More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1346 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0033  propionyl-CoA carboxylase  66.8 
 
 		 510 aa  652    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2186  Propionyl-CoA carboxylase  67.08 
 
 		 523 aa  647    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2445  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  65.6 
 
 		 517 aa  648    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0027  propionyl-CoA carboxylase  66.6 
 
 		 510 aa  654    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1836  Propionyl-CoA carboxylase  63.04 
 
 		 520 aa  647    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.101625  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2052  Propionyl-CoA carboxylase  63.83 
 
 		 518 aa  636    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00336851  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08220  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  66.32 
 
 		 537 aa  649    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.394862 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1346  Propionyl-CoA carboxylase  100 
 
 		 508 aa  1018    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1807  propionyl-CoA carboxylase  60.43 
 
 		 513 aa  632  1e-180  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.171719  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2360  propionyl-CoA carboxylase  61.1 
 
 		 513 aa  634  1e-180  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.306025  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2553  carboxyl transferase domain-containing protein  60.43 
 
 		 513 aa  630  1e-179  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2375  carboxyl transferase domain-containing protein  60.63 
 
 		 513 aa  630  1e-179  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2332  propionyl-CoA carboxylase  60.63 
 
 		 513 aa  631  1e-179  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2291  propionyl-CoA carboxylase  60.12 
 
 		 513 aa  629  1e-179  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0918842  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2608  carboxyl transferase domain protein  60.43 
 
 		 513 aa  630  1e-179  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.444131  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2552  carboxyl transferase domain-containing protein  60.63 
 
 		 513 aa  630  1e-179  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.953071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2807  carboxyl transferase domain protein  60.31 
 
 		 513 aa  629  1e-179  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000977821 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2516  carboxyl transferase domain protein  60.31 
 
 		 513 aa  630  1e-179  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2565  carboxyl transferase domain protein  61.32 
 
 		 513 aa  630  1e-179  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.89145e-17 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6415  Propionyl-CoA carboxylase  63.8 
 
 		 506 aa  628  1e-178  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0403  propionyl-CoA carboxylase  66.33 
 
 		 510 aa  624  1e-177  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2164  propionyl-CoA carboxylase  65.77 
 
 		 522 aa  617  1e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.207678  normal  0.196324 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2300  Sigma 54 interacting domain protein  66.53 
 
 		 513 aa  617  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.535149  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1646  propionyl-CoA carboxylase  66.12 
 
 		 524 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2212  Propionyl-CoA carboxylase  65.91 
 
 		 513 aa  611  1e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.000980367  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0008  Propionyl-CoA carboxylase  45.73 
 
 		 607 aa  455  1e-127  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2913  Propionyl-CoA carboxylase  45.19 
 
 		 586 aa  442  1e-123  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.615692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2122  Propionyl-CoA carboxylase  44.9 
 
 		 625 aa  445  1e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.893863  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2454  carboxyl transferase  43.38 
 
 		 612 aa  432  1e-120  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1593  Propionyl-CoA carboxylase  44.77 
 
 		 525 aa  403  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  42.3 
 
 		 508 aa  380  1e-104  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  40.35 
 
 		 515 aa  366  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  40.42 
 
 		 515 aa  365  1e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  42.51 
 
 		 517 aa  363  3e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  39.31 
 
 		 514 aa  363  3e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  41.86 
 
 		 531 aa  363  6e-99  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0379  carboxyl transferase  42.94 
 
 		 514 aa  360  3e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  40.85 
 
 		 513 aa  357  2.9999999999999997e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  39.85 
 
 		 516 aa  357  3.9999999999999996e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  40.49 
 
 		 516 aa  357  3.9999999999999996e-97  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  40.34 
 
 		 516 aa  356  5e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  40.27 
 
 		 531 aa  355  2e-96  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1593  carboxyl transferase  41.01 
 
 		 514 aa  354  2e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0139637  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  39.92 
 
 		 518 aa  354  2e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1817  Methylmalonyl-CoA carboxytransferase  40.52 
 
 		 517 aa  354  2.9999999999999997e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0335  carboxyl transferase  40.53 
 
 		 514 aa  353  4e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.868559  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  38.31 
 
 		 516 aa  352  8.999999999999999e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  41.06 
 
 		 530 aa  352  1e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0317  carboxyl transferase  40.33 
 
 		 514 aa  351  2e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  40 
 
 		 512 aa  350  4e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  41.45 
 
 		 518 aa  350  5e-95  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  38.12 
 
 		 516 aa  349  7e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  39.77 
 
 		 520 aa  348  9e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1316  carboxyl transferase  38.57 
 
 		 514 aa  348  2e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  40.9 
 
 		 529 aa  347  2e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  40.3 
 
 		 550 aa  347  3e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1632  carboxyl transferase  41.31 
 
 		 522 aa  346  5e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0077  carboxyl transferase  38.81 
 
 		 517 aa  346  7e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.371983  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2361  carboxyl transferase  40.2 
 
 		 513 aa  345  8e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000738755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  40.62 
 
 		 516 aa  345  2e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3695  carboxyl transferase  42.6 
 
 		 538 aa  344  2e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0411544 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0999  carboxyl transferase  42.42 
 
 		 527 aa  344  2e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0912  carboxyl transferase  41.12 
 
 		 510 aa  343  2.9999999999999997e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  38.42 
 
 		 512 aa  343  4e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3025  carboxyl transferase  41.43 
 
 		 532 aa  343  5e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.432014 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0950  carboxyl transferase  41.59 
 
 		 514 aa  342  8e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.216274 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4364  carboxyl transferase  41.37 
 
 		 541 aa  342  1e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  41.13 
 
 		 516 aa  342  1e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  38.65 
 
 		 517 aa  341  2e-92  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3092  carboxyl transferase  41.05 
 
 		 516 aa  341  2e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.391297  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1021  carboxyl transferase  41.16 
 
 		 531 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  40.3 
 
 		 530 aa  339  5e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1223  carboxyl transferase  39.84 
 
 		 517 aa  339  7e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00883657  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1325  carboxyl transferase  41.41 
 
 		 527 aa  338  9e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000015031 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3166  carboxyl transferase  40.33 
 
 		 521 aa  338  9.999999999999999e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0567033  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  39.11 
 
 		 522 aa  338  9.999999999999999e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  41.33 
 
 		 531 aa  338  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0553  carboxyl transferase  36.85 
 
 		 518 aa  338  1.9999999999999998e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.965666  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1281  carboxyl transferase  40.59 
 
 		 527 aa  338  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0271  carboxyl transferase  40.2 
 
 		 520 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.435103  normal  0.1429 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2974  carboxyl transferase  39.92 
 
 		 519 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  39.47 
 
 		 524 aa  337  2.9999999999999997e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  41.19 
 
 		 527 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2284  carboxyl transferase  39.62 
 
 		 522 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00152526  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0930  carboxyl transferase  40.92 
 
 		 518 aa  336  5e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3495  carboxyl transferase  39.25 
 
 		 540 aa  336  5e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0268  carboxyl transferase  39.62 
 
 		 523 aa  336  7e-91  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  40.84 
 
 		 527 aa  336  7e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  41.87 
 
 		 516 aa  336  7e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0156  carboxyl transferase  39.69 
 
 		 513 aa  335  9e-91  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.344953  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0053  carboxyl transferase  40.73 
 
 		 510 aa  335  1e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0947  carboxyl transferase  39.71 
 
 		 513 aa  335  1e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.592853  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1663  Propionyl-CoA carboxylase  42.32 
 
 		 560 aa  334  2e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  40.16 
 
 		 534 aa  334  3e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0250  carboxyl transferase  39.64 
 
 		 519 aa  334  3e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.135558  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  40.97 
 
 		 527 aa  333  4e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0821  carboxyl transferase  39.12 
 
 		 536 aa  333  5e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588825  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2611  Propionyl-CoA carboxylase  42.02 
 
 		 535 aa  333  6e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0201  carboxyl transferase  39.31 
 
 		 521 aa  333  6e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0217258  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0307  carboxyl transferase  38.65 
 
 		 516 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>