More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2300 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_1807  propionyl-CoA carboxylase  68.14 
 
 
513 aa  704    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.171719  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2553  carboxyl transferase domain-containing protein  67.13 
 
 
513 aa  697    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2212  Propionyl-CoA carboxylase  99.42 
 
 
513 aa  1021    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.000980367  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2375  carboxyl transferase domain-containing protein  67.14 
 
 
513 aa  695    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2332  propionyl-CoA carboxylase  66.93 
 
 
513 aa  697    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2291  propionyl-CoA carboxylase  67.13 
 
 
513 aa  697    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0918842  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2164  propionyl-CoA carboxylase  88.85 
 
 
522 aa  892    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.207678  normal  0.196324 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2052  Propionyl-CoA carboxylase  69.02 
 
 
518 aa  698    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00336851  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2565  carboxyl transferase domain protein  66.67 
 
 
513 aa  698    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.89145e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2552  carboxyl transferase domain-containing protein  67.14 
 
 
513 aa  695    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.953071  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1836  Propionyl-CoA carboxylase  68.49 
 
 
520 aa  735    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.101625  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1646  propionyl-CoA carboxylase  96.49 
 
 
524 aa  971    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2445  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  70.1 
 
 
517 aa  726    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2516  carboxyl transferase domain protein  67.74 
 
 
513 aa  699    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2360  propionyl-CoA carboxylase  68.35 
 
 
513 aa  702    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.306025  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2300  Sigma 54 interacting domain protein  100 
 
 
513 aa  1027    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.535149  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2608  carboxyl transferase domain protein  67.13 
 
 
513 aa  697    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.444131  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2807  carboxyl transferase domain protein  67.74 
 
 
513 aa  699    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000977821 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0027  propionyl-CoA carboxylase  64.34 
 
 
510 aa  639    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1346  Propionyl-CoA carboxylase  67.49 
 
 
508 aa  630  1e-179  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0033  propionyl-CoA carboxylase  64.53 
 
 
510 aa  630  1e-179  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2186  Propionyl-CoA carboxylase  64.03 
 
 
523 aa  627  1e-178  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6415  Propionyl-CoA carboxylase  62.82 
 
 
506 aa  617  1e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08220  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  61.26 
 
 
537 aa  616  1e-175  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.394862 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0403  propionyl-CoA carboxylase  64.12 
 
 
510 aa  598  1e-170  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0008  Propionyl-CoA carboxylase  46.65 
 
 
607 aa  463  1e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2122  Propionyl-CoA carboxylase  46 
 
 
625 aa  458  1e-127  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.893863  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2913  Propionyl-CoA carboxylase  46.35 
 
 
586 aa  439  9.999999999999999e-123  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.615692  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2454  carboxyl transferase  44.55 
 
 
612 aa  441  9.999999999999999e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1593  Propionyl-CoA carboxylase  46.44 
 
 
525 aa  389  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  43.03 
 
 
508 aa  375  1e-102  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  39.8 
 
 
516 aa  369  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  41.65 
 
 
516 aa  370  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2284  carboxyl transferase  41.76 
 
 
522 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00152526  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  40.59 
 
 
515 aa  361  2e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  40.59 
 
 
515 aa  359  7e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  42.29 
 
 
527 aa  358  9.999999999999999e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  40.63 
 
 
512 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  38.6 
 
 
518 aa  355  8.999999999999999e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  40.8 
 
 
517 aa  354  2.9999999999999997e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  40.16 
 
 
512 aa  353  5e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0307  carboxyl transferase  41.06 
 
 
516 aa  352  8.999999999999999e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  39.35 
 
 
546 aa  351  2e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.35884 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  39.23 
 
 
516 aa  345  1e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  41.2 
 
 
516 aa  344  2e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  42.74 
 
 
531 aa  344  2e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0999  carboxyl transferase  39.92 
 
 
527 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1215  methylmalonyl-CoA decarboxylase alpha chain  46.12 
 
 
519 aa  343  4e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.336846  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  40.32 
 
 
550 aa  342  5.999999999999999e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  39.96 
 
 
527 aa  342  7e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1612  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  39.58 
 
 
542 aa  342  9e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.171186  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  39.77 
 
 
527 aa  342  1e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0340  propionyl-CoA carboxylase  38.28 
 
 
536 aa  341  2e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  41.43 
 
 
516 aa  341  2e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  39.77 
 
 
520 aa  341  2e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0489  carboxyl transferase  39.45 
 
 
520 aa  340  2.9999999999999998e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1294  carboxyl transferase  39.73 
 
 
556 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4230  carboxyl transferase  40.27 
 
 
552 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551859  normal  0.395293 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1311  carboxyl transferase  39.73 
 
 
556 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0791098  normal  0.306854 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1330  carboxyl transferase  39.73 
 
 
556 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  42.83 
 
 
518 aa  340  4e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  37.43 
 
 
516 aa  340  4e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  39.04 
 
 
531 aa  340  4e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4774  carboxyl transferase  39.77 
 
 
538 aa  340  5e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0850  carboxyl transferase  39.5 
 
 
526 aa  340  5e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000103034  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0379  carboxyl transferase  39.46 
 
 
514 aa  339  7e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3654  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  39.21 
 
 
545 aa  339  9e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000718459  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0309  putative acyl-CoA carboxylase (beta subunit) protein  38.09 
 
 
536 aa  338  9.999999999999999e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.155746  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  40.08 
 
 
530 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1677  carboxyl transferase  40.15 
 
 
542 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0291  carboxyl transferase  39.84 
 
 
519 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  39.96 
 
 
531 aa  337  2.9999999999999997e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1072  methylcrotonyl-CoA carboxylase carboxyl transferase subunit  39.84 
 
 
554 aa  337  3.9999999999999995e-91  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.19286  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1840  carboxyl transferase  38.67 
 
 
542 aa  337  3.9999999999999995e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  39.92 
 
 
524 aa  336  7e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2611  Propionyl-CoA carboxylase  42.08 
 
 
535 aa  336  7e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1021  carboxyl transferase  40.08 
 
 
531 aa  335  7.999999999999999e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0268  carboxyl transferase  38.76 
 
 
523 aa  335  1e-90  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  40.48 
 
 
517 aa  335  1e-90  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  36.12 
 
 
514 aa  335  1e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3989  carboxyl transferase  41.72 
 
 
534 aa  335  1e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.356314 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3495  carboxyl transferase  38.2 
 
 
540 aa  335  1e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6390  carboxyl transferase  39.74 
 
 
543 aa  334  2e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0531526  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  38.67 
 
 
537 aa  334  2e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0051  carboxyl transferase  40.51 
 
 
517 aa  334  3e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.253581  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1663  Propionyl-CoA carboxylase  39.77 
 
 
560 aa  333  3e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  41.24 
 
 
551 aa  334  3e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6937  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  42.54 
 
 
559 aa  333  4e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100753  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1248  carboxyl transferase  39.04 
 
 
522 aa  332  7.000000000000001e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3166  carboxyl transferase  38.74 
 
 
521 aa  332  8e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0567033  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0950  carboxyl transferase  42.83 
 
 
514 aa  332  8e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.216274 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  40.48 
 
 
522 aa  332  9e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4364  carboxyl transferase  39.05 
 
 
541 aa  332  9e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0964  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  39.45 
 
 
535 aa  332  1e-89  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3025  carboxyl transferase  40.51 
 
 
532 aa  332  1e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.432014 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0201  carboxyl transferase  39.11 
 
 
521 aa  332  1e-89  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0217258  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  38.45 
 
 
513 aa  331  2e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2361  carboxyl transferase  38.66 
 
 
513 aa  331  2e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000738755  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1325  carboxyl transferase  39.81 
 
 
527 aa  330  3e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000015031 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3695  carboxyl transferase  41.06 
 
 
538 aa  330  4e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0411544 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>