More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13833 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5009  carboxyl transferase  84.44 
 
 
516 aa  911    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.270006  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0216  carboxyl transferase  61.76 
 
 
518 aa  685    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5097  carboxyl transferase  84.44 
 
 
516 aa  911    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0397187  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5639  carboxyl transferase  83.66 
 
 
516 aa  891    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5390  carboxyl transferase  84.44 
 
 
516 aa  911    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314967  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1170  carboxyl transferase  83.46 
 
 
516 aa  867    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.336373  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13833  propionyl-CoA carboxylase beta subunit 4 accD4  100 
 
 
522 aa  1068    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0406479  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0176  carboxyl transferase  58.46 
 
 
527 aa  632  1e-180  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.725272  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  52.02 
 
 
524 aa  523  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3495  carboxyl transferase  51.89 
 
 
540 aa  524  1e-147  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  50.19 
 
 
530 aa  519  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  51.04 
 
 
527 aa  521  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  50.48 
 
 
529 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  51.06 
 
 
527 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6390  carboxyl transferase  50.65 
 
 
543 aa  514  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0531526  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  51.06 
 
 
530 aa  509  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  50.38 
 
 
531 aa  510  1e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  50.29 
 
 
534 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  50.47 
 
 
537 aa  507  9.999999999999999e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  49.72 
 
 
546 aa  503  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.35884 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0821  carboxyl transferase  50.48 
 
 
536 aa  499  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588825  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  49.43 
 
 
536 aa  500  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  50.38 
 
 
551 aa  501  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4774  carboxyl transferase  49.24 
 
 
538 aa  495  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1677  carboxyl transferase  49.17 
 
 
542 aa  496  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1840  carboxyl transferase  49.44 
 
 
542 aa  498  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4364  carboxyl transferase  48.77 
 
 
541 aa  488  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1294  carboxyl transferase  48.39 
 
 
556 aa  487  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3989  carboxyl transferase  49.24 
 
 
534 aa  487  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.356314 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1311  carboxyl transferase  48.39 
 
 
556 aa  487  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0791098  normal  0.306854 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13309  propionyl-CoA carboxylase beta subunit 5 accD5  47.74 
 
 
548 aa  487  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1330  carboxyl transferase  48.39 
 
 
556 aa  487  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1043  carboxyl transferase  46.53 
 
 
549 aa  481  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.282671  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4230  carboxyl transferase  47.55 
 
 
552 aa  481  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551859  normal  0.395293 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  48.39 
 
 
527 aa  479  1e-134  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0850  carboxyl transferase  47.81 
 
 
526 aa  477  1e-133  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000103034  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25440  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  47.64 
 
 
532 aa  476  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199435  normal  0.360386 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21120  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  46.93 
 
 
529 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0918457  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1041  carboxyl transferase  49 
 
 
542 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1325  carboxyl transferase  46.95 
 
 
527 aa  471  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000015031 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  48 
 
 
516 aa  470  1.0000000000000001e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  48.36 
 
 
522 aa  465  9.999999999999999e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  47.09 
 
 
515 aa  463  1e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  49.5 
 
 
516 aa  464  1e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1152  carboxyl transferase  46.79 
 
 
529 aa  462  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579492  normal  0.513821 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  46.51 
 
 
518 aa  462  1e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  46.51 
 
 
515 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3755  carboxyl transferase  47.87 
 
 
510 aa  459  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0296123  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2042  carboxyl transferase  47.58 
 
 
510 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0884189  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1021  carboxyl transferase  47.09 
 
 
531 aa  456  1e-127  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4004  carboxyl transferase  47.49 
 
 
511 aa  457  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.680854 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1851  carboxyl transferase  47.2 
 
 
510 aa  458  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1281  carboxyl transferase  47.52 
 
 
527 aa  456  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1016  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  47.87 
 
 
510 aa  457  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  49.09 
 
 
516 aa  454  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  45.54 
 
 
514 aa  455  1.0000000000000001e-126  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  46.42 
 
 
512 aa  452  1.0000000000000001e-126  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  46.68 
 
 
550 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0912  carboxyl transferase  45.86 
 
 
510 aa  449  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  46.82 
 
 
516 aa  449  1e-125  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0053  carboxyl transferase  47.59 
 
 
510 aa  450  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0808  carboxyl transferase  47.89 
 
 
508 aa  451  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3484  carboxyl transferase  46.81 
 
 
510 aa  451  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2803  propionyl-CoA carboxylase  46.9 
 
 
510 aa  451  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.342128  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2513  carboxyl transferase  45.93 
 
 
510 aa  448  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152871  normal  0.332227 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2348  carboxyl transferase  45.95 
 
 
512 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11343  propionlyl-CoA carboxylase  46.78 
 
 
513 aa  447  1.0000000000000001e-124  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2130  carboxyl transferase  46.15 
 
 
514 aa  448  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.955323  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  46.03 
 
 
516 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  46.26 
 
 
531 aa  448  1.0000000000000001e-124  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4697  carboxyl transferase  45.93 
 
 
528 aa  448  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1877  propionyl-CoA carboxylase  47.29 
 
 
510 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  45.31 
 
 
508 aa  447  1.0000000000000001e-124  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4239  carboxyl transferase  47.47 
 
 
510 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.540833  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1248  carboxyl transferase  47.21 
 
 
522 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3401  carboxyl transferase  47.09 
 
 
510 aa  448  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  46.42 
 
 
517 aa  445  1e-123  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  45.68 
 
 
512 aa  444  1e-123  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5680  propionyl-CoA carboxylase  47.67 
 
 
510 aa  445  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1632  carboxyl transferase  46.29 
 
 
522 aa  442  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6139  carboxyl transferase  47.56 
 
 
510 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.222288 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2694  carboxyl transferase  45.89 
 
 
510 aa  443  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0930  carboxyl transferase  45.58 
 
 
518 aa  444  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0260  carboxyl transferase  46.85 
 
 
519 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2189  propionyl-CoA carboxylase beta chain  46.53 
 
 
510 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124404  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0250  carboxyl transferase  45.9 
 
 
519 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.135558  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2164  carboxyl transferase  45.74 
 
 
510 aa  441  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.158421  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  46.35 
 
 
518 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1223  carboxyl transferase  44.87 
 
 
517 aa  440  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00883657  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2381  carboxyl transferase  45.56 
 
 
510 aa  441  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0861  carboxyl transferase  46.53 
 
 
510 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.833574  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0379  carboxyl transferase  46.26 
 
 
514 aa  435  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2894  carboxyl transferase  46.44 
 
 
510 aa  436  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.437903 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2305  propionyl-CoA carboxylase  46.23 
 
 
510 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1621  Propionyl-CoA carboxylase  46.07 
 
 
513 aa  437  1e-121  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0639  carboxyl transferase  45.45 
 
 
513 aa  435  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.629685 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0271  Propionyl-CoA carboxylase  46.46 
 
 
519 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.846145  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0271  carboxyl transferase  47.62 
 
 
520 aa  438  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.435103  normal  0.1429 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3695  carboxyl transferase  47.18 
 
 
538 aa  438  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0411544 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0950  carboxyl transferase  47.38 
 
 
514 aa  432  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.216274 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>