171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_46880 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2956  ribosomal protein S6 modification protein-related protein  69.26 
 
 		 526 aa  724    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0238931 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2526  glutathione synthase/ribosomal protein S6 modification glutaminyl transferase  68.06 
 
 		 528 aa  728    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000161005  normal  0.270973 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2617  hypothetical protein  75.05 
 
 		 524 aa  780    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39390  ribosomal protein S6 modification enzyme  71.54 
 
 		 495 aa  748    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46880  glutathione synthase  100 
 
 		 529 aa  1074    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000272025 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2716  RimK domain-containing protein ATP-grasp  69.46 
 
 		 526 aa  725    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3347  hypothetical protein  71.34 
 
 		 495 aa  746    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4039  hypothetical protein  98.45 
 
 		 515 aa  1030    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0756389  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0575  RimK domain protein ATP-grasp  51.94 
 
 		 490 aa  530  1e-149  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103875  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1035  RimK domain-containing protein ATP-grasp  51.8 
 
 		 499 aa  499  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.494403  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2232  RimK domain protein ATP-grasp  53.69 
 
 		 494 aa  489  1e-137  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.360505 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2526  hypothetical protein  51.43 
 
 		 496 aa  473  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2089  RimK domain protein ATP-grasp  50.61 
 
 		 518 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2466  hypothetical protein  50.61 
 
 		 518 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1157  glutathione synthase  46.03 
 
 		 483 aa  462  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1841  RimK domain-containing protein ATP-grasp  45.6 
 
 		 492 aa  465  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0608327 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1291  RimK domain-containing protein ATP-grasp  45.73 
 
 		 483 aa  455  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.696817  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1912  hypothetical protein  45.31 
 
 		 483 aa  445  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1892  RimK domain-containing protein ATP-grasp  46.17 
 
 		 502 aa  414  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356939 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0776  RimK domain-containing protein ATP-grasp  44.44 
 
 		 486 aa  413  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121233  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2764  hypothetical protein  44.06 
 
 		 489 aa  394  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.338805  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0957  RimK-like ATP-grasp  42.42 
 
 		 486 aa  391  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1722  glutathione synthase/ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase)  41.47 
 
 		 499 aa  384  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0446  hypothetical protein  39.59 
 
 		 484 aa  378  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0422  hypothetical protein  39.59 
 
 		 484 aa  378  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1453  glutathione synthase/ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase)  42.31 
 
 		 490 aa  374  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.16454 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1458  RimK domain-containing protein ATP-grasp  42.33 
 
 		 502 aa  374  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0341602  normal  0.0124544 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5784  RimK domain protein ATP-grasp  42.31 
 
 		 486 aa  375  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4158  RimK-like ATP-grasp  40.56 
 
 		 488 aa  370  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.530195  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02216  glutathione synthase  41.65 
 
 		 495 aa  366  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000592479  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2915  glutathione synthase  41.63 
 
 		 486 aa  362  9e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.525295 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1695  RimK domain-containing protein ATP-grasp  36.64 
 
 		 335 aa  159  1e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.803385  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1433  RimK domain-containing protein ATP-grasp  32.37 
 
 		 316 aa  150  4e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.133242 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1626  RimK domain-containing protein ATP-grasp  35.52 
 
 		 290 aa  150  5e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0205048 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1421  RimK domain-containing protein ATP-grasp  31.65 
 
 		 316 aa  150  5e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0475  RimK domain-containing protein ATP-grasp  30.94 
 
 		 316 aa  145  2e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.60167  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1201  RimK domain-containing protein ATP-grasp  31.95 
 
 		 255 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0481  hypothetical protein  25.11 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0457  hypothetical protein  25.11 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1137  lysine biosynthesis enzyme LysX  25.48 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0237722  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1299  ribosomal protein S6 modification protein  24.81 
 
 		 301 aa  59.3  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.186898  normal  0.0117357 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1871  ribosomal protein S6 modification protein  26.5 
 
 		 301 aa  59.7  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2270  ribosomal protein S6 modification protein  25.48 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  29.79 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2266  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.32 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1745  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.1 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000225359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1825  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.1 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000123784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2274  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.1 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000086692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000825  ribosomal protein S6 glutaminyl transferase  24.45 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000778733  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3664  alpha-L-glutamate ligase  24.89 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00716  ribosomal protein S6 modification protein  23.14 
 
 		 301 aa  56.6  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0449  S6 modification enzyme RimK  25.78 
 
 		 301 aa  56.6  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2398  S6 modification enzyme RimK  25.64 
 
 		 307 aa  56.6  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0386  ribosomal protein S6 modification protein  23.48 
 
 		 301 aa  56.6  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.786331  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06734  glutathione synthase  25.75 
 
 		 286 aa  56.6  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1791  ribosomal protein S6 modification protein  23.48 
 
 		 301 aa  56.6  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0234  ribosomal protein S6 modification protein  25.21 
 
 		 301 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0173  S6 modification enzyme RimK  25.21 
 
 		 301 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0686  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.89 
 
 		 301 aa  55.8  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000259145  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2380  alpha-L-glutamate ligase  24.58 
 
 		 301 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000191941  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1967  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.58 
 
 		 301 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000256532  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2391  alpha-L-glutamate ligase  24.58 
 
 		 301 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000134298  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2496  alpha-L-glutamate ligase  24.58 
 
 		 301 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000126065  normal  0.0109329 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2143  alpha-L-glutamate ligase  24.58 
 
 		 301 aa  55.5  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000119851  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1549  S6 modification enzyme RimK  21.77 
 
 		 301 aa  55.1  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0262  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.64 
 
 		 301 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345619 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  22.22 
 
 		 459 aa  55.1  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3469  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.65 
 
 		 285 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2289  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  23.53 
 
 		 300 aa  55.1  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2032  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23.14 
 
 		 301 aa  54.7  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000147156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1276  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23.69 
 
 		 310 aa  54.7  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1240  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.17 
 
 		 302 aa  55.1  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272934  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05120  glutathione synthetase  24.79 
 
 		 347 aa  54.7  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.545798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0545  alpha-L-glutamate ligase  26.38 
 
 		 301 aa  54.7  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1059  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.65 
 
 		 282 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.411939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0912  alpha-L-glutamate ligase  24.66 
 
 		 271 aa  54.7  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.966867  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2418  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  25.42 
 
 		 298 aa  54.3  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0168  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  27.78 
 
 		 283 aa  54.7  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000151287  normal  0.111818 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0318  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.07 
 
 		 288 aa  54.3  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2353  alpha-L-glutamate ligase  25.21 
 
 		 301 aa  53.9  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000863949  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0363  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.6 
 
 		 301 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  22.27 
 
 		 456 aa  53.5  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0980  ribosomal protein S6 modification protein  23.36 
 
 		 300 aa  53.5  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0524519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1009  ribosomal protein S6 modification protein  23.36 
 
 		 300 aa  53.5  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0912  ribosomal protein S6 modification protein  23.36 
 
 		 300 aa  53.5  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1361  alpha-L-glutamate ligase  22.18 
 
 		 301 aa  53.5  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.934336  hitchhiker  0.0000103664 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0948  ribosomal protein S6 modification protein  23.36 
 
 		 300 aa  53.5  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2061  S6 modification enzyme RimK  23.6 
 
 		 301 aa  53.5  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000579629  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0273  alpha-L-glutamate ligase  25.64 
 
 		 301 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3327  alpha-L-glutamate ligase  24.89 
 
 		 301 aa  53.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4964  alpha-L-glutamate ligase  25.64 
 
 		 301 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000940925 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0248  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.64 
 
 		 301 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0180089 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0546  ribosomal protein S6 modification protein  25.96 
 
 		 301 aa  52.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3666  alpha-L-glutamate ligase  21.88 
 
 		 301 aa  52.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000125802  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0546  alpha-L-glutamate ligase  23.91 
 
 		 301 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3484  alpha-L-glutamate ligase  23.91 
 
 		 301 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05140  ribosomal protein S6 modification enzyme RimK  25.21 
 
 		 301 aa  52  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0263  alpha-L-glutamate ligase  25.64 
 
 		 301 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.553998 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2640  S6 modification enzyme RimK  24.51 
 
 		 301 aa  51.6  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.363149  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1212  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  24.51 
 
 		 301 aa  52  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0387338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>