183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1626 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1626  RimK domain-containing protein ATP-grasp  100 
 
 		 290 aa  602  1.0000000000000001e-171  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0205048 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1695  RimK domain-containing protein ATP-grasp  66.9 
 
 		 335 aa  419  1e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.803385  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1421  RimK domain-containing protein ATP-grasp  54.7 
 
 		 316 aa  361  7.0000000000000005e-99  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1433  RimK domain-containing protein ATP-grasp  54.7 
 
 		 316 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.133242 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0475  RimK domain-containing protein ATP-grasp  52.61 
 
 		 316 aa  338  7e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.60167  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1201  RimK domain-containing protein ATP-grasp  51.33 
 
 		 255 aa  265  8e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0776  RimK domain-containing protein ATP-grasp  36.86 
 
 		 486 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121233  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2232  RimK domain protein ATP-grasp  39.25 
 
 		 494 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.360505 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1892  RimK domain-containing protein ATP-grasp  35.74 
 
 		 502 aa  167  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356939 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1912  hypothetical protein  37.74 
 
 		 483 aa  165  6.9999999999999995e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0575  RimK domain protein ATP-grasp  34.18 
 
 		 490 aa  163  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103875  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5784  RimK domain protein ATP-grasp  37.45 
 
 		 486 aa  162  6e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1458  RimK domain-containing protein ATP-grasp  36.06 
 
 		 502 aa  162  7e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0341602  normal  0.0124544 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1157  glutathione synthase  33.94 
 
 		 483 aa  161  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1035  RimK domain-containing protein ATP-grasp  37.45 
 
 		 499 aa  161  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.494403  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2764  hypothetical protein  37.07 
 
 		 489 aa  160  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.338805  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0446  hypothetical protein  34.16 
 
 		 484 aa  160  3e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0422  hypothetical protein  34.16 
 
 		 484 aa  160  3e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1453  glutathione synthase/ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase)  32.87 
 
 		 490 aa  158  8e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.16454 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0957  RimK-like ATP-grasp  34.67 
 
 		 486 aa  157  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2089  RimK domain protein ATP-grasp  34.84 
 
 		 518 aa  157  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1722  glutathione synthase/ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase)  34.91 
 
 		 499 aa  156  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2466  hypothetical protein  34.84 
 
 		 518 aa  157  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4158  RimK-like ATP-grasp  36 
 
 		 488 aa  155  7e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.530195  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02216  glutathione synthase  34.38 
 
 		 495 aa  152  5e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000592479  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39390  ribosomal protein S6 modification enzyme  35.85 
 
 		 495 aa  152  8e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2526  glutathione synthase/ribosomal protein S6 modification glutaminyl transferase  35.07 
 
 		 528 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000161005  normal  0.270973 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46880  glutathione synthase  35.52 
 
 		 529 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000272025 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3347  hypothetical protein  35.85 
 
 		 495 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2956  ribosomal protein S6 modification protein-related protein  36.94 
 
 		 526 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0238931 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1291  RimK domain-containing protein ATP-grasp  36.09 
 
 		 483 aa  149  6e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.696817  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2716  RimK domain-containing protein ATP-grasp  35.84 
 
 		 526 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1841  RimK domain-containing protein ATP-grasp  32.82 
 
 		 492 aa  149  6e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0608327 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4039  hypothetical protein  35.52 
 
 		 515 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0756389  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2915  glutathione synthase  34.56 
 
 		 486 aa  147  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.525295 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2526  hypothetical protein  33.58 
 
 		 496 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2617  hypothetical protein  33.21 
 
 		 524 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2398  S6 modification enzyme RimK  25 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3664  alpha-L-glutamate ligase  25.89 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3666  alpha-L-glutamate ligase  22.95 
 
 		 301 aa  62.4  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000125802  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1361  alpha-L-glutamate ligase  24.4 
 
 		 301 aa  62.4  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.934336  hitchhiker  0.0000103664 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2310  ribosomal protein S6 modification protein  26.24 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3661  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.45 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0286  RimK domain protein ATP-grasp  22.58 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3160  ribosomal protein S6 modification protein  22.97 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00716  ribosomal protein S6 modification protein  24.08 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6289  lysine biosynthesis enzyme LysX  24.45 
 
 		 293 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1991  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  24.05 
 
 		 281 aa  57  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.317152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0604  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.91 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  22.37 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1212  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  23.97 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0387338  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1967  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  23.29 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000256532  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0769  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.21 
 
 		 471 aa  55.8  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.974202  normal  0.327706 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2391  alpha-L-glutamate ligase  23.29 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000134298  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2380  alpha-L-glutamate ligase  23.29 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000191941  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2496  alpha-L-glutamate ligase  23.29 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000126065  normal  0.0109329 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2143  alpha-L-glutamate ligase  23.29 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000119851  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0546  alpha-L-glutamate ligase  24.66 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3484  alpha-L-glutamate ligase  24.66 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06734  glutathione synthase  25.21 
 
 		 286 aa  55.5  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2061  S6 modification enzyme RimK  25.91 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000579629  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1745  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23.63 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000225359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1825  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23.63 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000123784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0545  alpha-L-glutamate ligase  24.66 
 
 		 301 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2274  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23.63 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000086692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  26.28 
 
 		 267 aa  55.1  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1808  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  23.27 
 
 		 269 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000825  ribosomal protein S6 glutaminyl transferase  24.2 
 
 		 301 aa  55.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000778733  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5981  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.35 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1704  lysine biosynthesis enzyme LysX  21.65 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3971  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2270  ribosomal protein S6 modification protein  23.63 
 
 		 299 aa  55.1  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0481  hypothetical protein  24.28 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0457  hypothetical protein  24.28 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2032  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23.76 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000147156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0619  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.45 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.875829  normal  0.913535 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2828  alpha-L-glutamate ligases, ribosomal protein S6 modification protein of RimK family protein  23.34 
 
 		 302 aa  54.3  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3327  alpha-L-glutamate ligase  26.01 
 
 		 301 aa  54.3  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0546  ribosomal protein S6 modification protein  24.22 
 
 		 301 aa  53.9  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1240  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.03 
 
 		 302 aa  53.9  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272934  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0449  S6 modification enzyme RimK  26.03 
 
 		 301 aa  54.3  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2779  alpha-L-glutamate ligase  22.26 
 
 		 302 aa  53.1  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000513891  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3945  alpha-L-glutamate ligase  26.01 
 
 		 301 aa  53.1  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3819  alpha-L-glutamate ligase  26.01 
 
 		 301 aa  53.1  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0505  alpha-L-glutamate ligase  26.01 
 
 		 301 aa  53.1  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1059  lysine biosynthesis enzyme LysX  25.12 
 
 		 282 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.411939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3763  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.01 
 
 		 301 aa  53.1  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.86581 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2418  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  23.63 
 
 		 298 aa  53.1  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3469  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.15 
 
 		 285 aa  52.8  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1288  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.14 
 
 		 285 aa  52.4  0.000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0210035 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0912  alpha-L-glutamate ligase  21.94 
 
 		 271 aa  52.4  0.000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.966867  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1549  S6 modification enzyme RimK  23.85 
 
 		 301 aa  51.6  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02450  Glutathione synthase  21.69 
 
 		 292 aa  52  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  25 
 
 		 456 aa  51.6  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1766  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.78 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.918853 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0760  ribosomal protein S6 modification protein  24.55 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00088888  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0262  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.11 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345619 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0686  SSU ribosomal protein S6P modification protein  22.74 
 
 		 301 aa  50.8  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000259145  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2353  alpha-L-glutamate ligase  25.45 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000863949  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2640  S6 modification enzyme RimK  24.18 
 
 		 301 aa  50.8  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.363149  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  24.56 
 
 		 459 aa  50.8  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>