More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3940 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1073  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  56.36 
 
 		 1097 aa  1081    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.398596 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3842  pyruvate carboxylase., propionyl-CoA carboxylase  75 
 
 		 1090 aa  1582    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.735507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2997  pyruvate carboxylase., propionyl-CoA carboxylase  60.82 
 
 		 1112 aa  1206    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.717985  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3892  pyruvate carboxylase., propionyl-CoA carboxylase  54.74 
 
 		 1105 aa  1065    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.222877  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4792  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  58.3 
 
 		 1098 aa  1145    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1636  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  59.33 
 
 		 1103 aa  1235    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0228  pyruvate carboxylase  58.48 
 
 		 1102 aa  1238    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3899  propionyl-CoA carboxylase  59.12 
 
 		 610 aa  674    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0325  putative carbamoyl-phosphate synthase/carboxyltransferase  48.72 
 
 		 1033 aa  945    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00413632  normal  0.277217 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1682  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  57.58 
 
 		 1097 aa  1080    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0602  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  59.2 
 
 		 1102 aa  1237    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4069  acetyl-CoA carboxylase (biotin carboxylase and carboxyl transferase domains) / biotin carboxyl carrier protein  54.89 
 
 		 1126 aa  1055    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0299228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4971  putative carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  54.83 
 
 		 1152 aa  1044    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.266349  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4464  pyruvate carboxylase., methylmalonyl-CoA carboxytransferase  56.36 
 
 		 1067 aa  1058    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0495259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1872  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding protein  52.09 
 
 		 1054 aa  917    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2692  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  58.97 
 
 		 1091 aa  1258    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.246578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46320  putative pyruvate carboxylase  88.23 
 
 		 1095 aa  1817    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.948302  normal  0.0234216 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2019  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  60.98 
 
 		 1103 aa  1234    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1889  propionyl-CoA carboxylase  61.35 
 
 		 519 aa  649    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2413  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  60.89 
 
 		 1103 aa  1272    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.370889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2867  pyruvate carboxylase, propionyl-CoA carboxylase  58.36 
 
 		 1094 aa  1329    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3940  biotin carboxylase  100 
 
 		 1095 aa  2159    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1862  carboxyl transferase  60 
 
 		 602 aa  632  1e-179  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00333639  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2712  carboxyl transferase  59.85 
 
 		 524 aa  578  1.0000000000000001e-163  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0757047  normal  0.0196449 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0066  propionyl-CoA carboxylase  57.47 
 
 		 519 aa  552  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2679  propionyl-CoA carboxylase  57.53 
 
 		 503 aa  546  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2724  propionyl-CoA carboxylase  57.53 
 
 		 503 aa  546  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173098 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2710  propionyl-CoA carboxylase  57.73 
 
 		 503 aa  548  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.595961  normal  0.61988 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1271  propionyl-CoA carboxylase  46.64 
 
 		 600 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0781  propionyl-CoA carboxylase  58.29 
 
 		 518 aa  534  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.576525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4207  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  42.45 
 
 		 588 aa  397  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0980  pyruvate carboxylase  43.59 
 
 		 1147 aa  388  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.125957  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1190  pyruvate carboxylase  42.42 
 
 		 1148 aa  382  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3707  pyruvate carboxylase  42.21 
 
 		 1148 aa  380  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.863258  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4050  pyruvate carboxylase  42.42 
 
 		 1148 aa  382  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.898796  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3994  pyruvate carboxylase  42.21 
 
 		 1148 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.882525  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1174  pyruvate carboxylase  43.2 
 
 		 1150 aa  379  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.810456  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3690  pyruvate carboxylase  41.99 
 
 		 1148 aa  378  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3215  pyruvate carboxylase  46.34 
 
 		 1148 aa  378  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3773  pyruvate carboxylase  42.21 
 
 		 1148 aa  378  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.333  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1196  pyruvate carboxylase  43.2 
 
 		 1150 aa  379  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4065  pyruvate carboxylase  42.21 
 
 		 1148 aa  378  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164116  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1852  pyruvate carboxylase  43.29 
 
 		 1147 aa  379  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0519  pyruvate carboxylase  42.8 
 
 		 1144 aa  377  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3962  pyruvate carboxylase  41.99 
 
 		 1148 aa  378  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2649  pyruvate carboxylase  42.21 
 
 		 1148 aa  379  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00733169  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3859  pyruvate carboxylase  41.99 
 
 		 1148 aa  376  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00650  pyruvate carboxylase, putative  45.32 
 
 		 1103 aa  375  1e-102  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.242761  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0972  pyruvate carboxylase  46.42 
 
 		 1165 aa  376  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0428493 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3114  pyruvate carboxylase  46.12 
 
 		 1148 aa  376  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.558705  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4157  pyruvate carboxylase  41.99 
 
 		 1148 aa  376  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.820084  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3015  pyruvate carboxylase  45.47 
 
 		 1148 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.240304  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00691  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.89 
 
 		 449 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.36167  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0696  pyruvate carboxylase  44.35 
 
 		 1137 aa  376  1e-102  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0704  pyruvate carboxylase  42.21 
 
 		 1147 aa  372  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2591  pyruvate carboxylase subunit A  44.62 
 
 		 471 aa  370  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2995  pyruvate carboxylase  46.14 
 
 		 1149 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00721  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.22 
 
 		 449 aa  372  1e-101  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.249054  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1915  pyruvate carboxylase subunit A  47.44 
 
 		 472 aa  369  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5381  biotin carboxylase/biotin carboxyl carrier protein  42.12 
 
 		 579 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2718  pyruvate carboxylase subunit A  44.4 
 
 		 471 aa  368  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1360  pyruvate carboxylase  46.68 
 
 		 1147 aa  368  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0615601 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2259  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.92 
 
 		 448 aa  367  1e-100  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.571536  normal  0.652272 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0062  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  43.49 
 
 		 448 aa  368  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00711  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  43.88 
 
 		 449 aa  369  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1547  pyruvate carboxylase  47.72 
 
 		 1132 aa  368  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.108639 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00681  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.7 
 
 		 448 aa  368  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10083  pyruvate carboxylase  41.91 
 
 		 1150 aa  368  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.667166  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1598  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  44.77 
 
 		 446 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000269909  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3292  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  42.56 
 
 		 577 aa  365  2e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4175  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding protein  40.55 
 
 		 584 aa  365  2e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30519  precursor of carboxylase pyruvate carboxylase  44.75 
 
 		 1252 aa  365  2e-99  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1043  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  41.32 
 
 		 476 aa  365  2e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1423  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.2 
 
 		 447 aa  365  4e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01241  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.49 
 
 		 447 aa  364  4e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.114391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0716  hypothetical protein  45.33 
 
 		 454 aa  363  7.0000000000000005e-99  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.404777 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1555  pyruvate carboxylase subunit A  47.8 
 
 		 471 aa  363  1e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.315854  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4233  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  39.84 
 
 		 594 aa  363  1e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.213527  normal  0.607428 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1455  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.47 
 
 		 449 aa  362  2e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0675  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  47.7 
 
 		 452 aa  362  2e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6500  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  40.27 
 
 		 589 aa  362  2e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.450636  normal  0.501395 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0421  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.51 
 
 		 448 aa  362  3e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0587  acetyl-CoA carboxylase subunit A  43.07 
 
 		 480 aa  362  3e-98  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000689171  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1781  pyruvate carboxylase  44.04 
 
 		 1158 aa  361  4e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2022  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  43.88 
 
 		 446 aa  361  4e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0711095  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1716  pyruvate carboxylase  44.04 
 
 		 1158 aa  361  4e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1426  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.25 
 
 		 449 aa  361  5e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1957  pyruvate carboxylase  45.36 
 
 		 1148 aa  361  5e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1840  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  43.3 
 
 		 450 aa  361  5e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1142  pyruvate carboxylase  43.33 
 
 		 1146 aa  361  5e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0248368  normal  0.044238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3538  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  40.1 
 
 		 591 aa  360  9e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1119  pyruvate carboxylase  43.71 
 
 		 1169 aa  360  9.999999999999999e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2090  pyruvate carboxylase  44.86 
 
 		 1154 aa  359  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0622  biotin carboxylase-like  40.35 
 
 		 485 aa  360  9.999999999999999e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13810  pyruvate carboxylase  48.38 
 
 		 1172 aa  360  9.999999999999999e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0765  pyruvate carboxylase  44.86 
 
 		 1154 aa  359  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.531635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5245  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  43.9 
 
 		 447 aa  359  1.9999999999999998e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2028  pyruvate carboxylase  44.54 
 
 		 1146 aa  359  1.9999999999999998e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4144  pyruvate carboxylase  45.71 
 
 		 1144 aa  359  1.9999999999999998e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49339  precursor of carboxylase pyruvate carboxylase  44.98 
 
 		 1264 aa  358  2.9999999999999997e-97  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>