More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1170 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0216  carboxyl transferase  59.65 
 
 
518 aa  661    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13833  propionyl-CoA carboxylase beta subunit 4 accD4  83.46 
 
 
522 aa  888    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0406479  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5009  carboxyl transferase  84.88 
 
 
516 aa  910    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.270006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5097  carboxyl transferase  84.88 
 
 
516 aa  910    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0397187  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5639  carboxyl transferase  96.51 
 
 
516 aa  1025    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5390  carboxyl transferase  84.88 
 
 
516 aa  910    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314967  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1170  carboxyl transferase  100 
 
 
516 aa  1052    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.336373  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0176  carboxyl transferase  57.03 
 
 
527 aa  611  1e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.725272  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3495  carboxyl transferase  50 
 
 
540 aa  499  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  49.04 
 
 
527 aa  493  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  49.71 
 
 
524 aa  488  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  49.52 
 
 
534 aa  491  1e-137  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  49.9 
 
 
530 aa  489  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6390  carboxyl transferase  48.58 
 
 
543 aa  490  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0531526  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  48.27 
 
 
530 aa  488  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  48.76 
 
 
537 aa  485  1e-136  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  47.98 
 
 
529 aa  485  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  48.47 
 
 
527 aa  483  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  48.66 
 
 
531 aa  483  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  48.11 
 
 
546 aa  481  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.35884 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1840  carboxyl transferase  48.48 
 
 
542 aa  480  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  48.18 
 
 
536 aa  477  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1294  carboxyl transferase  48.96 
 
 
556 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1311  carboxyl transferase  48.96 
 
 
556 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0791098  normal  0.306854 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1677  carboxyl transferase  49.34 
 
 
542 aa  478  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1330  carboxyl transferase  48.96 
 
 
556 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4774  carboxyl transferase  49.34 
 
 
538 aa  478  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0821  carboxyl transferase  47.99 
 
 
536 aa  474  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588825  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4364  carboxyl transferase  47.62 
 
 
541 aa  474  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  48.08 
 
 
516 aa  472  1e-132  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  48.18 
 
 
527 aa  471  1.0000000000000001e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13309  propionyl-CoA carboxylase beta subunit 5 accD5  47.73 
 
 
548 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  47.6 
 
 
551 aa  467  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4230  carboxyl transferase  46.59 
 
 
552 aa  464  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551859  normal  0.395293 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3989  carboxyl transferase  46.76 
 
 
534 aa  465  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.356314 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21120  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  47.02 
 
 
529 aa  459  9.999999999999999e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0918457  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0850  carboxyl transferase  46.45 
 
 
526 aa  458  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000103034  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  48.19 
 
 
516 aa  452  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25440  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  45.87 
 
 
532 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199435  normal  0.360386 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  46.91 
 
 
522 aa  449  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4004  carboxyl transferase  45.7 
 
 
511 aa  449  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.680854 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1043  carboxyl transferase  44.89 
 
 
549 aa  451  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.282671  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3755  carboxyl transferase  46.6 
 
 
510 aa  445  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0296123  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2042  carboxyl transferase  46.41 
 
 
510 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0884189  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1152  carboxyl transferase  46.26 
 
 
529 aa  447  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579492  normal  0.513821 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1041  carboxyl transferase  46.08 
 
 
542 aa  443  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  44.27 
 
 
514 aa  442  1e-123  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3484  carboxyl transferase  46.02 
 
 
510 aa  442  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1851  carboxyl transferase  46.02 
 
 
510 aa  444  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  47.3 
 
 
516 aa  444  1e-123  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2803  propionyl-CoA carboxylase  46.6 
 
 
510 aa  443  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.342128  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1325  carboxyl transferase  44.53 
 
 
527 aa  444  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000015031 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2305  propionyl-CoA carboxylase  45.63 
 
 
510 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2189  propionyl-CoA carboxylase beta chain  46.02 
 
 
510 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124404  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0053  carboxyl transferase  46.6 
 
 
510 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  48.19 
 
 
516 aa  441  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  45.01 
 
 
508 aa  440  9.999999999999999e-123  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  44.06 
 
 
518 aa  441  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0861  carboxyl transferase  46.02 
 
 
510 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.833574  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0912  carboxyl transferase  45.95 
 
 
510 aa  439  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4697  carboxyl transferase  44.83 
 
 
528 aa  436  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6139  carboxyl transferase  46.15 
 
 
510 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.222288 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  44.99 
 
 
550 aa  438  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1016  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  46.02 
 
 
510 aa  438  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  44.74 
 
 
515 aa  437  1e-121  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  44.36 
 
 
515 aa  433  1e-120  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0291  carboxyl transferase  45.11 
 
 
519 aa  435  1e-120  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0260  carboxyl transferase  45.51 
 
 
519 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5680  propionyl-CoA carboxylase  46.41 
 
 
510 aa  433  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0250  carboxyl transferase  45.21 
 
 
519 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.135558  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0808  carboxyl transferase  45.93 
 
 
508 aa  434  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  45.02 
 
 
531 aa  433  1e-120  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1021  carboxyl transferase  45.59 
 
 
531 aa  433  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1281  carboxyl transferase  44.72 
 
 
527 aa  432  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0930  carboxyl transferase  44.85 
 
 
518 aa  435  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3688  carboxyl transferase  44.68 
 
 
510 aa  432  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.618461  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2513  carboxyl transferase  45.24 
 
 
510 aa  434  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152871  normal  0.332227 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2381  carboxyl transferase  44.96 
 
 
510 aa  432  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0077  carboxyl transferase  42.72 
 
 
517 aa  434  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.371983  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2130  carboxyl transferase  44.98 
 
 
514 aa  431  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.955323  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  45.81 
 
 
517 aa  431  1e-119  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  45.36 
 
 
518 aa  431  1e-119  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  43.6 
 
 
512 aa  430  1e-119  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0271  carboxyl transferase  46.46 
 
 
520 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.435103  normal  0.1429 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  43.74 
 
 
516 aa  430  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0271  Propionyl-CoA carboxylase  45.51 
 
 
519 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.846145  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2164  carboxyl transferase  45.05 
 
 
510 aa  432  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.158421  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  45.05 
 
 
520 aa  430  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  44.17 
 
 
516 aa  429  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  43.74 
 
 
512 aa  431  1e-119  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1223  carboxyl transferase  43.13 
 
 
517 aa  431  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00883657  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11343  propionlyl-CoA carboxylase  44.1 
 
 
513 aa  431  1e-119  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1248  carboxyl transferase  45.59 
 
 
522 aa  429  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3401  carboxyl transferase  44.57 
 
 
510 aa  431  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2003  carboxyl transferase  44.85 
 
 
510 aa  428  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2974  carboxyl transferase  44.51 
 
 
519 aa  426  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2348  carboxyl transferase  43.84 
 
 
512 aa  426  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1877  propionyl-CoA carboxylase  45.44 
 
 
510 aa  428  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2694  carboxyl transferase  45.1 
 
 
510 aa  425  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4239  carboxyl transferase  45.33 
 
 
510 aa  427  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.540833  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>