More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0066 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2712  carboxyl transferase  78.01 
 
 		 524 aa  748    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0757047  normal  0.0196449 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0781  propionyl-CoA carboxylase  88.42 
 
 		 518 aa  860    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.576525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2679  propionyl-CoA carboxylase  79.92 
 
 		 503 aa  796    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2710  propionyl-CoA carboxylase  80.12 
 
 		 503 aa  797    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.595961  normal  0.61988 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2724  propionyl-CoA carboxylase  79.92 
 
 		 503 aa  796    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173098 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0066  propionyl-CoA carboxylase  100 
 
 		 519 aa  1025    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1636  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  53.82 
 
 		 1103 aa  552  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0602  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  55.25 
 
 		 1102 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0228  pyruvate carboxylase  55.45 
 
 		 1102 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3940  biotin carboxylase  57.66 
 
 		 1095 aa  545  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2997  pyruvate carboxylase., propionyl-CoA carboxylase  54.86 
 
 		 1112 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.717985  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2019  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  54.17 
 
 		 1103 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46320  putative pyruvate carboxylase  57.28 
 
 		 1095 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.948302  normal  0.0234216 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2413  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  53.41 
 
 		 1103 aa  536  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.370889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1862  carboxyl transferase  60.19 
 
 		 602 aa  532  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00333639  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4069  acetyl-CoA carboxylase (biotin carboxylase and carboxyl transferase domains) / biotin carboxyl carrier protein  54.29 
 
 		 1126 aa  527  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0299228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1682  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  52.76 
 
 		 1097 aa  525  1e-148  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3842  pyruvate carboxylase., propionyl-CoA carboxylase  52.49 
 
 		 1090 aa  522  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.735507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4464  pyruvate carboxylase., methylmalonyl-CoA carboxytransferase  55.21 
 
 		 1067 aa  524  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0495259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2692  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  50.48 
 
 		 1091 aa  516  1.0000000000000001e-145  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.246578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2867  pyruvate carboxylase, propionyl-CoA carboxylase  48.66 
 
 		 1094 aa  513  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4792  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  50.95 
 
 		 1098 aa  507  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1872  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding protein  56.85 
 
 		 1054 aa  505  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4971  putative carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  53.33 
 
 		 1152 aa  504  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.266349  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3892  pyruvate carboxylase., propionyl-CoA carboxylase  52.76 
 
 		 1105 aa  501  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.222877  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0325  putative carbamoyl-phosphate synthase/carboxyltransferase  52.82 
 
 		 1033 aa  499  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00413632  normal  0.277217 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3899  propionyl-CoA carboxylase  51.92 
 
 		 610 aa  491  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1073  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  52.38 
 
 		 1097 aa  491  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.398596 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1889  propionyl-CoA carboxylase  49.05 
 
 		 519 aa  491  1e-137  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1271  propionyl-CoA carboxylase  46.2 
 
 		 600 aa  449  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1906  carboxyl transferase  37.96 
 
 		 527 aa  255  1.0000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.187431  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1593  Propionyl-CoA carboxylase  33.98 
 
 		 525 aa  253  7e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  30.87 
 
 		 515 aa  248  1e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  31.07 
 
 		 515 aa  247  3e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  30.52 
 
 		 512 aa  241  2e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  34.14 
 
 		 527 aa  237  3e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  33.21 
 
 		 537 aa  237  3e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  34 
 
 		 527 aa  236  9e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3025  carboxyl transferase  32.02 
 
 		 532 aa  235  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.432014 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  31.58 
 
 		 508 aa  234  3e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4157  carboxyl transferase  36.67 
 
 		 475 aa  234  3e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1346  Propionyl-CoA carboxylase  34.4 
 
 		 508 aa  234  4.0000000000000004e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  35.48 
 
 		 524 aa  233  6e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  34.21 
 
 		 530 aa  233  6e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0335  carboxyl transferase  31.95 
 
 		 514 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.868559  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0051  carboxyl transferase  33.01 
 
 		 517 aa  232  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.253581  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  33.47 
 
 		 534 aa  230  4e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0317  carboxyl transferase  32.64 
 
 		 514 aa  230  5e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4364  carboxyl transferase  33.73 
 
 		 541 aa  230  6e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21120  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  33.6 
 
 		 529 aa  229  7e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0918457  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  33.14 
 
 		 536 aa  228  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  34.14 
 
 		 530 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3307  propionyl-CoA carboxylase  29.32 
 
 		 517 aa  228  2e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448446  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1041  carboxyl transferase  33.88 
 
 		 542 aa  228  3e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  29.87 
 
 		 512 aa  227  4e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1817  Methylmalonyl-CoA carboxytransferase  31.41 
 
 		 517 aa  226  8e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0821  carboxyl transferase  33.67 
 
 		 536 aa  226  9e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588825  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3495  carboxyl transferase  34 
 
 		 540 aa  226  9e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6415  Propionyl-CoA carboxylase  33.82 
 
 		 506 aa  225  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1281  carboxyl transferase  32.41 
 
 		 527 aa  225  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0291  carboxyl transferase  31.84 
 
 		 519 aa  224  3e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  33.87 
 
 		 527 aa  224  4e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1325  carboxyl transferase  32.74 
 
 		 527 aa  224  4e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000015031 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4230  carboxyl transferase  32.28 
 
 		 552 aa  223  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551859  normal  0.395293 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0008  Propionyl-CoA carboxylase  32.35 
 
 		 607 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  31.62 
 
 		 516 aa  221  3e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1198  carboxyl transferase domain protein  32.18 
 
 		 548 aa  220  3.9999999999999997e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000462076 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5009  carboxyl transferase  32.66 
 
 		 516 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.270006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5097  carboxyl transferase  32.66 
 
 		 516 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0397187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5390  carboxyl transferase  32.66 
 
 		 516 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314967  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0379  carboxyl transferase  31.29 
 
 		 514 aa  219  6e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0034  carboxyl transferase  31.94 
 
 		 516 aa  219  7.999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182676  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3083  carboxyl transferase  31.94 
 
 		 516 aa  219  7.999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0002503  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0999  carboxyl transferase  31.32 
 
 		 527 aa  219  8.999999999999998e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  31.19 
 
 		 516 aa  219  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1248  carboxyl transferase  32.93 
 
 		 522 aa  219  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2186  Propionyl-CoA carboxylase  33.06 
 
 		 523 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  31.89 
 
 		 546 aa  218  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.35884 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0930  carboxyl transferase  30.56 
 
 		 518 aa  218  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  32.23 
 
 		 529 aa  218  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1593  carboxyl transferase  29.9 
 
 		 514 aa  218  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0139637  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0553  carboxyl transferase  30.15 
 
 		 518 aa  218  2.9999999999999998e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.965666  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  27.19 
 
 		 514 aa  217  2.9999999999999998e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  30.9 
 
 		 522 aa  216  7e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5639  carboxyl transferase  32.67 
 
 		 516 aa  216  7e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0912  carboxyl transferase  30.77 
 
 		 510 aa  216  9.999999999999999e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2361  carboxyl transferase  31.29 
 
 		 513 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000738755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6390  carboxyl transferase  32.82 
 
 		 543 aa  215  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0531526  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  31.26 
 
 		 516 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1021  carboxyl transferase  32.35 
 
 		 531 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  30.79 
 
 		 513 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1152  carboxyl transferase  32.93 
 
 		 529 aa  214  3.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579492  normal  0.513821 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1170  carboxyl transferase  32.33 
 
 		 516 aa  214  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.336373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  31.1 
 
 		 520 aa  214  3.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13833  propionyl-CoA carboxylase beta subunit 4 accD4  32.73 
 
 		 522 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0406479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  28.05 
 
 		 516 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3989  carboxyl transferase  33.2 
 
 		 534 aa  213  5.999999999999999e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.356314 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  30.56 
 
 		 516 aa  213  9e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  32.73 
 
 		 551 aa  212  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  29 
 
 		 518 aa  211  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>