More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1862 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2692  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  60.63 
 
 		 1091 aa  744    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.246578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2997  pyruvate carboxylase., propionyl-CoA carboxylase  62.32 
 
 		 1112 aa  726    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.717985  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3892  pyruvate carboxylase., propionyl-CoA carboxylase  57.96 
 
 		 1105 aa  654    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.222877  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2413  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  62.76 
 
 		 1103 aa  753    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.370889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3842  pyruvate carboxylase., propionyl-CoA carboxylase  62.66 
 
 		 1090 aa  726    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.735507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0228  pyruvate carboxylase  58.2 
 
 		 1102 aa  707    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1872  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding protein  60.85 
 
 		 1054 aa  647    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1073  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  61.39 
 
 		 1097 aa  672    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.398596 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3899  propionyl-CoA carboxylase  56.49 
 
 		 610 aa  651    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1636  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  59.57 
 
 		 1103 aa  734    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0325  putative carbamoyl-phosphate synthase/carboxyltransferase  59.93 
 
 		 1033 aa  683    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00413632  normal  0.277217 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0602  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  59.02 
 
 		 1102 aa  721    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4069  acetyl-CoA carboxylase (biotin carboxylase and carboxyl transferase domains) / biotin carboxyl carrier protein  58.46 
 
 		 1126 aa  676    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0299228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4971  putative carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  58.46 
 
 		 1152 aa  659    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.266349  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2019  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  62.25 
 
 		 1103 aa  746    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4464  pyruvate carboxylase., methylmalonyl-CoA carboxytransferase  60.3 
 
 		 1067 aa  683    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0495259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1862  carboxyl transferase  100 
 
 		 602 aa  1196    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00333639  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46320  putative pyruvate carboxylase  59.77 
 
 		 1095 aa  684    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.948302  normal  0.0234216 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4792  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  59.18 
 
 		 1098 aa  668    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3940  biotin carboxylase  60 
 
 		 1095 aa  676    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1682  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  60.26 
 
 		 1097 aa  702    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2867  pyruvate carboxylase, propionyl-CoA carboxylase  52.79 
 
 		 1094 aa  638    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1889  propionyl-CoA carboxylase  58.19 
 
 		 519 aa  620  1e-176  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2712  carboxyl transferase  60.84 
 
 		 524 aa  602  1.0000000000000001e-171  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0757047  normal  0.0196449 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0066  propionyl-CoA carboxylase  60.15 
 
 		 519 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2710  propionyl-CoA carboxylase  60.04 
 
 		 503 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.595961  normal  0.61988 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2679  propionyl-CoA carboxylase  59.84 
 
 		 503 aa  575  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2724  propionyl-CoA carboxylase  59.84 
 
 		 503 aa  575  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173098 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0781  propionyl-CoA carboxylase  62.21 
 
 		 518 aa  574  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.576525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1271  propionyl-CoA carboxylase  47.01 
 
 		 600 aa  520  1e-146  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1593  Propionyl-CoA carboxylase  36.17 
 
 		 525 aa  266  8.999999999999999e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1906  carboxyl transferase  37.48 
 
 		 527 aa  262  2e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.187431  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  31.25 
 
 		 512 aa  247  4.9999999999999997e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0379  carboxyl transferase  33.07 
 
 		 514 aa  246  8e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3025  carboxyl transferase  31.66 
 
 		 532 aa  242  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.432014 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0335  carboxyl transferase  32.03 
 
 		 514 aa  242  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.868559  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0317  carboxyl transferase  31.84 
 
 		 514 aa  241  4e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1346  Propionyl-CoA carboxylase  36.83 
 
 		 508 aa  239  1e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  32.38 
 
 		 515 aa  237  5.0000000000000005e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4157  carboxyl transferase  36.78 
 
 		 475 aa  234  3e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3307  propionyl-CoA carboxylase  30.28 
 
 		 517 aa  234  4.0000000000000004e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  31.29 
 
 		 515 aa  232  2e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3097  propionyl-CoA carboxylase  33.6 
 
 		 518 aa  230  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.079837 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  30.18 
 
 		 512 aa  230  5e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1593  carboxyl transferase  29.86 
 
 		 514 aa  230  6e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0139637  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0553  carboxyl transferase  29.94 
 
 		 518 aa  230  7e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.965666  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0034  carboxyl transferase  32.81 
 
 		 516 aa  229  8e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182676  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3083  carboxyl transferase  32.81 
 
 		 516 aa  229  8e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0002503  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  33.4 
 
 		 534 aa  229  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1807  propionyl-CoA carboxylase  31.45 
 
 		 513 aa  228  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.171719  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3945  Propionyl-CoA carboxylase  32.74 
 
 		 519 aa  228  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0999  carboxyl transferase  31.53 
 
 		 527 aa  227  5.0000000000000005e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  30.88 
 
 		 516 aa  227  6e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  32.38 
 
 		 516 aa  226  7e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6937  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  34.83 
 
 		 559 aa  226  8e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100753  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0447  acyl CoA biotin-dependant carboxyltransferase  32.3 
 
 		 516 aa  226  1e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  31.59 
 
 		 529 aa  226  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3419  Propionyl-CoA carboxylase  32.67 
 
 		 515 aa  226  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0424  carboxyl transferase  32.08 
 
 		 516 aa  226  1e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_389  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  32.48 
 
 		 516 aa  226  1e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.839187  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2974  carboxyl transferase  33.47 
 
 		 515 aa  226  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1041  carboxyl transferase  32.79 
 
 		 542 aa  225  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0268  carboxyl transferase  33.74 
 
 		 523 aa  224  3e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  31.62 
 
 		 508 aa  224  4e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2361  carboxyl transferase  31.1 
 
 		 513 aa  223  7e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000738755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  33.19 
 
 		 513 aa  223  8e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1375  propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit alpha / propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit beta  32.99 
 
 		 524 aa  223  8e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0140013 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  32.27 
 
 		 530 aa  223  9e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  32.94 
 
 		 530 aa  223  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2284  carboxyl transferase  32.47 
 
 		 522 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00152526  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  31.63 
 
 		 537 aa  223  9.999999999999999e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  30.1 
 
 		 518 aa  223  9.999999999999999e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  31.64 
 
 		 516 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  32.16 
 
 		 546 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.35884 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2593  propionyl-CoA carboxylase  31.66 
 
 		 505 aa  221  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2360  propionyl-CoA carboxylase  32.08 
 
 		 513 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.306025  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2807  carboxyl transferase domain protein  31.87 
 
 		 513 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000977821 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2516  carboxyl transferase domain protein  31.87 
 
 		 513 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0291  carboxyl transferase  31.57 
 
 		 519 aa  221  3e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0821  carboxyl transferase  31.56 
 
 		 536 aa  221  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588825  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1836  Propionyl-CoA carboxylase  32.39 
 
 		 520 aa  221  3e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.101625  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  32.48 
 
 		 527 aa  221  3.9999999999999997e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  31.89 
 
 		 520 aa  221  3.9999999999999997e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  31.84 
 
 		 517 aa  220  5e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  32.39 
 
 		 531 aa  220  5e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2445  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  32.71 
 
 		 517 aa  220  5e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  31.68 
 
 		 516 aa  220  5e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2375  carboxyl transferase domain-containing protein  31.15 
 
 		 513 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2552  carboxyl transferase domain-containing protein  31.15 
 
 		 513 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.953071  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0947  carboxyl transferase  32.22 
 
 		 513 aa  219  7.999999999999999e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.592853  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2565  carboxyl transferase domain protein  31.87 
 
 		 513 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.89145e-17 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2186  Propionyl-CoA carboxylase  33.61 
 
 		 523 aa  219  8.999999999999998e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2553  carboxyl transferase domain-containing protein  31.66 
 
 		 513 aa  219  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2291  propionyl-CoA carboxylase  31.66 
 
 		 513 aa  219  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0918842  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0051  carboxyl transferase  32.94 
 
 		 517 aa  219  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.253581  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2608  carboxyl transferase domain protein  31.66 
 
 		 513 aa  219  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.444131  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0027  propionyl-CoA carboxylase  35.04 
 
 		 510 aa  219  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6502  carboxyl transferase  33.95 
 
 		 529 aa  219  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838117  normal  0.279453 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1248  carboxyl transferase  32.39 
 
 		 522 aa  219  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2052  Propionyl-CoA carboxylase  35.47 
 
 		 518 aa  218  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00336851  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>