More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2974 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2974  carboxyl transferase  100 
 
 
515 aa  1070    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  37.33 
 
 
508 aa  343  4e-93  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  36.98 
 
 
531 aa  335  9e-91  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1593  Propionyl-CoA carboxylase  38.71 
 
 
525 aa  335  1e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  38.32 
 
 
531 aa  333  3e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  34.82 
 
 
518 aa  333  3e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  35.64 
 
 
516 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  38.12 
 
 
516 aa  332  9e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  36.47 
 
 
516 aa  331  2e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  36.94 
 
 
517 aa  329  9e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2284  carboxyl transferase  34.75 
 
 
522 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00152526  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  36.71 
 
 
514 aa  327  3e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0268  carboxyl transferase  37.43 
 
 
523 aa  323  4e-87  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0307  carboxyl transferase  35.14 
 
 
516 aa  323  4e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1375  propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit alpha / propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit beta  36.04 
 
 
524 aa  322  8e-87  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0140013 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  35.81 
 
 
516 aa  319  7.999999999999999e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  34.65 
 
 
516 aa  317  3e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  34.07 
 
 
515 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1248  carboxyl transferase  35.31 
 
 
522 aa  312  1e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  33.67 
 
 
515 aa  311  2e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  33.4 
 
 
512 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2974  carboxyl transferase  35.26 
 
 
519 aa  309  8e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2907  propionyl-CoA carboxylase  33.73 
 
 
514 aa  308  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0272  carboxyl transferase  34.84 
 
 
515 aa  309  1.0000000000000001e-82  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00889461 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0291  carboxyl transferase  34.06 
 
 
519 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  34.62 
 
 
550 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2881  carboxyl transferase  33.73 
 
 
514 aa  307  3e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3025  carboxyl transferase  35.19 
 
 
532 aa  307  3e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.432014 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3092  carboxyl transferase  37.42 
 
 
516 aa  306  6e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.391297  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3166  carboxyl transferase  36.2 
 
 
521 aa  306  7e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0567033  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2361  carboxyl transferase  35.89 
 
 
513 aa  305  1.0000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000738755  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4697  carboxyl transferase  35.83 
 
 
528 aa  304  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  35.71 
 
 
518 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0447  acyl CoA biotin-dependant carboxyltransferase  34.47 
 
 
516 aa  303  7.000000000000001e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0424  carboxyl transferase  34.82 
 
 
516 aa  302  8.000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  34.07 
 
 
513 aa  301  2e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0335  carboxyl transferase  34.89 
 
 
514 aa  301  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.868559  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_389  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  34.62 
 
 
516 aa  301  2e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.839187  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0077  carboxyl transferase  33.73 
 
 
517 aa  299  8e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.371983  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0889  carboxyl transferase  33.27 
 
 
564 aa  299  8e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  32.4 
 
 
512 aa  298  2e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0317  carboxyl transferase  34.52 
 
 
514 aa  297  4e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  33.94 
 
 
517 aa  296  5e-79  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3307  propionyl-CoA carboxylase  34.93 
 
 
517 aa  296  8e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448446  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  34.86 
 
 
516 aa  296  9e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1223  carboxyl transferase  33.92 
 
 
517 aa  296  9e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00883657  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0489  carboxyl transferase  35.6 
 
 
520 aa  295  1e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1016  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  33.93 
 
 
510 aa  295  1e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0947  carboxyl transferase  33.53 
 
 
513 aa  294  2e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.592853  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1632  carboxyl transferase  34.76 
 
 
522 aa  295  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  32.94 
 
 
534 aa  294  3e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0379  carboxyl transferase  34.73 
 
 
514 aa  294  3e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0912  carboxyl transferase  34.6 
 
 
510 aa  293  7e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  33.92 
 
 
522 aa  292  9e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2003  carboxyl transferase  32 
 
 
510 aa  292  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5680  propionyl-CoA carboxylase  33 
 
 
510 aa  291  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0999  carboxyl transferase  34.97 
 
 
527 aa  291  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2381  carboxyl transferase  33.73 
 
 
510 aa  291  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3755  carboxyl transferase  32.35 
 
 
510 aa  291  3e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0296123  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2348  carboxyl transferase  35.8 
 
 
512 aa  290  3e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0930  carboxyl transferase  33.67 
 
 
518 aa  291  3e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0260  carboxyl transferase  34.19 
 
 
519 aa  290  4e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4239  carboxyl transferase  31.76 
 
 
510 aa  290  5.0000000000000004e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.540833  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0156  carboxyl transferase  32.24 
 
 
513 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.344953  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5510  carboxyl transferase  32.09 
 
 
510 aa  290  6e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1593  carboxyl transferase  33.73 
 
 
514 aa  290  6e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0139637  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0271  carboxyl transferase  34.13 
 
 
520 aa  289  8e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.435103  normal  0.1429 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2694  carboxyl transferase  33.33 
 
 
510 aa  289  9e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0271  Propionyl-CoA carboxylase  34 
 
 
519 aa  288  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.846145  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0250  carboxyl transferase  34 
 
 
519 aa  288  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.135558  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0821  carboxyl transferase  33 
 
 
536 aa  287  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588825  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4004  carboxyl transferase  32.29 
 
 
511 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.680854 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  32.61 
 
 
531 aa  287  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3811  carboxyl transferase  31.69 
 
 
510 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3695  carboxyl transferase  34.56 
 
 
538 aa  287  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0411544 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2042  carboxyl transferase  32.42 
 
 
510 aa  287  2.9999999999999996e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0884189  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2803  propionyl-CoA carboxylase  33.33 
 
 
510 aa  287  4e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.342128  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6139  carboxyl transferase  31.6 
 
 
510 aa  286  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.222288 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1851  carboxyl transferase  32.42 
 
 
510 aa  286  5e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2130  carboxyl transferase  33.07 
 
 
514 aa  286  5.999999999999999e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.955323  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  33.13 
 
 
536 aa  286  7e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1621  Propionyl-CoA carboxylase  33.82 
 
 
513 aa  286  8e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0201  carboxyl transferase  33.79 
 
 
521 aa  285  1.0000000000000001e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0217258  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  33.13 
 
 
524 aa  285  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2513  carboxyl transferase  31.56 
 
 
510 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152871  normal  0.332227 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2164  carboxyl transferase  32.94 
 
 
510 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.158421  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1877  propionyl-CoA carboxylase  30.75 
 
 
510 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3495  carboxyl transferase  33.27 
 
 
540 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0053  carboxyl transferase  31.76 
 
 
510 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2771  carboxyl transferase  34.2 
 
 
549 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.145735  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  32.21 
 
 
551 aa  283  4.0000000000000003e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3541  carboxyl transferase  33.67 
 
 
514 aa  283  4.0000000000000003e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0950  carboxyl transferase  34.21 
 
 
514 aa  283  5.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.216274 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  34.17 
 
 
516 aa  283  6.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  32.66 
 
 
529 aa  283  6.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4725  carboxyl transferase  30.92 
 
 
510 aa  283  7.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.48705  normal  0.0648736 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3688  carboxyl transferase  31.55 
 
 
510 aa  283  7.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.618461  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0051  carboxyl transferase  35.16 
 
 
517 aa  282  9e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.253581  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  31.91 
 
 
530 aa  282  1e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6937  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  33.33 
 
 
559 aa  282  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100753  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>