More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_08220 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1346  Propionyl-CoA carboxylase  66.32 
 
 		 508 aa  650    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2553  carboxyl transferase domain-containing protein  62.45 
 
 		 513 aa  642    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2516  carboxyl transferase domain protein  60.35 
 
 		 513 aa  640    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2807  carboxyl transferase domain protein  60.35 
 
 		 513 aa  639    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000977821 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2375  carboxyl transferase domain-containing protein  62.25 
 
 		 513 aa  641    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2332  propionyl-CoA carboxylase  62.25 
 
 		 513 aa  642    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2291  propionyl-CoA carboxylase  62.45 
 
 		 513 aa  642    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0918842  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2608  carboxyl transferase domain protein  62.45 
 
 		 513 aa  642    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.444131  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2552  carboxyl transferase domain-containing protein  62.25 
 
 		 513 aa  641    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.953071  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2360  propionyl-CoA carboxylase  60.93 
 
 		 513 aa  643    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.306025  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08220  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  100 
 
 		 537 aa  1087    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.394862 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2565  carboxyl transferase domain protein  60.31 
 
 		 513 aa  643    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.89145e-17 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1807  propionyl-CoA carboxylase  60.12 
 
 		 513 aa  639    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.171719  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1836  Propionyl-CoA carboxylase  62.3 
 
 		 520 aa  635    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.101625  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2445  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  60.27 
 
 		 517 aa  629  1e-179  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2052  Propionyl-CoA carboxylase  60.93 
 
 		 518 aa  625  1e-178  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00336851  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0027  propionyl-CoA carboxylase  60.97 
 
 		 510 aa  624  1e-177  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6415  Propionyl-CoA carboxylase  61.74 
 
 		 506 aa  612  9.999999999999999e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1646  propionyl-CoA carboxylase  60.56 
 
 		 524 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0033  propionyl-CoA carboxylase  60.31 
 
 		 510 aa  614  9.999999999999999e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2164  propionyl-CoA carboxylase  59.43 
 
 		 522 aa  609  1e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.207678  normal  0.196324 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2300  Sigma 54 interacting domain protein  60.42 
 
 		 513 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.535149  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2212  Propionyl-CoA carboxylase  59.77 
 
 		 513 aa  605  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.000980367  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2186  Propionyl-CoA carboxylase  61.24 
 
 		 523 aa  607  9.999999999999999e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0403  propionyl-CoA carboxylase  60.69 
 
 		 510 aa  579  1e-164  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0008  Propionyl-CoA carboxylase  44.07 
 
 		 607 aa  431  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2122  Propionyl-CoA carboxylase  44.05 
 
 		 625 aa  431  1e-119  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.893863  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2913  Propionyl-CoA carboxylase  43.19 
 
 		 586 aa  417  9.999999999999999e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.615692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2454  carboxyl transferase  40.79 
 
 		 612 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1593  Propionyl-CoA carboxylase  43.2 
 
 		 525 aa  389  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3495  carboxyl transferase  40.49 
 
 		 540 aa  349  7e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  39.47 
 
 		 508 aa  339  8e-92  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0379  carboxyl transferase  39.04 
 
 		 514 aa  334  3e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4364  carboxyl transferase  38.27 
 
 		 541 aa  332  1e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4230  carboxyl transferase  39.4 
 
 		 552 aa  331  2e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551859  normal  0.395293 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  38.97 
 
 		 516 aa  331  2e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  38.78 
 
 		 530 aa  331  2e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  36.38 
 
 		 516 aa  330  3e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  37.15 
 
 		 537 aa  330  3e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  37.57 
 
 		 516 aa  330  4e-89  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  39.43 
 
 		 512 aa  330  5.0000000000000004e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  37.16 
 
 		 516 aa  330  5.0000000000000004e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  38.64 
 
 		 529 aa  330  5.0000000000000004e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  38.45 
 
 		 516 aa  329  9e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0156  carboxyl transferase  37.93 
 
 		 513 aa  329  1.0000000000000001e-88  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.344953  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  37.18 
 
 		 518 aa  328  2.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  38.57 
 
 		 520 aa  327  3e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0272  carboxyl transferase  37.73 
 
 		 515 aa  327  4.0000000000000003e-88  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00889461 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  38.37 
 
 		 534 aa  326  7e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  39.58 
 
 		 524 aa  326  7e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1294  carboxyl transferase  38.93 
 
 		 556 aa  325  9e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1330  carboxyl transferase  38.93 
 
 		 556 aa  325  9e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1311  carboxyl transferase  38.93 
 
 		 556 aa  325  9e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0791098  normal  0.306854 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  36.54 
 
 		 516 aa  325  2e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1790  hypothetical protein  37.9 
 
 		 535 aa  324  3e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  37.36 
 
 		 550 aa  324  3e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1840  carboxyl transferase  39.36 
 
 		 542 aa  323  5e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21120  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  37.36 
 
 		 529 aa  323  6e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0918457  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2974  carboxyl transferase  36.78 
 
 		 519 aa  322  9.999999999999999e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  37.32 
 
 		 546 aa  322  9.999999999999999e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.35884 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  35.31 
 
 		 514 aa  322  9.999999999999999e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0268  carboxyl transferase  39 
 
 		 523 aa  322  1.9999999999999998e-86  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  37.8 
 
 		 512 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000378  methylcrotonyl-CoA carboxylase carboxyl transferase subunit  38.73 
 
 		 535 aa  321  1.9999999999999998e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.723902  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  38.83 
 
 		 515 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  38.07 
 
 		 530 aa  321  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1072  methylcrotonyl-CoA carboxylase carboxyl transferase subunit  39.66 
 
 		 554 aa  321  1.9999999999999998e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.19286  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0821  carboxyl transferase  37.12 
 
 		 536 aa  320  3e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588825  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6230  Propionyl-CoA carboxylase  40.37 
 
 		 533 aa  320  3.9999999999999996e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  36.9 
 
 		 531 aa  320  5e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6390  carboxyl transferase  39.31 
 
 		 543 aa  319  6e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0531526  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1977  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  38.84 
 
 		 534 aa  319  7e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000665967  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1791  hypothetical protein  38.13 
 
 		 535 aa  319  9e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30520  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  39.15 
 
 		 537 aa  319  9e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.805243 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0964  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  39.62 
 
 		 535 aa  318  1e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  36.96 
 
 		 551 aa  318  1e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  38.43 
 
 		 515 aa  318  2e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3166  carboxyl transferase  38.06 
 
 		 521 aa  318  2e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0567033  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  37.83 
 
 		 517 aa  317  3e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  36.81 
 
 		 531 aa  317  3e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  37.5 
 
 		 527 aa  317  3e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  36.38 
 
 		 531 aa  316  8e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1021  carboxyl transferase  37.07 
 
 		 531 aa  315  9.999999999999999e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2154  methylcrotonoyl-CoA carboxylase  39.71 
 
 		 529 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1612  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  37.16 
 
 		 542 aa  315  9.999999999999999e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.171186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00440  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  40.37 
 
 		 531 aa  315  9.999999999999999e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.123454  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1325  carboxyl transferase  37.71 
 
 		 527 aa  315  9.999999999999999e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000015031 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6413  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  38.43 
 
 		 522 aa  314  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0804402  normal  0.0134377 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  37.31 
 
 		 513 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5120  propionyl-CoA carboxylase  38.12 
 
 		 535 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0213028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5033  propionyl-CoA carboxylase  38.52 
 
 		 535 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  38.27 
 
 		 536 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2284  carboxyl transferase  37.83 
 
 		 522 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00152526  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2847  propionyl-CoA carboxylase  38.6 
 
 		 535 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4774  carboxyl transferase  38.59 
 
 		 538 aa  314  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2032  propionyl-CoA carboxylase  37.5 
 
 		 535 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0210528  normal  0.469239 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0077  carboxyl transferase  35.62 
 
 		 517 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.371983  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1529  Propionyl-CoA carboxylase  38.4 
 
 		 535 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2974  propionyl-CoA carboxylase  38.4 
 
 		 535 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.562625 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1677  carboxyl transferase  38.17 
 
 		 542 aa  313  4.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>