More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3945 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3945  Propionyl-CoA carboxylase  100 
 
 		 519 aa  1066    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3573  putative methylmalonyl-CoA decarboxylase alpha chain  83.24 
 
 		 519 aa  868    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3097  propionyl-CoA carboxylase  83.82 
 
 		 518 aa  917    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.079837 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3891  propionyl-CoA carboxylase  57.31 
 
 		 533 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3419  Propionyl-CoA carboxylase  57.81 
 
 		 515 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0831  propionyl-CoA carboxylase  57.5 
 
 		 514 aa  593  1e-168  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.566084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1099  propionyl-CoA carboxylase  57.01 
 
 		 515 aa  588  1e-167  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2593  propionyl-CoA carboxylase  54.37 
 
 		 505 aa  546  1e-154  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1854  propionyl-CoA carboxylase  55.95 
 
 		 505 aa  540  9.999999999999999e-153  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.587297 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1979  propionyl-CoA carboxylase  46.46 
 
 		 518 aa  439  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.660708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0272  carboxyl transferase  32.14 
 
 		 515 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00889461 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  32.8 
 
 		 531 aa  269  8e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  32.48 
 
 		 508 aa  268  1e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  34.56 
 
 		 516 aa  268  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3811  carboxyl transferase  35.43 
 
 		 510 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5659  carboxyl transferase  34.78 
 
 		 510 aa  265  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0326  carboxyl transferase  34.77 
 
 		 510 aa  264  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  0.0697048 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0358  carboxyl transferase  34.77 
 
 		 510 aa  265  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0282  carboxyl transferase  34.77 
 
 		 510 aa  264  3e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5510  carboxyl transferase  34.77 
 
 		 510 aa  264  4e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2835  carboxyl transferase  35.41 
 
 		 510 aa  263  6e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.497575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3397  carboxyl transferase  33.86 
 
 		 510 aa  263  8e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  31.64 
 
 		 516 aa  260  4e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  31.25 
 
 		 531 aa  260  5.0000000000000005e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5024  putative propionyl-CoA carboxylase beta chain  34.27 
 
 		 510 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.541202 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3618  carboxyl transferase  33.54 
 
 		 510 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207692  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1157  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  31.94 
 
 		 508 aa  257  4e-67  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.167256  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4725  carboxyl transferase  34.18 
 
 		 510 aa  257  4e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.48705  normal  0.0648736 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2342  carboxyl transferase  33.33 
 
 		 510 aa  256  5e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.150986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3787  Propionyl-CoA carboxylase  34.42 
 
 		 510 aa  256  9e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1317  carboxyl transferase  33.2 
 
 		 510 aa  256  1.0000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.182185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1877  propionyl-CoA carboxylase  34.14 
 
 		 510 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1401  carboxyl transferase  33.2 
 
 		 510 aa  255  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0947587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3122  carboxyl transferase  33.54 
 
 		 510 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.629263  normal  0.624995 
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  31.66 
 
 		 517 aa  254  3e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1593  Propionyl-CoA carboxylase  32.42 
 
 		 525 aa  254  3e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  30.06 
 
 		 518 aa  254  3e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  31.65 
 
 		 516 aa  253  6e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  30.99 
 
 		 516 aa  253  6e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1579  carboxyl transferase  32.53 
 
 		 523 aa  253  6e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0377813  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1215  methylmalonyl-CoA decarboxylase alpha chain  34.86 
 
 		 519 aa  252  9.000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.336846  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  31.36 
 
 		 516 aa  252  1e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2082  carboxyl transferase  32.88 
 
 		 510 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.122916  normal  0.0739179 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0718  carboxyl transferase  33.87 
 
 		 510 aa  251  3e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.267542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  35.04 
 
 		 516 aa  251  3e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0379  carboxyl transferase  34.11 
 
 		 514 aa  250  4e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1735  carboxyl transferase  32.6 
 
 		 510 aa  250  5e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6139  carboxyl transferase  32.68 
 
 		 510 aa  249  9e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.222288 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0271  carboxyl transferase  32.8 
 
 		 520 aa  249  9e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.435103  normal  0.1429 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  32.53 
 
 		 520 aa  249  9e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2974  carboxyl transferase  32.53 
 
 		 515 aa  249  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0950  carboxyl transferase  34.13 
 
 		 514 aa  248  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.216274 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3374  carboxyl transferase  33.2 
 
 		 510 aa  248  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.778087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3695  carboxyl transferase  34.07 
 
 		 538 aa  248  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0411544 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4697  carboxyl transferase  31.46 
 
 		 528 aa  248  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2019  propionyl-CoA carboxylase  33.99 
 
 		 498 aa  248  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0250  carboxyl transferase  32.88 
 
 		 519 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.135558  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5680  propionyl-CoA carboxylase  32.55 
 
 		 510 aa  247  4e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  30.37 
 
 		 514 aa  247  4e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2003  carboxyl transferase  32.99 
 
 		 510 aa  247  4.9999999999999997e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  31.33 
 
 		 515 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3025  carboxyl transferase  33.13 
 
 		 532 aa  246  8e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.432014 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1880  carboxyl transferase  32.49 
 
 		 510 aa  246  8e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0295366 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  31.47 
 
 		 515 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4327  propionyl-CoA carboxylase  33.79 
 
 		 498 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0424  carboxyl transferase  30.06 
 
 		 516 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0447  acyl CoA biotin-dependant carboxyltransferase  30.33 
 
 		 516 aa  244  3e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0260  carboxyl transferase  32.74 
 
 		 519 aa  244  3e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3092  carboxyl transferase  33.07 
 
 		 516 aa  244  3e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.391297  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0271  Propionyl-CoA carboxylase  32.74 
 
 		 519 aa  244  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.846145  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_389  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  30.13 
 
 		 516 aa  243  7e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.839187  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0077  carboxyl transferase  29.84 
 
 		 517 aa  242  1e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.371983  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2771  carboxyl transferase  32.53 
 
 		 510 aa  241  2.9999999999999997e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110182 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0861  carboxyl transferase  33.33 
 
 		 510 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.833574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2189  propionyl-CoA carboxylase beta chain  33.33 
 
 		 510 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124404  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3688  carboxyl transferase  33 
 
 		 510 aa  240  2.9999999999999997e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.618461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2305  propionyl-CoA carboxylase  33.2 
 
 		 510 aa  240  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2019  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  32.69 
 
 		 1103 aa  240  4e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4239  carboxyl transferase  32.3 
 
 		 510 aa  239  5.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.540833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  32.15 
 
 		 530 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2907  propionyl-CoA carboxylase  31.27 
 
 		 514 aa  239  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  32.16 
 
 		 518 aa  239  1e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0051  carboxyl transferase  33.73 
 
 		 517 aa  238  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.253581  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  29.9 
 
 		 512 aa  239  1e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3484  carboxyl transferase  32.6 
 
 		 510 aa  238  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0437  carboxyl transferase  30.71 
 
 		 509 aa  238  2e-61  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.137321  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  30.69 
 
 		 522 aa  238  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1754  carboxyl transferase  31.98 
 
 		 510 aa  238  2e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.218371  normal  0.119502 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0386  propionyl-CoA carboxylase  31.61 
 
 		 514 aa  238  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2692  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  31.91 
 
 		 1091 aa  238  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.246578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2999  carboxyl transferase  31.92 
 
 		 510 aa  238  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0930  carboxyl transferase  32.6 
 
 		 518 aa  237  4e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1705  carboxyl transferase  31.47 
 
 		 510 aa  237  4e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.514847  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0291  carboxyl transferase  30.95 
 
 		 519 aa  237  4e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0156  carboxyl transferase  33.2 
 
 		 513 aa  236  9e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.344953  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  30.28 
 
 		 513 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0053  carboxyl transferase  33.12 
 
 		 510 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2894  carboxyl transferase  32.53 
 
 		 510 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.437903 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0489  carboxyl transferase  30.61 
 
 		 520 aa  235  2.0000000000000002e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3755  carboxyl transferase  32.53 
 
 		 510 aa  235  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0296123  normal  0.253409 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>