More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0781 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0781  propionyl-CoA carboxylase  100 
 
 		 518 aa  1021    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.576525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2679  propionyl-CoA carboxylase  80.59 
 
 		 503 aa  784    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2710  propionyl-CoA carboxylase  80.79 
 
 		 503 aa  786    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.595961  normal  0.61988 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2724  propionyl-CoA carboxylase  80.59 
 
 		 503 aa  784    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173098 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0066  propionyl-CoA carboxylase  88.42 
 
 		 519 aa  879    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2712  carboxyl transferase  79.34 
 
 		 524 aa  759    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0757047  normal  0.0196449 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2997  pyruvate carboxylase., propionyl-CoA carboxylase  56.21 
 
 		 1112 aa  558  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.717985  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1636  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  55.11 
 
 		 1103 aa  558  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1862  carboxyl transferase  62.21 
 
 		 602 aa  551  1e-156  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00333639  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0602  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  53.61 
 
 		 1102 aa  549  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2019  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  54.75 
 
 		 1103 aa  547  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2413  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  54.75 
 
 		 1103 aa  548  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.370889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4464  pyruvate carboxylase., methylmalonyl-CoA carboxytransferase  56.21 
 
 		 1067 aa  548  1e-154  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0495259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3940  biotin carboxylase  58.29 
 
 		 1095 aa  544  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0228  pyruvate carboxylase  54.2 
 
 		 1102 aa  541  1e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4069  acetyl-CoA carboxylase (biotin carboxylase and carboxyl transferase domains) / biotin carboxyl carrier protein  55.64 
 
 		 1126 aa  542  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0299228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46320  putative pyruvate carboxylase  56.73 
 
 		 1095 aa  530  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.948302  normal  0.0234216 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3842  pyruvate carboxylase., propionyl-CoA carboxylase  54.14 
 
 		 1090 aa  526  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.735507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1682  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  52.58 
 
 		 1097 aa  527  1e-148  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2867  pyruvate carboxylase, propionyl-CoA carboxylase  49.9 
 
 		 1094 aa  522  1e-147  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2692  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  50.86 
 
 		 1091 aa  518  1.0000000000000001e-145  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.246578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4971  putative carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  54.49 
 
 		 1152 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.266349  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0325  putative carbamoyl-phosphate synthase/carboxyltransferase  53.52 
 
 		 1033 aa  511  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00413632  normal  0.277217 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3892  pyruvate carboxylase., propionyl-CoA carboxylase  53.15 
 
 		 1105 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.222877  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4792  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  51.81 
 
 		 1098 aa  508  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1073  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  52.96 
 
 		 1097 aa  508  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.398596 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1872  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding protein  57.2 
 
 		 1054 aa  504  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1889  propionyl-CoA carboxylase  49.71 
 
 		 519 aa  499  1e-140  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3899  propionyl-CoA carboxylase  50.96 
 
 		 610 aa  499  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1271  propionyl-CoA carboxylase  45.65 
 
 		 600 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1593  Propionyl-CoA carboxylase  34.71 
 
 		 525 aa  254  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  31.25 
 
 		 515 aa  248  2e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  31.31 
 
 		 515 aa  247  3e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1906  carboxyl transferase  36.29 
 
 		 527 aa  244  3.9999999999999997e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.187431  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3025  carboxyl transferase  31.46 
 
 		 532 aa  236  6e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.432014 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  31.54 
 
 		 512 aa  235  1.0000000000000001e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0051  carboxyl transferase  33.27 
 
 		 517 aa  227  3e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.253581  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0335  carboxyl transferase  30.97 
 
 		 514 aa  227  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.868559  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  30.55 
 
 		 508 aa  226  8e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  32.54 
 
 		 537 aa  226  9e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0379  carboxyl transferase  31.69 
 
 		 514 aa  225  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2361  carboxyl transferase  31.45 
 
 		 513 aa  225  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000738755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0317  carboxyl transferase  31.82 
 
 		 514 aa  224  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3307  propionyl-CoA carboxylase  30.12 
 
 		 517 aa  223  4.9999999999999996e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0291  carboxyl transferase  31.56 
 
 		 519 aa  223  9e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  32.34 
 
 		 527 aa  223  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1817  Methylmalonyl-CoA carboxytransferase  31.61 
 
 		 517 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0553  carboxyl transferase  29.79 
 
 		 518 aa  221  3e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.965666  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  29.89 
 
 		 512 aa  221  3e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  28.96 
 
 		 516 aa  220  3.9999999999999997e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3166  carboxyl transferase  30.68 
 
 		 521 aa  219  6e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0567033  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1346  Propionyl-CoA carboxylase  33.33 
 
 		 508 aa  220  6e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1248  carboxyl transferase  32.46 
 
 		 522 aa  218  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  31.13 
 
 		 520 aa  217  4e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  31.48 
 
 		 530 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  31.18 
 
 		 534 aa  216  7e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1593  carboxyl transferase  28.8 
 
 		 514 aa  216  7e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0139637  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1198  carboxyl transferase domain protein  32.43 
 
 		 548 aa  216  8e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000462076 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0008  Propionyl-CoA carboxylase  31.63 
 
 		 607 aa  216  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  31.23 
 
 		 516 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  31.47 
 
 		 527 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  30.27 
 
 		 522 aa  214  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  32.41 
 
 		 527 aa  214  2.9999999999999995e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21120  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  31.67 
 
 		 529 aa  213  7e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0918457  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0437  carboxyl transferase  29.53 
 
 		 509 aa  213  7e-54  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.137321  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0999  carboxyl transferase  30.65 
 
 		 527 aa  212  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4157  carboxyl transferase  34.33 
 
 		 475 aa  212  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3787  Propionyl-CoA carboxylase  30.89 
 
 		 510 aa  212  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5639  carboxyl transferase  31.47 
 
 		 516 aa  212  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0821  carboxyl transferase  30.94 
 
 		 536 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588825  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2186  Propionyl-CoA carboxylase  32.99 
 
 		 523 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  32.15 
 
 		 524 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0034  carboxyl transferase  30.48 
 
 		 516 aa  211  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182676  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3083  carboxyl transferase  30.48 
 
 		 516 aa  211  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0002503  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6415  Propionyl-CoA carboxylase  32.29 
 
 		 506 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  29.94 
 
 		 531 aa  210  4e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  30.63 
 
 		 516 aa  210  4e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0272  carboxyl transferase  28.79 
 
 		 515 aa  210  5e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00889461 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4364  carboxyl transferase  30.93 
 
 		 541 aa  210  6e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  29.15 
 
 		 531 aa  209  1e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1807  propionyl-CoA carboxylase  30.46 
 
 		 513 aa  209  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.171719  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3495  carboxyl transferase  31.14 
 
 		 540 aa  209  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0930  carboxyl transferase  30.3 
 
 		 518 aa  209  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3945  Propionyl-CoA carboxylase  30.69 
 
 		 519 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4004  carboxyl transferase  28.29 
 
 		 511 aa  208  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.680854 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0307  carboxyl transferase  29.94 
 
 		 516 aa  208  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  31.11 
 
 		 536 aa  208  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0831  propionyl-CoA carboxylase  32.8 
 
 		 514 aa  208  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.566084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13833  propionyl-CoA carboxylase beta subunit 4 accD4  31.81 
 
 		 522 aa  207  3e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0406479  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  27.1 
 
 		 514 aa  207  3e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0912  carboxyl transferase  30.34 
 
 		 510 aa  207  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1735  carboxyl transferase  29.92 
 
 		 510 aa  207  4e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1170  carboxyl transferase  31.4 
 
 		 516 aa  207  5e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.336373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  31.69 
 
 		 530 aa  206  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0250  carboxyl transferase  31.76 
 
 		 519 aa  206  6e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.135558  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3484  carboxyl transferase  28.99 
 
 		 510 aa  206  9e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2284  carboxyl transferase  30.02 
 
 		 522 aa  205  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00152526  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5009  carboxyl transferase  30.97 
 
 		 516 aa  206  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.270006  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3755  carboxyl transferase  29.7 
 
 		 510 aa  206  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0296123  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5390  carboxyl transferase  30.97 
 
 		 516 aa  206  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314967  normal  0.677274 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>