More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2913 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0008  Propionyl-CoA carboxylase  75.82 
 
 
607 aa  923    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2913  Propionyl-CoA carboxylase  100 
 
 
586 aa  1184    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.615692  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2454  carboxyl transferase  72.4 
 
 
612 aa  852    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2122  Propionyl-CoA carboxylase  69.56 
 
 
625 aa  856    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.893863  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1836  Propionyl-CoA carboxylase  46.12 
 
 
520 aa  480  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.101625  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2052  Propionyl-CoA carboxylase  46.83 
 
 
518 aa  479  1e-134  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00336851  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2807  carboxyl transferase domain protein  45.59 
 
 
513 aa  476  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000977821 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2360  propionyl-CoA carboxylase  45.59 
 
 
513 aa  476  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.306025  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2516  carboxyl transferase domain protein  45.59 
 
 
513 aa  476  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2553  carboxyl transferase domain-containing protein  45.4 
 
 
513 aa  473  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2375  carboxyl transferase domain-containing protein  45.56 
 
 
513 aa  472  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2332  propionyl-CoA carboxylase  45.56 
 
 
513 aa  473  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2291  propionyl-CoA carboxylase  45.37 
 
 
513 aa  472  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0918842  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2552  carboxyl transferase domain-containing protein  45.56 
 
 
513 aa  472  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.953071  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1807  propionyl-CoA carboxylase  46.2 
 
 
513 aa  474  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.171719  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2608  carboxyl transferase domain protein  45.4 
 
 
513 aa  473  1e-132  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.444131  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2445  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  45.44 
 
 
517 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2565  carboxyl transferase domain protein  45.37 
 
 
513 aa  472  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.89145e-17 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2186  Propionyl-CoA carboxylase  46.36 
 
 
523 aa  464  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2164  propionyl-CoA carboxylase  46.65 
 
 
522 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.207678  normal  0.196324 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1346  Propionyl-CoA carboxylase  45.19 
 
 
508 aa  458  1e-127  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0027  propionyl-CoA carboxylase  45.87 
 
 
510 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2300  Sigma 54 interacting domain protein  45.96 
 
 
513 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.535149  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2212  Propionyl-CoA carboxylase  45.96 
 
 
513 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.000980367  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6415  Propionyl-CoA carboxylase  44.83 
 
 
506 aa  445  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1646  propionyl-CoA carboxylase  45.96 
 
 
524 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0403  propionyl-CoA carboxylase  44.4 
 
 
510 aa  444  1e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0033  propionyl-CoA carboxylase  44.66 
 
 
510 aa  436  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08220  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  43.05 
 
 
537 aa  435  1e-120  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.394862 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  39.33 
 
 
508 aa  358  1.9999999999999998e-97  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  38.61 
 
 
515 aa  352  8e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  38.22 
 
 
515 aa  351  2e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  37.45 
 
 
531 aa  348  1e-94  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  38.26 
 
 
516 aa  347  4e-94  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1248  carboxyl transferase  37.88 
 
 
522 aa  346  8e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1593  Propionyl-CoA carboxylase  37.91 
 
 
525 aa  341  2e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0335  carboxyl transferase  36.4 
 
 
514 aa  341  2.9999999999999998e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.868559  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0317  carboxyl transferase  36.99 
 
 
514 aa  340  5e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  36.5 
 
 
531 aa  338  1.9999999999999998e-91  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  35.06 
 
 
518 aa  337  2.9999999999999997e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  36.03 
 
 
516 aa  334  3e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  36.07 
 
 
516 aa  333  6e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  36.61 
 
 
513 aa  332  8e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  34.94 
 
 
512 aa  330  6e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  35.06 
 
 
516 aa  329  7e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  37.52 
 
 
551 aa  329  8e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  36.5 
 
 
531 aa  329  9e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  35.83 
 
 
520 aa  328  2.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1593  carboxyl transferase  35.84 
 
 
514 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0139637  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4697  carboxyl transferase  35.65 
 
 
528 aa  327  5e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1621  Propionyl-CoA carboxylase  38.1 
 
 
513 aa  326  6e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1632  carboxyl transferase  34.9 
 
 
522 aa  326  9e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  37.62 
 
 
550 aa  324  2e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  35.45 
 
 
512 aa  323  4e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3695  carboxyl transferase  36.23 
 
 
538 aa  323  4e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0411544 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0553  carboxyl transferase  34.88 
 
 
518 aa  323  4e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.965666  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2348  carboxyl transferase  35.32 
 
 
512 aa  323  5e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  33.84 
 
 
516 aa  322  8e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  37.11 
 
 
530 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2284  carboxyl transferase  35.36 
 
 
522 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00152526  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  36.45 
 
 
527 aa  322  1.9999999999999998e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1316  carboxyl transferase  35.37 
 
 
514 aa  321  3e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4004  carboxyl transferase  35.58 
 
 
511 aa  321  3e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.680854 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2361  carboxyl transferase  36.01 
 
 
513 aa  320  3e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000738755  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  36.01 
 
 
524 aa  321  3e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  36.64 
 
 
527 aa  321  3e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1840  carboxyl transferase  34.49 
 
 
542 aa  320  3e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0950  carboxyl transferase  37.59 
 
 
514 aa  320  6e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.216274 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0947  carboxyl transferase  35.07 
 
 
513 aa  320  7e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.592853  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  37 
 
 
529 aa  319  7.999999999999999e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  34.68 
 
 
514 aa  319  1e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0034  carboxyl transferase  34.48 
 
 
516 aa  319  1e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182676  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3083  carboxyl transferase  34.48 
 
 
516 aa  319  1e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0002503  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  35.31 
 
 
517 aa  318  2e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0379  carboxyl transferase  36.66 
 
 
514 aa  318  2e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3484  carboxyl transferase  36.14 
 
 
510 aa  318  2e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0889  carboxyl transferase  34.68 
 
 
564 aa  318  2e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3025  carboxyl transferase  35.62 
 
 
532 aa  318  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.432014 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  38.74 
 
 
518 aa  318  2e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  37.13 
 
 
516 aa  317  3e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0999  carboxyl transferase  37.96 
 
 
527 aa  317  3e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0307  carboxyl transferase  35.89 
 
 
516 aa  317  4e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0930  carboxyl transferase  35.29 
 
 
518 aa  317  4e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0156  carboxyl transferase  35.77 
 
 
513 aa  317  4e-85  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.344953  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2513  carboxyl transferase  36.02 
 
 
510 aa  317  4e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152871  normal  0.332227 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3166  carboxyl transferase  36.02 
 
 
521 aa  317  6e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0567033  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3092  carboxyl transferase  35.18 
 
 
516 aa  317  6e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.391297  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2694  carboxyl transferase  34.93 
 
 
510 aa  316  6e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  36.52 
 
 
517 aa  316  7e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0489  carboxyl transferase  35.74 
 
 
520 aa  316  7e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0639  carboxyl transferase  35.14 
 
 
513 aa  316  7e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.629685 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1851  carboxyl transferase  35.57 
 
 
510 aa  316  9e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0912  carboxyl transferase  35.56 
 
 
510 aa  316  9e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1294  carboxyl transferase  35.53 
 
 
556 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1311  carboxyl transferase  35.53 
 
 
556 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0791098  normal  0.306854 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1330  carboxyl transferase  35.53 
 
 
556 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0260  carboxyl transferase  35.69 
 
 
519 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2042  carboxyl transferase  35.38 
 
 
510 aa  314  2.9999999999999996e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0884189  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11343  propionlyl-CoA carboxylase  34.29 
 
 
513 aa  314  2.9999999999999996e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1754  carboxyl transferase  34.17 
 
 
510 aa  313  3.9999999999999997e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.218371  normal  0.119502 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>