More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1198 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1198  carboxyl transferase domain protein  100 
 
 		 548 aa  1124    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000462076 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1632  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase component  80.04 
 
 		 540 aa  816    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  54.23 
 
 		 537 aa  560  1e-158  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25440  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  56.06 
 
 		 532 aa  557  1e-157  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199435  normal  0.360386 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  53.95 
 
 		 546 aa  554  1e-156  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.35884 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3495  carboxyl transferase  52.25 
 
 		 540 aa  554  1e-156  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  54.4 
 
 		 530 aa  550  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1041  carboxyl transferase  55.65 
 
 		 542 aa  551  1e-155  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  54.4 
 
 		 527 aa  551  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  53.54 
 
 		 534 aa  547  1e-154  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  54 
 
 		 527 aa  544  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1021  carboxyl transferase  51.4 
 
 		 531 aa  541  1e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  53.69 
 
 		 529 aa  542  1e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0850  carboxyl transferase  51.82 
 
 		 526 aa  544  1e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000103034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1152  carboxyl transferase  54.42 
 
 		 529 aa  540  9.999999999999999e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579492  normal  0.513821 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21120  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  51.89 
 
 		 529 aa  536  1e-151  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0918457  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  53.2 
 
 		 524 aa  534  1e-150  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  52.89 
 
 		 527 aa  529  1e-149  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3989  carboxyl transferase  53.08 
 
 		 534 aa  530  1e-149  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.356314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0821  carboxyl transferase  53.08 
 
 		 536 aa  526  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588825  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6390  carboxyl transferase  53.06 
 
 		 543 aa  526  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0531526  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  53.4 
 
 		 530 aa  525  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  52.07 
 
 		 536 aa  520  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  49.52 
 
 		 515 aa  519  1e-146  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1281  carboxyl transferase  50.7 
 
 		 527 aa  515  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  49.32 
 
 		 515 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1325  carboxyl transferase  51.29 
 
 		 527 aa  518  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000015031 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  49.62 
 
 		 531 aa  515  1.0000000000000001e-145  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1294  carboxyl transferase  48.02 
 
 		 556 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1311  carboxyl transferase  48.02 
 
 		 556 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0791098  normal  0.306854 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1330  carboxyl transferase  48.02 
 
 		 556 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  49.7 
 
 		 512 aa  509  1e-143  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4230  carboxyl transferase  52.28 
 
 		 552 aa  510  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551859  normal  0.395293 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1043  carboxyl transferase  46.99 
 
 		 549 aa  508  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.282671  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1677  carboxyl transferase  49.63 
 
 		 542 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1840  carboxyl transferase  50.49 
 
 		 542 aa  507  9.999999999999999e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  47.95 
 
 		 531 aa  503  1e-141  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  50.8 
 
 		 531 aa  503  1e-141  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  49.7 
 
 		 550 aa  502  1e-141  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4364  carboxyl transferase  49.26 
 
 		 541 aa  504  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4774  carboxyl transferase  50.69 
 
 		 538 aa  501  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1621  Propionyl-CoA carboxylase  49.9 
 
 		 513 aa  500  1e-140  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  47.47 
 
 		 551 aa  501  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  49.61 
 
 		 512 aa  498  1e-140  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  48 
 
 		 516 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  49.3 
 
 		 522 aa  492  9.999999999999999e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13309  propionyl-CoA carboxylase beta subunit 5 accD5  50.2 
 
 		 548 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  48.1 
 
 		 514 aa  492  9.999999999999999e-139  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  48.39 
 
 		 516 aa  489  1e-137  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  47.74 
 
 		 516 aa  488  1e-136  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1316  carboxyl transferase  49.3 
 
 		 514 aa  487  1e-136  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  48.02 
 
 		 516 aa  488  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  46.48 
 
 		 518 aa  486  1e-136  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  49.1 
 
 		 508 aa  485  1e-136  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0379  carboxyl transferase  48.88 
 
 		 514 aa  486  1e-136  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0950  carboxyl transferase  48.48 
 
 		 514 aa  482  1e-135  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.216274 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  47.14 
 
 		 516 aa  483  1e-135  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3092  carboxyl transferase  48.5 
 
 		 516 aa  481  1e-134  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.391297  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  48.73 
 
 		 517 aa  480  1e-134  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  48.16 
 
 		 516 aa  479  1e-134  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  49.7 
 
 		 518 aa  481  1e-134  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  48.31 
 
 		 516 aa  480  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  46.39 
 
 		 516 aa  480  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1375  propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit alpha / propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit beta  47.61 
 
 		 524 aa  475  1e-133  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0140013 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0272  carboxyl transferase  47.11 
 
 		 515 aa  478  1e-133  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00889461 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2284  carboxyl transferase  47.79 
 
 		 522 aa  477  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00152526  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1215  methylmalonyl-CoA decarboxylase alpha chain  49.5 
 
 		 519 aa  472  1e-132  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.336846  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3695  carboxyl transferase  47.98 
 
 		 538 aa  474  1e-132  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0411544 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0268  carboxyl transferase  48.19 
 
 		 523 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0447  acyl CoA biotin-dependant carboxyltransferase  47.99 
 
 		 516 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3374  carboxyl transferase  48.3 
 
 		 510 aa  469  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.778087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0282  carboxyl transferase  47.71 
 
 		 510 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  49.09 
 
 		 513 aa  465  9.999999999999999e-131  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0912  carboxyl transferase  48.7 
 
 		 510 aa  465  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0326  carboxyl transferase  47.71 
 
 		 510 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  0.0697048 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3811  carboxyl transferase  47.28 
 
 		 510 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0358  carboxyl transferase  47.91 
 
 		 510 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_389  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  47.79 
 
 		 516 aa  467  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.839187  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3166  carboxyl transferase  47.28 
 
 		 521 aa  467  9.999999999999999e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0567033  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4697  carboxyl transferase  47.08 
 
 		 528 aa  468  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0271  carboxyl transferase  48.08 
 
 		 520 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.435103  normal  0.1429 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0271  Propionyl-CoA carboxylase  48.24 
 
 		 519 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.846145  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0156  carboxyl transferase  48 
 
 		 513 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.344953  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0077  carboxyl transferase  46.51 
 
 		 517 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.371983  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1632  carboxyl transferase  46.14 
 
 		 522 aa  466  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0424  carboxyl transferase  47.99 
 
 		 516 aa  468  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0260  carboxyl transferase  48.24 
 
 		 519 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4725  carboxyl transferase  48.11 
 
 		 510 aa  465  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.48705  normal  0.0648736 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0553  carboxyl transferase  46.92 
 
 		 518 aa  463  1e-129  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.965666  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6139  carboxyl transferase  47.07 
 
 		 510 aa  464  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.222288 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2835  carboxyl transferase  47.51 
 
 		 510 aa  464  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.497575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0250  carboxyl transferase  48.79 
 
 		 519 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.135558  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5659  carboxyl transferase  47.53 
 
 		 510 aa  465  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0639  carboxyl transferase  47.79 
 
 		 513 aa  464  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.629685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6937  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  47.7 
 
 		 559 aa  462  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2361  carboxyl transferase  46.88 
 
 		 513 aa  462  1e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000738755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5510  carboxyl transferase  46.69 
 
 		 510 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3484  carboxyl transferase  48.01 
 
 		 510 aa  459  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1877  propionyl-CoA carboxylase  46.51 
 
 		 510 aa  461  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1735  carboxyl transferase  47.14 
 
 		 510 aa  459  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>