More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0831 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B3891  propionyl-CoA carboxylase  74.56 
 
 
533 aa  793    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3419  Propionyl-CoA carboxylase  73.4 
 
 
515 aa  777    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1099  propionyl-CoA carboxylase  73.26 
 
 
515 aa  762    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0831  propionyl-CoA carboxylase  100 
 
 
514 aa  1034    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.566084  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3097  propionyl-CoA carboxylase  55.47 
 
 
518 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.079837 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3945  Propionyl-CoA carboxylase  57.5 
 
 
519 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2593  propionyl-CoA carboxylase  55.58 
 
 
505 aa  563  1.0000000000000001e-159  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3573  putative methylmalonyl-CoA decarboxylase alpha chain  56.51 
 
 
519 aa  553  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1854  propionyl-CoA carboxylase  55.86 
 
 
505 aa  545  1e-154  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.587297 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1979  propionyl-CoA carboxylase  43.74 
 
 
518 aa  389  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.660708  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  32.67 
 
 
531 aa  272  1e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0379  carboxyl transferase  32.68 
 
 
514 aa  254  3e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1593  Propionyl-CoA carboxylase  32.03 
 
 
525 aa  249  8e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  29.84 
 
 
522 aa  247  4e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2284  carboxyl transferase  31.53 
 
 
522 aa  246  6e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00152526  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  30.24 
 
 
531 aa  245  9.999999999999999e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  31.14 
 
 
516 aa  244  3e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  31.24 
 
 
508 aa  244  3.9999999999999997e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0077  carboxyl transferase  29.75 
 
 
517 aa  243  5e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.371983  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3695  carboxyl transferase  32.86 
 
 
538 aa  243  5e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0411544 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0268  carboxyl transferase  30.71 
 
 
523 aa  243  6e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4697  carboxyl transferase  29.81 
 
 
528 aa  243  7e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4136  propionyl-CoA carboxylase  33.94 
 
 
522 aa  243  7e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2999  carboxyl transferase  31.52 
 
 
510 aa  241  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  29.38 
 
 
516 aa  241  2e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0950  carboxyl transferase  32.26 
 
 
514 aa  241  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.216274 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0271  carboxyl transferase  31.19 
 
 
520 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.435103  normal  0.1429 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  32.44 
 
 
516 aa  240  5e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3307  propionyl-CoA carboxylase  31.05 
 
 
517 aa  239  6.999999999999999e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448446  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  29.75 
 
 
514 aa  239  1e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3025  carboxyl transferase  32.7 
 
 
532 aa  239  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.432014 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0386  propionyl-CoA carboxylase  31.14 
 
 
514 aa  239  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  31.93 
 
 
530 aa  238  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  31.92 
 
 
527 aa  237  4e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  31.92 
 
 
527 aa  237  4e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0307  carboxyl transferase  31.27 
 
 
516 aa  237  4e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  31.98 
 
 
516 aa  236  7e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0639  carboxyl transferase  30.3 
 
 
513 aa  236  7e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.629685 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  30.56 
 
 
516 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0424  carboxyl transferase  29.34 
 
 
516 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0489  carboxyl transferase  31.26 
 
 
520 aa  235  1.0000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  31.04 
 
 
516 aa  235  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0260  carboxyl transferase  31.79 
 
 
519 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  31.31 
 
 
530 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  29.86 
 
 
515 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  29.88 
 
 
516 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  30.71 
 
 
520 aa  235  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0250  carboxyl transferase  31.59 
 
 
519 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.135558  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  31.56 
 
 
518 aa  234  3e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0271  Propionyl-CoA carboxylase  31.79 
 
 
519 aa  234  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.846145  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  30.38 
 
 
512 aa  233  5e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1099  propionyl-CoA carboxylase  29.54 
 
 
535 aa  233  5e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1016  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  31.85 
 
 
510 aa  233  8.000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0051  carboxyl transferase  32.32 
 
 
517 aa  232  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.253581  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  30.51 
 
 
517 aa  232  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  32.46 
 
 
536 aa  232  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1705  carboxyl transferase  30.91 
 
 
510 aa  232  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.514847  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  29.66 
 
 
515 aa  231  2e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2513  carboxyl transferase  31.46 
 
 
510 aa  231  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152871  normal  0.332227 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  31.52 
 
 
534 aa  231  3e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1198  carboxyl transferase domain protein  31.3 
 
 
548 aa  231  3e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000462076 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2361  carboxyl transferase  31.28 
 
 
513 aa  231  3e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000738755  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_389  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  29.34 
 
 
516 aa  230  4e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.839187  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  29.7 
 
 
517 aa  230  5e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3787  Propionyl-CoA carboxylase  30.91 
 
 
510 aa  230  5e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5009  carboxyl transferase  30.95 
 
 
516 aa  229  6e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.270006  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5390  carboxyl transferase  30.95 
 
 
516 aa  229  6e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314967  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5097  carboxyl transferase  30.95 
 
 
516 aa  229  6e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0397187  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0447  acyl CoA biotin-dependant carboxyltransferase  29.14 
 
 
516 aa  228  1e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3755  carboxyl transferase  31.25 
 
 
510 aa  229  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0296123  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2019  propionyl-CoA carboxylase  33.14 
 
 
498 aa  228  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  29.49 
 
 
518 aa  229  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0930  carboxyl transferase  30.89 
 
 
518 aa  228  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1157  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  28.71 
 
 
508 aa  228  2e-58  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.167256  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  31.57 
 
 
550 aa  227  4e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0553  carboxyl transferase  27.95 
 
 
518 aa  227  4e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.965666  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0912  carboxyl transferase  30.66 
 
 
510 aa  227  5.0000000000000005e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  30.94 
 
 
529 aa  227  5.0000000000000005e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1316  carboxyl transferase  27.58 
 
 
514 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3166  carboxyl transferase  31.17 
 
 
521 aa  226  6e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0567033  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  29.18 
 
 
512 aa  226  8e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  29.55 
 
 
516 aa  226  9e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4364  carboxyl transferase  31.45 
 
 
541 aa  226  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1817  Methylmalonyl-CoA carboxytransferase  30 
 
 
517 aa  226  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0358  carboxyl transferase  30.14 
 
 
510 aa  226  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4725  carboxyl transferase  29.84 
 
 
510 aa  225  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.48705  normal  0.0648736 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0437  carboxyl transferase  28.2 
 
 
509 aa  225  2e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.137321  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0326  carboxyl transferase  29.94 
 
 
510 aa  225  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  0.0697048 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2694  carboxyl transferase  30.49 
 
 
510 aa  225  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0335  carboxyl transferase  32.21 
 
 
514 aa  224  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.868559  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1877  propionyl-CoA carboxylase  30.08 
 
 
510 aa  225  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3092  carboxyl transferase  29.06 
 
 
516 aa  224  2e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.391297  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6937  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  32.74 
 
 
559 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100753  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0282  carboxyl transferase  29.94 
 
 
510 aa  224  3e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  31.1 
 
 
524 aa  224  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1593  carboxyl transferase  30 
 
 
514 aa  224  3e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0139637  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0272  carboxyl transferase  26.93 
 
 
515 aa  224  3e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00889461 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1248  carboxyl transferase  31.14 
 
 
522 aa  224  3e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2835  carboxyl transferase  30.55 
 
 
510 aa  224  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.497575  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13309  propionyl-CoA carboxylase beta subunit 5 accD5  30.47 
 
 
548 aa  224  4e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>