More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1889 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2019  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  62.52 
 
 		 1103 aa  683    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3842  pyruvate carboxylase., propionyl-CoA carboxylase  61.73 
 
 		 1090 aa  665    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.735507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2997  pyruvate carboxylase., propionyl-CoA carboxylase  61.49 
 
 		 1112 aa  671    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.717985  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1889  propionyl-CoA carboxylase  100 
 
 		 519 aa  1068    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2692  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  63.39 
 
 		 1091 aa  701    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.246578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0228  pyruvate carboxylase  60.96 
 
 		 1102 aa  664    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0602  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  61.92 
 
 		 1102 aa  670    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1682  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  59.34 
 
 		 1097 aa  643    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4069  acetyl-CoA carboxylase (biotin carboxylase and carboxyl transferase domains) / biotin carboxyl carrier protein  59.92 
 
 		 1126 aa  640    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0299228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46320  putative pyruvate carboxylase  61.92 
 
 		 1095 aa  639    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.948302  normal  0.0234216 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1636  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  60.77 
 
 		 1103 aa  666    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2413  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  62.72 
 
 		 1103 aa  691    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.370889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3940  biotin carboxylase  61.35 
 
 		 1095 aa  635    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4792  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  59.27 
 
 		 1098 aa  629  1e-179  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3899  propionyl-CoA carboxylase  59.73 
 
 		 610 aa  627  1e-178  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4464  pyruvate carboxylase., methylmalonyl-CoA carboxytransferase  57.42 
 
 		 1067 aa  607  9.999999999999999e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0495259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3892  pyruvate carboxylase., propionyl-CoA carboxylase  58.19 
 
 		 1105 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.222877  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4971  putative carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  58.19 
 
 		 1152 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.266349  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2867  pyruvate carboxylase, propionyl-CoA carboxylase  55.58 
 
 		 1094 aa  600  1e-170  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1073  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  57.42 
 
 		 1097 aa  590  1e-167  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.398596 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1862  carboxyl transferase  58.19 
 
 		 602 aa  566  1e-160  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00333639  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0325  putative carbamoyl-phosphate synthase/carboxyltransferase  52.7 
 
 		 1033 aa  547  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00413632  normal  0.277217 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1872  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding protein  56.57 
 
 		 1054 aa  537  1e-151  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2712  carboxyl transferase  51.21 
 
 		 524 aa  507  9.999999999999999e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0757047  normal  0.0196449 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1271  propionyl-CoA carboxylase  48.22 
 
 		 600 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2679  propionyl-CoA carboxylase  49.61 
 
 		 503 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2710  propionyl-CoA carboxylase  49.8 
 
 		 503 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.595961  normal  0.61988 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2724  propionyl-CoA carboxylase  49.61 
 
 		 503 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173098 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0066  propionyl-CoA carboxylase  50.51 
 
 		 519 aa  486  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0781  propionyl-CoA carboxylase  49.71 
 
 		 518 aa  479  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.576525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1593  Propionyl-CoA carboxylase  31.75 
 
 		 525 aa  251  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1346  Propionyl-CoA carboxylase  33.27 
 
 		 508 aa  242  1e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08220  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  32.93 
 
 		 537 aa  232  1e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.394862 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1906  carboxyl transferase  33.53 
 
 		 527 aa  231  3e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.187431  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1593  carboxyl transferase  31.61 
 
 		 514 aa  228  3e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0139637  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0317  carboxyl transferase  32.51 
 
 		 514 aa  227  5.0000000000000005e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2186  Propionyl-CoA carboxylase  32.73 
 
 		 523 aa  226  6e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0379  carboxyl transferase  29.89 
 
 		 514 aa  225  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6415  Propionyl-CoA carboxylase  33.12 
 
 		 506 aa  224  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3025  carboxyl transferase  31.36 
 
 		 532 aa  222  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.432014 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1325  carboxyl transferase  29.22 
 
 		 527 aa  222  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000015031 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  29.18 
 
 		 515 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  29.43 
 
 		 515 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0335  carboxyl transferase  31.34 
 
 		 514 aa  221  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.868559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  30.57 
 
 		 530 aa  221  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  29.85 
 
 		 530 aa  221  3.9999999999999997e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  30.97 
 
 		 529 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0034  carboxyl transferase  31.61 
 
 		 516 aa  219  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182676  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3083  carboxyl transferase  31.61 
 
 		 516 aa  219  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0002503  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  29.58 
 
 		 516 aa  218  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0027  propionyl-CoA carboxylase  33.2 
 
 		 510 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  30.14 
 
 		 512 aa  217  4e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1807  propionyl-CoA carboxylase  29.47 
 
 		 513 aa  216  9e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.171719  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  30.09 
 
 		 524 aa  216  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1281  carboxyl transferase  28.46 
 
 		 527 aa  216  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0821  carboxyl transferase  29.33 
 
 		 536 aa  214  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588825  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2553  carboxyl transferase domain-containing protein  30.33 
 
 		 513 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2608  carboxyl transferase domain protein  30.33 
 
 		 513 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.444131  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2291  propionyl-CoA carboxylase  30.33 
 
 		 513 aa  212  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0918842  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2445  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  32.65 
 
 		 517 aa  212  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2565  carboxyl transferase domain protein  30.12 
 
 		 513 aa  212  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.89145e-17 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  29.59 
 
 		 516 aa  212  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1836  Propionyl-CoA carboxylase  31.96 
 
 		 520 aa  212  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.101625  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2052  Propionyl-CoA carboxylase  31.99 
 
 		 518 aa  212  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00336851  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  28.71 
 
 		 516 aa  212  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2375  carboxyl transferase domain-containing protein  30.12 
 
 		 513 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2332  propionyl-CoA carboxylase  30.12 
 
 		 513 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  29.66 
 
 		 508 aa  211  2e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2552  carboxyl transferase domain-containing protein  30.12 
 
 		 513 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.953071  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0033  propionyl-CoA carboxylase  31.96 
 
 		 510 aa  212  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3945  Propionyl-CoA carboxylase  29.49 
 
 		 519 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  30.21 
 
 		 531 aa  211  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0403  propionyl-CoA carboxylase  33.19 
 
 		 510 aa  211  4e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  29.59 
 
 		 537 aa  210  5e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  30.11 
 
 		 527 aa  210  5e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1223  carboxyl transferase  29.6 
 
 		 517 aa  210  5e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00883657  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3097  propionyl-CoA carboxylase  29.22 
 
 		 518 aa  210  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.079837 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2360  propionyl-CoA carboxylase  29.71 
 
 		 513 aa  210  6e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.306025  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1021  carboxyl transferase  28.27 
 
 		 531 aa  209  9e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  29.59 
 
 		 516 aa  209  9e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2516  carboxyl transferase domain protein  29.92 
 
 		 513 aa  209  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2807  carboxyl transferase domain protein  29.92 
 
 		 513 aa  209  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000977821 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  29.35 
 
 		 512 aa  208  2e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  30.1 
 
 		 551 aa  207  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0553  carboxyl transferase  28.85 
 
 		 518 aa  207  5e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.965666  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3166  carboxyl transferase  28.66 
 
 		 521 aa  206  6e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0567033  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0639  carboxyl transferase  28.92 
 
 		 513 aa  206  7e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.629685 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4157  carboxyl transferase  31.19 
 
 		 475 aa  206  9e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0850  carboxyl transferase  28.14 
 
 		 526 aa  206  9e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000103034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3495  carboxyl transferase  30.16 
 
 		 540 aa  205  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0272  carboxyl transferase  28.17 
 
 		 515 aa  205  1e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00889461 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2361  carboxyl transferase  27.95 
 
 		 513 aa  205  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000738755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0051  carboxyl transferase  30.33 
 
 		 517 aa  204  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.253581  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  29.73 
 
 		 527 aa  205  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  28.54 
 
 		 531 aa  204  2e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0437  carboxyl transferase  27.27 
 
 		 509 aa  204  3e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.137321  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  28.29 
 
 		 518 aa  204  4e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0008  Propionyl-CoA carboxylase  31.4 
 
 		 607 aa  203  5e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  28.43 
 
 		 516 aa  204  5e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6502  carboxyl transferase  31.34 
 
 		 529 aa  203  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838117  normal  0.279453 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>