More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6415 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_2553  carboxyl transferase domain-containing protein  61.77 
 
 
513 aa  643    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2375  carboxyl transferase domain-containing protein  61.77 
 
 
513 aa  642    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2332  propionyl-CoA carboxylase  61.77 
 
 
513 aa  643    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2291  propionyl-CoA carboxylase  61.57 
 
 
513 aa  642    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0918842  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6415  Propionyl-CoA carboxylase  100 
 
 
506 aa  1027    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1807  propionyl-CoA carboxylase  62.37 
 
 
513 aa  650    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.171719  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1346  Propionyl-CoA carboxylase  63.8 
 
 
508 aa  636    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2608  carboxyl transferase domain protein  61.77 
 
 
513 aa  643    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.444131  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2552  carboxyl transferase domain-containing protein  61.77 
 
 
513 aa  642    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.953071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2807  carboxyl transferase domain protein  61.97 
 
 
513 aa  645    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000977821 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1836  Propionyl-CoA carboxylase  62.32 
 
 
520 aa  652    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.101625  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2516  carboxyl transferase domain protein  61.97 
 
 
513 aa  646    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2186  Propionyl-CoA carboxylase  77.21 
 
 
523 aa  797    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0033  propionyl-CoA carboxylase  81.04 
 
 
510 aa  827    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2445  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  62.97 
 
 
517 aa  654    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2052  Propionyl-CoA carboxylase  62.57 
 
 
518 aa  642    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00336851  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0403  propionyl-CoA carboxylase  73.07 
 
 
510 aa  746    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0027  propionyl-CoA carboxylase  81.64 
 
 
510 aa  838    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2565  carboxyl transferase domain protein  61.57 
 
 
513 aa  642    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.89145e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2360  propionyl-CoA carboxylase  62.17 
 
 
513 aa  648    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.306025  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2212  Propionyl-CoA carboxylase  62.13 
 
 
513 aa  619  1e-176  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.000980367  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2300  Sigma 54 interacting domain protein  61.93 
 
 
513 aa  616  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.535149  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1646  propionyl-CoA carboxylase  62.58 
 
 
524 aa  614  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2164  propionyl-CoA carboxylase  61.72 
 
 
522 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.207678  normal  0.196324 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08220  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  62.9 
 
 
537 aa  613  9.999999999999999e-175  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.394862 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0008  Propionyl-CoA carboxylase  43.88 
 
 
607 aa  449  1e-125  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2122  Propionyl-CoA carboxylase  44.75 
 
 
625 aa  442  1e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.893863  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2913  Propionyl-CoA carboxylase  45.51 
 
 
586 aa  441  9.999999999999999e-123  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.615692  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2454  carboxyl transferase  43.52 
 
 
612 aa  435  1e-121  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  41.85 
 
 
508 aa  392  1e-108  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1593  Propionyl-CoA carboxylase  44.05 
 
 
525 aa  389  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  40.66 
 
 
516 aa  384  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  42.02 
 
 
531 aa  384  1e-105  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  41.45 
 
 
513 aa  378  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  42.28 
 
 
530 aa  378  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  39.11 
 
 
515 aa  373  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  39.49 
 
 
516 aa  373  1e-102  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0489  carboxyl transferase  40.82 
 
 
520 aa  373  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  40.57 
 
 
536 aa  374  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  40.47 
 
 
516 aa  372  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  39.49 
 
 
518 aa  374  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  40.08 
 
 
516 aa  371  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  38.91 
 
 
515 aa  370  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  40.27 
 
 
534 aa  369  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  39.45 
 
 
512 aa  372  1e-101  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2284  carboxyl transferase  41.49 
 
 
522 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00152526  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2361  carboxyl transferase  40.35 
 
 
513 aa  366  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000738755  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  41.01 
 
 
531 aa  365  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  38.33 
 
 
514 aa  365  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  42.25 
 
 
516 aa  367  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  41.41 
 
 
550 aa  368  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1248  carboxyl transferase  40.83 
 
 
522 aa  368  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  39.19 
 
 
516 aa  367  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  41.63 
 
 
518 aa  365  1e-99  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  39.3 
 
 
517 aa  364  2e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0291  carboxyl transferase  39.76 
 
 
519 aa  364  2e-99  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  39.81 
 
 
527 aa  364  2e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3025  carboxyl transferase  41.39 
 
 
532 aa  364  2e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.432014 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  41.76 
 
 
516 aa  363  3e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  41.36 
 
 
524 aa  363  3e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0379  carboxyl transferase  40.55 
 
 
514 aa  362  7.0000000000000005e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  40.19 
 
 
537 aa  361  2e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  40.58 
 
 
529 aa  360  3e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  41.02 
 
 
551 aa  360  4e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1041  carboxyl transferase  41.21 
 
 
542 aa  359  5e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1632  carboxyl transferase  39.84 
 
 
522 aa  359  6e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  38.97 
 
 
546 aa  359  7e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.35884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  40 
 
 
530 aa  358  8e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4364  carboxyl transferase  40.65 
 
 
541 aa  358  9.999999999999999e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  39.16 
 
 
527 aa  358  9.999999999999999e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  39.92 
 
 
522 aa  358  9.999999999999999e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  42.43 
 
 
516 aa  357  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0947  carboxyl transferase  39.29 
 
 
513 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.592853  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4230  carboxyl transferase  39.43 
 
 
552 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551859  normal  0.395293 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  37.45 
 
 
512 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0051  carboxyl transferase  39.96 
 
 
517 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.253581  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2974  carboxyl transferase  39.92 
 
 
519 aa  355  8.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3166  carboxyl transferase  39.69 
 
 
521 aa  355  8.999999999999999e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0567033  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  39.49 
 
 
531 aa  355  1e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1325  carboxyl transferase  40.04 
 
 
527 aa  355  1e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000015031 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0553  carboxyl transferase  37.84 
 
 
518 aa  355  1e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.965666  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1316  carboxyl transferase  38.84 
 
 
514 aa  353  4e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1215  methylmalonyl-CoA decarboxylase alpha chain  42.61 
 
 
519 aa  353  4e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.336846  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0156  carboxyl transferase  39.85 
 
 
513 aa  353  4e-96  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.344953  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3495  carboxyl transferase  39.69 
 
 
540 aa  352  5.9999999999999994e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1223  carboxyl transferase  38.72 
 
 
517 aa  352  7e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00883657  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0850  carboxyl transferase  38.99 
 
 
526 aa  352  1e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000103034  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3695  carboxyl transferase  39.65 
 
 
538 aa  352  1e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0411544 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1281  carboxyl transferase  39.85 
 
 
527 aa  352  1e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0034  carboxyl transferase  40.55 
 
 
516 aa  352  1e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182676  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3083  carboxyl transferase  40.55 
 
 
516 aa  352  1e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0002503  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0889  carboxyl transferase  38.9 
 
 
564 aa  352  1e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0950  carboxyl transferase  40.04 
 
 
514 aa  350  3e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.216274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0821  carboxyl transferase  39.54 
 
 
536 aa  350  5e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588825  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2348  carboxyl transferase  38.79 
 
 
512 aa  350  5e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0077  carboxyl transferase  38.57 
 
 
517 aa  349  7e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.371983  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1021  carboxyl transferase  38.87 
 
 
531 aa  349  8e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6390  carboxyl transferase  38.87 
 
 
543 aa  348  1e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0531526  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1330  carboxyl transferase  39.39 
 
 
556 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0639  carboxyl transferase  38.87 
 
 
513 aa  348  1e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.629685 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>