171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1722 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1722  glutathione synthase/ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase)  100 
 
 		 499 aa  1032    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1453  glutathione synthase/ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase)  56.48 
 
 		 490 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.16454 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5784  RimK domain protein ATP-grasp  43.86 
 
 		 486 aa  428  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0446  hypothetical protein  42.68 
 
 		 484 aa  416  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0422  hypothetical protein  42.68 
 
 		 484 aa  416  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39390  ribosomal protein S6 modification enzyme  43.68 
 
 		 495 aa  405  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3347  hypothetical protein  42.35 
 
 		 495 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0575  RimK domain protein ATP-grasp  42.91 
 
 		 490 aa  395  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103875  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2956  ribosomal protein S6 modification protein-related protein  42.12 
 
 		 526 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0238931 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2617  hypothetical protein  40.79 
 
 		 524 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46880  glutathione synthase  41.47 
 
 		 529 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000272025 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2716  RimK domain-containing protein ATP-grasp  42.12 
 
 		 526 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4039  hypothetical protein  41.27 
 
 		 515 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0756389  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2526  glutathione synthase/ribosomal protein S6 modification glutaminyl transferase  41.72 
 
 		 528 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000161005  normal  0.270973 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2232  RimK domain protein ATP-grasp  41.37 
 
 		 494 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.360505 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1912  hypothetical protein  39.84 
 
 		 483 aa  375  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2526  hypothetical protein  43.55 
 
 		 496 aa  370  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2466  hypothetical protein  41.72 
 
 		 518 aa  366  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2089  RimK domain protein ATP-grasp  41.72 
 
 		 518 aa  366  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1157  glutathione synthase  39.88 
 
 		 483 aa  365  1e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1035  RimK domain-containing protein ATP-grasp  39.88 
 
 		 499 aa  357  2.9999999999999997e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.494403  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1291  RimK domain-containing protein ATP-grasp  37.1 
 
 		 483 aa  347  3e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.696817  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1892  RimK domain-containing protein ATP-grasp  39.8 
 
 		 502 aa  338  9.999999999999999e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356939 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2764  hypothetical protein  41.61 
 
 		 489 aa  335  2e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.338805  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1841  RimK domain-containing protein ATP-grasp  37.55 
 
 		 492 aa  332  1e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0608327 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1458  RimK domain-containing protein ATP-grasp  38.24 
 
 		 502 aa  329  6e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0341602  normal  0.0124544 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0957  RimK-like ATP-grasp  38.1 
 
 		 486 aa  329  9e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02216  glutathione synthase  39.01 
 
 		 495 aa  322  9.999999999999999e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000592479  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0776  RimK domain-containing protein ATP-grasp  39.6 
 
 		 486 aa  316  6e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121233  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4158  RimK-like ATP-grasp  37.12 
 
 		 488 aa  292  7e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.530195  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2915  glutathione synthase  36.68 
 
 		 486 aa  283  7.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.525295 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1695  RimK domain-containing protein ATP-grasp  36.36 
 
 		 335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.803385  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0475  RimK domain-containing protein ATP-grasp  34.24 
 
 		 316 aa  163  8.000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.60167  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1421  RimK domain-containing protein ATP-grasp  31.52 
 
 		 316 aa  161  2e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1433  RimK domain-containing protein ATP-grasp  33.85 
 
 		 316 aa  157  3e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.133242 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1626  RimK domain-containing protein ATP-grasp  34.91 
 
 		 290 aa  156  7e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0205048 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1201  RimK domain-containing protein ATP-grasp  34.58 
 
 		 255 aa  140  7.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1808  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  26.82 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2310  ribosomal protein S6 modification protein  26.51 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1361  alpha-L-glutamate ligase  24.24 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.934336  hitchhiker  0.0000103664 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1105  S6 modification enzyme RimK  27.81 
 
 		 262 aa  63.2  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.352091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2828  alpha-L-glutamate ligases, ribosomal protein S6 modification protein of RimK family protein  23.9 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1070  alpha-L-glutamate ligase  25.65 
 
 		 269 aa  60.1  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.642798  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00716  ribosomal protein S6 modification protein  24.26 
 
 		 301 aa  60.1  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0847  alpha-L-glutamate ligase  24.55 
 
 		 269 aa  59.7  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal  0.189578 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0151  alpha-L-glutamate ligase  23.45 
 
 		 293 aa  58.9  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06734  glutathione synthase  23.77 
 
 		 286 aa  58.9  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1137  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.6 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0237722  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0449  S6 modification enzyme RimK  26.09 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000825  ribosomal protein S6 glutaminyl transferase  23.77 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000778733  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  25.95 
 
 		 310 aa  56.6  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3666  alpha-L-glutamate ligase  23.97 
 
 		 301 aa  56.6  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000125802  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2418  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  26.16 
 
 		 298 aa  56.2  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05140  ribosomal protein S6 modification enzyme RimK  23.56 
 
 		 301 aa  56.6  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2369  RimK domain protein ATP-grasp  25.85 
 
 		 299 aa  56.6  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.438886 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0248  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.35 
 
 		 301 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0180089 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2289  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  23.89 
 
 		 300 aa  55.8  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0263  alpha-L-glutamate ligase  24.35 
 
 		 301 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.553998 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0262  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23.56 
 
 		 301 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345619 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3664  alpha-L-glutamate ligase  23.22 
 
 		 301 aa  54.7  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2032  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.14 
 
 		 301 aa  54.3  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000147156  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0234  ribosomal protein S6 modification protein  23.56 
 
 		 301 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0173  S6 modification enzyme RimK  23.56 
 
 		 301 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68660  ribosomal protein S6 modification protein  24.22 
 
 		 301 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5941  ribosomal protein S6 modification protein  24.22 
 
 		 301 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0363  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23.77 
 
 		 301 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2098  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23.32 
 
 		 301 aa  53.5  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.247188  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0481  hypothetical protein  21.78 
 
 		 302 aa  53.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0457  hypothetical protein  21.78 
 
 		 302 aa  53.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1549  S6 modification enzyme RimK  24.79 
 
 		 301 aa  53.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1240  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.68 
 
 		 302 aa  53.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272934  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0273  alpha-L-glutamate ligase  23.56 
 
 		 301 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0769  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.02 
 
 		 471 aa  53.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.974202  normal  0.327706 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1967  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.05 
 
 		 301 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000256532  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1745  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.36 
 
 		 299 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000225359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1825  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.36 
 
 		 299 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000123784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4964  alpha-L-glutamate ligase  23.56 
 
 		 301 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000940925 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2274  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.36 
 
 		 299 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000086692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0244  alpha-L-glutamate ligase  23.89 
 
 		 302 aa  53.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.12128  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2391  alpha-L-glutamate ligase  24.05 
 
 		 301 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000134298  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02460  ribosomal protein S6 modification protein  22.58 
 
 		 290 aa  52.8  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.76969  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2143  alpha-L-glutamate ligase  24.05 
 
 		 301 aa  53.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000119851  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0912  alpha-L-glutamate ligase  20.93 
 
 		 271 aa  52.8  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.966867  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2380  alpha-L-glutamate ligase  24.05 
 
 		 301 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000191941  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2496  alpha-L-glutamate ligase  24.05 
 
 		 301 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000126065  normal  0.0109329 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0158  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.81 
 
 		 295 aa  52  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.314526  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2270  ribosomal protein S6 modification protein  24.36 
 
 		 299 aa  52.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2640  S6 modification enzyme RimK  24.51 
 
 		 301 aa  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.363149  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05120  glutathione synthetase  24.89 
 
 		 347 aa  52.8  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.545798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3160  ribosomal protein S6 modification protein  26.17 
 
 		 301 aa  52.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0924  ribosomal protein S6 modification protein  25 
 
 		 300 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02450  Glutathione synthase  24.47 
 
 		 292 aa  52.4  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00857  ribosomal protein S6 modification protein  25 
 
 		 300 aa  52  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2790  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25 
 
 		 300 aa  52  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0955  ribosomal protein S6 modification protein  25 
 
 		 300 aa  52  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00863  hypothetical protein  25 
 
 		 300 aa  52  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1006  ribosomal protein S6 modification protein  25 
 
 		 300 aa  52  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.195269 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2039  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.31 
 
 		 299 aa  52  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.014544 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2480  ribosomal protein S6 modification protein  25 
 
 		 300 aa  51.6  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.8 
 
 		 302 aa  51.6  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>