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00889461 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2284  carboxyl transferase  39.11 
 
 
522 aa  348  1e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00152526  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0250  carboxyl transferase  38.68 
 
 
519 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.135558  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0850  carboxyl transferase  38.94 
 
 
526 aa  348  1e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000103034  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  38.7 
 
 
513 aa  348  2e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  38.36 
 
 
520 aa  348  2e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0553  carboxyl transferase  37.52 
 
 
518 aa  347  4e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.965666  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13309  propionyl-CoA carboxylase beta subunit 5 accD5  38.39 
 
 
548 aa  347  4e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0821  carboxyl transferase  39.15 
 
 
536 aa  347  4e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588825  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2881  carboxyl transferase  39.08 
 
 
514 aa  346  6e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1375  propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit alpha / propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit beta  38.51 
 
 
524 aa  346  6e-94  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0140013 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1632  carboxyl transferase  39 
 
 
522 aa  346  6e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1248  carboxyl transferase  36.94 
 
 
522 aa  346  8e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  40.2 
 
 
524 aa  345  8.999999999999999e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  39.26 
 
 
536 aa  345  1e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2999  carboxyl transferase  39.64 
 
 
510 aa  345  1e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0424  carboxyl transferase  37.57 
 
 
516 aa  344  2e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1041  carboxyl transferase  39.72 
 
 
542 aa  345  2e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4364  carboxyl transferase  40.27 
 
 
541 aa  343  4e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4230  carboxyl transferase  38.56 
 
 
552 aa  343  4e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551859  normal  0.395293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1294  carboxyl transferase  38.95 
 
 
556 aa  342  8e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1330  carboxyl transferase  38.95 
 
 
556 aa  342  8e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>