More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2496 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2496  endoribonuclease, inhibits protein synthesis  100 
 
 		 135 aa  270  5.000000000000001e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.591272  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1663  endoribonuclease L-PSP  53.85 
 
 		 142 aa  144  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2487  Endoribonuclease L-PSP  43.2 
 
 		 129 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2673  Endoribonuclease L-PSP  40.34 
 
 		 134 aa  94.4  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0780712 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5596  Endoribonuclease L-PSP  34.35 
 
 		 135 aa  90.1  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.87435  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  40.31 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  39.23 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  36.72 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 135 aa  81.3  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  38.76 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  38.76 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  39.53 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  39.53 
 
 		 131 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1464  endoribonuclease L-PSP  47.73 
 
 		 93 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.643404  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  38.64 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  36.75 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4268  Endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  35.16 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  35.94 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3297  Endoribonuclease L-PSP  37.01 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.815851  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  37.4 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  37.4 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2995  endoribonuclease L-PSP  35.11 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2440  endoribonuclease L-PSP  34.35 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.863509  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4224  endoribonuclease L-PSP  42.54 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300025  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4602  endoribonuclease L-PSP  42.54 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4290  endoribonuclease L-PSP  42.54 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.905721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  39.69 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  37.69 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3267  endoribonuclease L-PSP  37.74 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.431089  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  36.64 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  32.59 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  31.06 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2738  endoribonuclease L-PSP  37.01 
 
 		 134 aa  70.1  0.000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  32.5 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3101  Endoribonuclease L-PSP  32.54 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2780  Endoribonuclease L-PSP  37.39 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6178  hypothetical protein  36.79 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71200  YjgF family translation initiation inhibitor  36.79 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6992  endoribonuclease L-PSP  34.91 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5405  endoribonuclease L-PSP  34.91 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0585911 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5674  endoribonuclease L-PSP  35.85 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171739  normal  0.201016 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6423  endoribonuclease L-PSP  34.91 
 
 		 145 aa  67  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7080  endoribonuclease L-PSP  34.91 
 
 		 145 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3031  endoribonuclease L-PSP  34.91 
 
 		 144 aa  67  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00544929  normal  0.808496 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0196  Endoribonuclease L-PSP  40.46 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2367  Endoribonuclease L-PSP  36.79 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  36.79 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2200  endoribonuclease L-PSP  36.79 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162776  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3574  endoribonuclease L-PSP  36.79 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1118  endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140871  normal  0.1168 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1188  endoribonuclease L-PSP  29.58 
 
 		 175 aa  63.9  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3465  hypothetical protein  35.85 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  34.91 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  36.75 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2099  Endoribonuclease L-PSP  27.27 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  33.96 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2347  endoribonuclease L-PSP  35.85 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977249 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3051  endoribonuclease L-PSP  34.51 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  32.81 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6043  endoribonuclease L-PSP  35.85 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0143152  hitchhiker  0.000408683 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  37.96 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1663  Endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  29.25 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7869  Endoribonuclease L-PSP  36.51 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0386  endoribonuclease L-PSP  30.89 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0244583 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  35.78 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  32.08 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  27.21 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4178  endoribonuclease L-PSP  32.58 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6797  Endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.674674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  34.48 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  29.85 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2495  Endoribonuclease L-PSP  30.65 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.628081  normal  0.767882 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  30.71 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  34.48 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  34.48 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0376  Endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0324  endoribonuclease L-PSP  30.08 
 
 		 132 aa  57  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2416  putative endoribonuclease L-PSP  34.23 
 
 		 130 aa  57  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.769165 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4515  endoribonuclease L-PSP  30.84 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  30.37 
 
 		 134 aa  57  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4534  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.71514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4700  endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1769  Endoribonuclease L-PSP  29.85 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.261309 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1330  endoribonuclease L-PSP  30.37 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.805737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5064  Endoribonuclease L-PSP  30.95 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.798098  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  31.93 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3898  putative endoribonuclease L-PSP  36.19 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3522  endoribonuclease L-PSP  29.69 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0348507  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34570  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  28.68 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00491284  normal  0.846357 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2914  Endoribonuclease L-PSP  25.6 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000821115  hitchhiker  0.0000516213 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3227  endoribonuclease L-PSP  29.73 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0453  endoribonuclease L-PSP  25.81 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1773  Endoribonuclease L-PSP  33.02 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00826992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2305  endoribonuclease L-PSP  27.82 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>