More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1836 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_2553  carboxyl transferase domain-containing protein  81.37 
 
 
513 aa  874    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2375  carboxyl transferase domain-containing protein  80.78 
 
 
513 aa  870    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2332  propionyl-CoA carboxylase  80.98 
 
 
513 aa  873    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2291  propionyl-CoA carboxylase  80.98 
 
 
513 aa  872    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0918842  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2360  propionyl-CoA carboxylase  81.76 
 
 
513 aa  880    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.306025  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08220  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  62.3 
 
 
537 aa  634    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.394862 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1807  propionyl-CoA carboxylase  80.98 
 
 
513 aa  872    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.171719  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2516  carboxyl transferase domain protein  81.37 
 
 
513 aa  875    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2552  carboxyl transferase domain-containing protein  80.78 
 
 
513 aa  870    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.953071  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1646  propionyl-CoA carboxylase  68.88 
 
 
524 aa  717    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2186  Propionyl-CoA carboxylase  62.43 
 
 
523 aa  644    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2565  carboxyl transferase domain protein  80.98 
 
 
513 aa  872    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.89145e-17 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2445  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  91.39 
 
 
517 aa  976    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6415  Propionyl-CoA carboxylase  62.32 
 
 
506 aa  641    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0033  propionyl-CoA carboxylase  62.45 
 
 
510 aa  650    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2300  Sigma 54 interacting domain protein  68.49 
 
 
513 aa  718    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.535149  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2052  Propionyl-CoA carboxylase  75.44 
 
 
518 aa  804    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00336851  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0027  propionyl-CoA carboxylase  62.85 
 
 
510 aa  661    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2212  Propionyl-CoA carboxylase  68.3 
 
 
513 aa  714    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.000980367  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2608  carboxyl transferase domain protein  81.37 
 
 
513 aa  874    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.444131  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2807  carboxyl transferase domain protein  81.37 
 
 
513 aa  875    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000977821 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1836  Propionyl-CoA carboxylase  100 
 
 
520 aa  1067    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.101625  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1346  Propionyl-CoA carboxylase  63.04 
 
 
508 aa  647    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2164  propionyl-CoA carboxylase  70.3 
 
 
522 aa  722    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.207678  normal  0.196324 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0403  propionyl-CoA carboxylase  62.53 
 
 
510 aa  616  1e-175  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0008  Propionyl-CoA carboxylase  47.57 
 
 
607 aa  509  1e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2122  Propionyl-CoA carboxylase  47.07 
 
 
625 aa  495  9.999999999999999e-139  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.893863  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2454  carboxyl transferase  44.94 
 
 
612 aa  476  1e-133  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2913  Propionyl-CoA carboxylase  46.12 
 
 
586 aa  464  1e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.615692  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1593  Propionyl-CoA carboxylase  43.46 
 
 
525 aa  417  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  42.47 
 
 
516 aa  394  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  41.33 
 
 
508 aa  394  1e-108  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2284  carboxyl transferase  41.32 
 
 
522 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00152526  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  40.27 
 
 
515 aa  380  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  40.19 
 
 
515 aa  382  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  39.5 
 
 
518 aa  379  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0307  carboxyl transferase  39.92 
 
 
516 aa  375  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  40.81 
 
 
512 aa  374  1e-102  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  39.07 
 
 
517 aa  369  1e-101  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  38.99 
 
 
516 aa  371  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  39.49 
 
 
514 aa  368  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0950  carboxyl transferase  40.87 
 
 
514 aa  367  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.216274 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  38.25 
 
 
516 aa  365  1e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  38.64 
 
 
531 aa  363  3e-99  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3695  carboxyl transferase  40.79 
 
 
538 aa  362  8e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0411544 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  39.38 
 
 
512 aa  362  1e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  38.91 
 
 
527 aa  360  3e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  38.25 
 
 
516 aa  360  3e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0999  carboxyl transferase  40.19 
 
 
527 aa  360  3e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0291  carboxyl transferase  39.03 
 
 
519 aa  360  3e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2728  propionyl-CoA carboxylase  39.84 
 
 
535 aa  359  6e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  38.36 
 
 
520 aa  359  8e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2571  propionyl-CoA carboxylase  39.16 
 
 
535 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  38.06 
 
 
527 aa  356  3.9999999999999996e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1790  hypothetical protein  39.72 
 
 
535 aa  356  5e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0379  carboxyl transferase  40.46 
 
 
514 aa  356  6.999999999999999e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  37.64 
 
 
537 aa  355  1e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  38.1 
 
 
529 aa  355  1e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3561  propionyl-CoA carboxylase  38.66 
 
 
535 aa  354  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.507215 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  39.08 
 
 
517 aa  355  2e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  37.88 
 
 
527 aa  354  2e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1593  carboxyl transferase  39.01 
 
 
514 aa  354  2e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0139637  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3166  carboxyl transferase  39.17 
 
 
521 aa  354  2.9999999999999997e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0567033  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000378  methylcrotonyl-CoA carboxylase carboxyl transferase subunit  39.44 
 
 
535 aa  353  4e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.723902  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3224  propionyl-CoA carboxylase  38.95 
 
 
535 aa  353  4e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.809195  normal  0.0163606 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0489  carboxyl transferase  38.61 
 
 
520 aa  353  4e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2513  carboxyl transferase  38.03 
 
 
510 aa  353  5e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152871  normal  0.332227 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5033  propionyl-CoA carboxylase  38.55 
 
 
535 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3495  carboxyl transferase  38.15 
 
 
540 aa  352  8e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1791  hypothetical protein  39.92 
 
 
535 aa  352  8.999999999999999e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  38.31 
 
 
546 aa  352  8.999999999999999e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.35884 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5120  propionyl-CoA carboxylase  38.1 
 
 
535 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0213028  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  39.8 
 
 
516 aa  352  1e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  38.49 
 
 
524 aa  352  1e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2829  propionyl-CoA carboxylase  39.43 
 
 
535 aa  351  2e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1877  propionyl-CoA carboxylase  39.04 
 
 
510 aa  351  2e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1612  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  39.92 
 
 
542 aa  351  2e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.171186  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1663  Propionyl-CoA carboxylase  38.34 
 
 
560 aa  351  2e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  37.5 
 
 
530 aa  350  3e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  39.01 
 
 
531 aa  350  3e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2974  propionyl-CoA carboxylase  39.43 
 
 
535 aa  350  3e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.562625 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2246  propionyl-CoA carboxylase  38.82 
 
 
552 aa  350  3e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3128  propionyl-CoA carboxylase  38.35 
 
 
535 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0763689  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5239  propionyl-CoA carboxylase  38.35 
 
 
535 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.954301  normal  0.755359 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1529  Propionyl-CoA carboxylase  39.43 
 
 
535 aa  350  3e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2847  propionyl-CoA carboxylase  39.23 
 
 
535 aa  350  4e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0309  putative acyl-CoA carboxylase (beta subunit) protein  37.9 
 
 
536 aa  350  4e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.155746  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0821  carboxyl transferase  37.02 
 
 
536 aa  350  4e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588825  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4587  propionyl-CoA carboxylase  38.1 
 
 
535 aa  350  4e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  38.45 
 
 
513 aa  350  5e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0268  carboxyl transferase  39.11 
 
 
523 aa  349  6e-95  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0317  carboxyl transferase  37.55 
 
 
514 aa  349  6e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  38.29 
 
 
518 aa  349  6e-95  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0340  propionyl-CoA carboxylase  37.07 
 
 
536 aa  349  6e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1457  propionyl-CoA carboxylase  39.23 
 
 
535 aa  349  6e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.883387 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2395  propionyl-CoA carboxylase  39.43 
 
 
535 aa  349  6e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.955899 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2123  propionyl-CoA carboxylase  38.89 
 
 
535 aa  349  6e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  37.5 
 
 
516 aa  349  7e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0424  propionyl-CoA carboxylase  37.7 
 
 
535 aa  349  7e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1671  carboxyl transferase  39.43 
 
 
535 aa  349  7e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>