More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2445 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0033  propionyl-CoA carboxylase  63.56 
 
 		 510 aa  650    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2553  carboxyl transferase domain-containing protein  80.78 
 
 		 513 aa  868    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2516  carboxyl transferase domain protein  80.98 
 
 		 513 aa  870    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2375  carboxyl transferase domain-containing protein  80.59 
 
 		 513 aa  866    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2332  propionyl-CoA carboxylase  80.59 
 
 		 513 aa  867    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2291  propionyl-CoA carboxylase  80.59 
 
 		 513 aa  866    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0918842  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2300  Sigma 54 interacting domain protein  70.1 
 
 		 513 aa  709    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.535149  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1346  Propionyl-CoA carboxylase  65.6 
 
 		 508 aa  648    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2212  Propionyl-CoA carboxylase  69.9 
 
 		 513 aa  706    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.000980367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2552  carboxyl transferase domain-containing protein  80.59 
 
 		 513 aa  866    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.953071  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1646  propionyl-CoA carboxylase  69.67 
 
 		 524 aa  711    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0027  propionyl-CoA carboxylase  64.43 
 
 		 510 aa  664    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6415  Propionyl-CoA carboxylase  62.97 
 
 		 506 aa  640    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2186  Propionyl-CoA carboxylase  64.19 
 
 		 523 aa  654    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2164  propionyl-CoA carboxylase  70.78 
 
 		 522 aa  716    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.207678  normal  0.196324 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2608  carboxyl transferase domain protein  80.78 
 
 		 513 aa  868    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.444131  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1836  Propionyl-CoA carboxylase  91.39 
 
 		 520 aa  976    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.101625  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2807  carboxyl transferase domain protein  80.98 
 
 		 513 aa  870    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000977821 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2052  Propionyl-CoA carboxylase  77.8 
 
 		 518 aa  816    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00336851  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2445  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  100 
 
 		 517 aa  1056    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2565  carboxyl transferase domain protein  80.59 
 
 		 513 aa  867    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.89145e-17 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1807  propionyl-CoA carboxylase  80.27 
 
 		 513 aa  866    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.171719  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2360  propionyl-CoA carboxylase  81.57 
 
 		 513 aa  875    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.306025  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08220  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  60.27 
 
 		 537 aa  628  1e-179  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.394862 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0403  propionyl-CoA carboxylase  63.86 
 
 		 510 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0008  Propionyl-CoA carboxylase  46.72 
 
 		 607 aa  505  9.999999999999999e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2122  Propionyl-CoA carboxylase  47.46 
 
 		 625 aa  489  1e-137  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.893863  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2454  carboxyl transferase  45.13 
 
 		 612 aa  473  1e-132  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2913  Propionyl-CoA carboxylase  45.44 
 
 		 586 aa  456  1e-127  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.615692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1593  Propionyl-CoA carboxylase  45.37 
 
 		 525 aa  425  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  42.3 
 
 		 508 aa  392  1e-107  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2284  carboxyl transferase  43.47 
 
 		 522 aa  388  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00152526  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  43.11 
 
 		 516 aa  387  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  40.74 
 
 		 515 aa  379  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  40.54 
 
 		 518 aa  375  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  40.55 
 
 		 515 aa  377  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0307  carboxyl transferase  42.5 
 
 		 516 aa  375  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  39.18 
 
 		 516 aa  366  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  41.04 
 
 		 512 aa  367  1e-100  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  39.49 
 
 		 514 aa  365  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  39.07 
 
 		 537 aa  364  3e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  39.3 
 
 		 516 aa  363  6e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  39.66 
 
 		 527 aa  362  6e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  38.79 
 
 		 516 aa  362  1e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  39.18 
 
 		 517 aa  360  2e-98  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0950  carboxyl transferase  40.16 
 
 		 514 aa  360  5e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.216274 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  39.73 
 
 		 527 aa  359  6e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  38.54 
 
 		 531 aa  358  9.999999999999999e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3695  carboxyl transferase  38.92 
 
 		 538 aa  358  9.999999999999999e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0411544 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  39.66 
 
 		 520 aa  357  1.9999999999999998e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1593  carboxyl transferase  40.15 
 
 		 514 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0139637  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  38.88 
 
 		 527 aa  356  5e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0999  carboxyl transferase  40.35 
 
 		 527 aa  355  1e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  39.42 
 
 		 512 aa  355  1e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  38.36 
 
 		 546 aa  354  2e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.35884 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0250  carboxyl transferase  39.69 
 
 		 519 aa  354  2e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.135558  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0268  carboxyl transferase  40.19 
 
 		 523 aa  354  2.9999999999999997e-96  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0489  carboxyl transferase  38.78 
 
 		 520 aa  354  2.9999999999999997e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3495  carboxyl transferase  38.65 
 
 		 540 aa  354  2.9999999999999997e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0379  carboxyl transferase  39.58 
 
 		 514 aa  353  4e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  39.03 
 
 		 530 aa  353  5.9999999999999994e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1072  methylcrotonyl-CoA carboxylase carboxyl transferase subunit  39.14 
 
 		 554 aa  352  7e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.19286  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1612  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  39.69 
 
 		 542 aa  352  1e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.171186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0948  propionyl-CoA carboxylase  39.21 
 
 		 541 aa  351  2e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00939936  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3989  carboxyl transferase  38.53 
 
 		 534 aa  350  2e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.356314 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0964  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  39.14 
 
 		 535 aa  350  2e-95  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2361  carboxyl transferase  41.06 
 
 		 513 aa  351  2e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000738755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0317  carboxyl transferase  38.79 
 
 		 514 aa  351  2e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0260  carboxyl transferase  39.5 
 
 		 519 aa  351  2e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2513  carboxyl transferase  39.5 
 
 		 510 aa  351  2e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152871  normal  0.332227 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1790  hypothetical protein  39.2 
 
 		 535 aa  350  3e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2154  methylcrotonoyl-CoA carboxylase  39.84 
 
 		 529 aa  350  3e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  40.4 
 
 		 516 aa  350  3e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0271  Propionyl-CoA carboxylase  39.31 
 
 		 519 aa  350  3e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.846145  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4364  carboxyl transferase  38.34 
 
 		 541 aa  350  4e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0335  carboxyl transferase  38.67 
 
 		 514 aa  350  4e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.868559  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2571  propionyl-CoA carboxylase  38.45 
 
 		 535 aa  349  5e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  39.15 
 
 		 529 aa  349  6e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3166  carboxyl transferase  40.08 
 
 		 521 aa  349  7e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0567033  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0291  carboxyl transferase  38.49 
 
 		 519 aa  349  7e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  39.15 
 
 		 524 aa  348  1e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  39.26 
 
 		 513 aa  348  2e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0053  carboxyl transferase  38.4 
 
 		 510 aa  348  2e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  39.11 
 
 		 517 aa  348  2e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  38.76 
 
 		 531 aa  348  2e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0340  propionyl-CoA carboxylase  37.14 
 
 		 536 aa  347  2e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  39.46 
 
 		 516 aa  348  2e-94  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1877  propionyl-CoA carboxylase  38.8 
 
 		 510 aa  347  2e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2611  Propionyl-CoA carboxylase  38.26 
 
 		 535 aa  347  3e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1016  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  39.19 
 
 		 510 aa  347  3e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3755  carboxyl transferase  39.11 
 
 		 510 aa  347  3e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0296123  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0271  carboxyl transferase  38.89 
 
 		 520 aa  347  3e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.435103  normal  0.1429 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0309  putative acyl-CoA carboxylase (beta subunit) protein  38.29 
 
 		 536 aa  347  4e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.155746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  39.04 
 
 		 518 aa  347  4e-94  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3484  carboxyl transferase  38.6 
 
 		 510 aa  346  5e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1021  carboxyl transferase  37.38 
 
 		 531 aa  346  6e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0156  carboxyl transferase  40.7 
 
 		 513 aa  346  7e-94  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.344953  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2130  carboxyl transferase  38.65 
 
 		 514 aa  346  7e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.955323  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000378  methylcrotonyl-CoA carboxylase carboxyl transferase subunit  38.61 
 
 		 535 aa  345  8e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.723902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5659  carboxyl transferase  37.28 
 
 		 510 aa  345  1e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>