More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_46320 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3940  biotin carboxylase  88.23 
 
 		 1095 aa  1832    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2997  pyruvate carboxylase., propionyl-CoA carboxylase  60.73 
 
 		 1112 aa  1203    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.717985  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3892  pyruvate carboxylase., propionyl-CoA carboxylase  54.91 
 
 		 1105 aa  1051    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.222877  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4464  pyruvate carboxylase., methylmalonyl-CoA carboxytransferase  55.53 
 
 		 1067 aa  1048    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0495259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3842  pyruvate carboxylase., propionyl-CoA carboxylase  76.19 
 
 		 1090 aa  1619    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.735507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1862  carboxyl transferase  59.77 
 
 		 602 aa  638    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00333639  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0228  pyruvate carboxylase  58.01 
 
 		 1102 aa  1222    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3899  propionyl-CoA carboxylase  59.93 
 
 		 610 aa  679    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0325  putative carbamoyl-phosphate synthase/carboxyltransferase  48.99 
 
 		 1033 aa  958    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00413632  normal  0.277217 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0602  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  57.86 
 
 		 1102 aa  1220    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4069  acetyl-CoA carboxylase (biotin carboxylase and carboxyl transferase domains) / biotin carboxyl carrier protein  54.06 
 
 		 1126 aa  1038    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0299228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4971  putative carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  53.69 
 
 		 1152 aa  1025    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.266349  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1682  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  57.74 
 
 		 1097 aa  1082    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2692  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  60.07 
 
 		 1091 aa  1268    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.246578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4792  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  58.08 
 
 		 1098 aa  1149    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46320  putative pyruvate carboxylase  100 
 
 		 1095 aa  2167    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.948302  normal  0.0234216 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2019  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  60.67 
 
 		 1103 aa  1230    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2867  pyruvate carboxylase, propionyl-CoA carboxylase  58.67 
 
 		 1094 aa  1329    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1073  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  56.34 
 
 		 1097 aa  1075    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.398596 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2413  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  60.67 
 
 		 1103 aa  1267    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.370889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1889  propionyl-CoA carboxylase  61.92 
 
 		 519 aa  654    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1872  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding protein  51.58 
 
 		 1054 aa  914    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1636  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  58.64 
 
 		 1103 aa  1228    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2712  carboxyl transferase  59.27 
 
 		 524 aa  568  1e-160  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0757047  normal  0.0196449 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0066  propionyl-CoA carboxylase  57.28 
 
 		 519 aa  550  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2710  propionyl-CoA carboxylase  57.34 
 
 		 503 aa  546  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.595961  normal  0.61988 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2679  propionyl-CoA carboxylase  57.14 
 
 		 503 aa  544  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2724  propionyl-CoA carboxylase  57.14 
 
 		 503 aa  544  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173098 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1271  propionyl-CoA carboxylase  47.5 
 
 		 600 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0781  propionyl-CoA carboxylase  56.73 
 
 		 518 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.576525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4207  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  42.74 
 
 		 588 aa  406  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3215  pyruvate carboxylase  47.31 
 
 		 1148 aa  385  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3015  pyruvate carboxylase  46.88 
 
 		 1148 aa  385  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.240304  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0980  pyruvate carboxylase  43.38 
 
 		 1147 aa  385  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.125957  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10083  pyruvate carboxylase  42.86 
 
 		 1150 aa  380  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.667166  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2591  pyruvate carboxylase subunit A  45.05 
 
 		 471 aa  382  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0972  pyruvate carboxylase  46.27 
 
 		 1165 aa  382  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0428493 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4050  pyruvate carboxylase  42.42 
 
 		 1148 aa  380  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.898796  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3114  pyruvate carboxylase  47.1 
 
 		 1148 aa  383  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.558705  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1190  pyruvate carboxylase  42.42 
 
 		 1148 aa  381  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0519  pyruvate carboxylase  43.57 
 
 		 1144 aa  380  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3994  pyruvate carboxylase  42.17 
 
 		 1148 aa  378  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.882525  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3690  pyruvate carboxylase  41.99 
 
 		 1148 aa  377  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3707  pyruvate carboxylase  41.99 
 
 		 1148 aa  379  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.863258  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2718  pyruvate carboxylase subunit A  44.71 
 
 		 471 aa  379  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4065  pyruvate carboxylase  42.21 
 
 		 1148 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164116  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0622  biotin carboxylase-like  41.69 
 
 		 485 aa  377  1e-103  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3773  pyruvate carboxylase  42.42 
 
 		 1148 aa  378  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.333  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2649  pyruvate carboxylase  42.64 
 
 		 1148 aa  379  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00733169  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3962  pyruvate carboxylase  41.99 
 
 		 1148 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0696  pyruvate carboxylase  43.92 
 
 		 1137 aa  378  1e-103  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2995  pyruvate carboxylase  47.33 
 
 		 1149 aa  379  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0704  pyruvate carboxylase  42.98 
 
 		 1147 aa  374  1e-102  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3859  pyruvate carboxylase  41.99 
 
 		 1148 aa  376  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1852  pyruvate carboxylase  42.86 
 
 		 1147 aa  375  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4157  pyruvate carboxylase  41.99 
 
 		 1148 aa  376  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.820084  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1915  pyruvate carboxylase subunit A  48.34 
 
 		 472 aa  373  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1043  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  42.79 
 
 		 476 aa  375  1e-102  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5381  biotin carboxylase/biotin carboxyl carrier protein  42.18 
 
 		 579 aa  373  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00650  pyruvate carboxylase, putative  45.83 
 
 		 1103 aa  370  1e-101  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.242761  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1598  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  44.77 
 
 		 446 aa  370  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000269909  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1957  pyruvate carboxylase  46.34 
 
 		 1148 aa  370  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00721  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.54 
 
 		 449 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.249054  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1196  pyruvate carboxylase  43.05 
 
 		 1150 aa  372  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00691  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.21 
 
 		 449 aa  373  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.36167  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1174  pyruvate carboxylase  43.05 
 
 		 1150 aa  372  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.810456  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1119  pyruvate carboxylase  43.25 
 
 		 1169 aa  371  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1781  pyruvate carboxylase  42.86 
 
 		 1158 aa  367  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1716  pyruvate carboxylase  42.86 
 
 		 1158 aa  367  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1360  pyruvate carboxylase  46.14 
 
 		 1147 aa  367  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0615601 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0062  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.32 
 
 		 448 aa  369  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00681  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.8 
 
 		 448 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00711  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.32 
 
 		 449 aa  368  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1142  pyruvate carboxylase  44.9 
 
 		 1146 aa  367  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0248368  normal  0.044238 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4175  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding protein  40.34 
 
 		 584 aa  370  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1555  pyruvate carboxylase subunit A  47.81 
 
 		 471 aa  367  1e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.315854  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30519  precursor of carboxylase pyruvate carboxylase  45.09 
 
 		 1252 aa  366  1e-99  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5511  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase, putative  45.8 
 
 		 471 aa  366  2e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5061  pyruvate carboxylase subunit A  46.02 
 
 		 471 aa  365  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2549  pyruvate carboxylase  45.55 
 
 		 1149 aa  365  2e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.011252  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2259  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.04 
 
 		 448 aa  365  3e-99  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.571536  normal  0.652272 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01241  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.3 
 
 		 447 aa  364  5.0000000000000005e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.114391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1511  pyruvate carboxylase subunit A  45.12 
 
 		 472 aa  363  7.0000000000000005e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.473143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2022  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  44.1 
 
 		 446 aa  363  7.0000000000000005e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0711095  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1423  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.57 
 
 		 447 aa  363  8e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04462  pyruvate carboxylase (Eurofung)  46.26 
 
 		 1196 aa  363  9e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.736357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5640  pyruvate carboxylase subunit A  45.9 
 
 		 481 aa  363  1e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.892329  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0421  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.58 
 
 		 448 aa  362  1e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0984  biotin carboxylase / acetyl-coenzyme A carboxylase carboxyl transferase subunit alpha  43.56 
 
 		 446 aa  362  2e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000016105  normal  0.0128167 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1455  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.25 
 
 		 449 aa  362  2e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2485  pyruvate carboxylase  44.66 
 
 		 1145 aa  362  2e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1826  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  43.78 
 
 		 446 aa  361  3e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000136846  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1426  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.03 
 
 		 449 aa  361  4e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49339  precursor of carboxylase pyruvate carboxylase  44.32 
 
 		 1264 aa  361  5e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0675  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  47.62 
 
 		 452 aa  361  5e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5125  pyruvate carboxylase subunit A  45.54 
 
 		 471 aa  361  5e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.638532 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5845  biotin carboxylase  41.27 
 
 		 578 aa  361  5e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.249832  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1547  pyruvate carboxylase  47.96 
 
 		 1132 aa  361  5e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.108639 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2028  pyruvate carboxylase  45.22 
 
 		 1146 aa  360  8e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2019  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  42.98 
 
 		 446 aa  360  9.999999999999999e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>