92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1699 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1699  sterol desaturase family protein  100 
 
 
196 aa  399  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.844125  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5014  sterol desaturase-like protein  38.78 
 
 
230 aa  149  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1488  fatty acid hydroxylase  40.46 
 
 
231 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.568753 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1382  fatty acid hydroxylase  47.34 
 
 
227 aa  129  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0236  C-5 sterol desaturase  26.32 
 
 
236 aa  65.9  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.652571  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3136  sterol desaturase  24.49 
 
 
253 aa  60.8  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2514  fatty acid hydroxylase  25 
 
 
267 aa  60.5  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.842442  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2347  fatty acid hydroxylase  25.14 
 
 
262 aa  58.2  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06161  C-5 sterol desaturase  28.66 
 
 
271 aa  57  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  30.82 
 
 
314 aa  56.6  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  22.17 
 
 
281 aa  56.2  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  25.17 
 
 
273 aa  56.2  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  27.39 
 
 
285 aa  55.8  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3108  fatty acid hydroxylase  27.74 
 
 
315 aa  55.1  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  26.24 
 
 
283 aa  55.1  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_18900  predicted protein  25.32 
 
 
283 aa  55.1  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3525  fatty acid hydroxylase  27.52 
 
 
288 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000324815 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1692  fatty acid hydroxylase  22.46 
 
 
248 aa  53.9  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0825  sterol desaturase family protein  27.39 
 
 
287 aa  53.5  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2887  sterol desaturase family protein  28.19 
 
 
304 aa  53.9  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3594  sterol desaturase family protein  27.52 
 
 
288 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  25.31 
 
 
295 aa  53.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3717  sterol desaturase family protein  26.85 
 
 
288 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0789  sterol desaturase family protein  28.57 
 
 
287 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0717  sterol desaturase family protein  26.85 
 
 
288 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390125  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3005  fatty acid hydroxylase  24.86 
 
 
269 aa  52.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10852  predicted protein  27.74 
 
 
167 aa  52.4  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3149  sterol desaturase family protein  27.21 
 
 
287 aa  52.4  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0818  sterol desaturase family protein  27.21 
 
 
287 aa  52.4  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78360  predicted protein  29.8 
 
 
305 aa  52.4  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2296  fatty acid hydroxylase  25.93 
 
 
292 aa  51.2  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0175363 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3807  sterol desaturase family protein  28.08 
 
 
287 aa  51.2  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  25.71 
 
 
270 aa  51.2  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37371  predicted protein  29.52 
 
 
288 aa  50.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  26.06 
 
 
278 aa  50.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  22.68 
 
 
270 aa  50.1  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  27.14 
 
 
330 aa  50.4  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  27.14 
 
 
330 aa  50.4  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3109  sterol desaturase family protein  26.75 
 
 
292 aa  48.5  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2320  fatty acid hydroxylase  25.18 
 
 
276 aa  48.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  28.08 
 
 
303 aa  48.1  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  27.21 
 
 
304 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2023  sterol desaturase-like protein  27.27 
 
 
322 aa  47.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  23.94 
 
 
270 aa  47.4  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  26.25 
 
 
279 aa  47  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2649  fatty acid hydroxylase  27.89 
 
 
304 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2009  sterol desaturase-like  27.89 
 
 
304 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2620  sterol desaturase-like protein  27.89 
 
 
304 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1130  fatty acid hydroxylase  28.66 
 
 
301 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2667  sterol desaturase-like protein  27.59 
 
 
304 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03346  sterol desaturase protein  29.09 
 
 
270 aa  46.2  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0689  sterol desaturase-like protein  42.55 
 
 
284 aa  45.8  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0680  C-5 sterol desaturase  24.29 
 
 
271 aa  45.8  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  24.82 
 
 
256 aa  45.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  27.08 
 
 
305 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  27.08 
 
 
305 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  27.08 
 
 
305 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2540  fatty acid hydroxylase  26.53 
 
 
304 aa  45.4  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  27.21 
 
 
304 aa  45.1  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  26.49 
 
 
321 aa  45.1  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  24.82 
 
 
256 aa  44.3  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1362  fatty acid hydroxylase  26.95 
 
 
257 aa  44.7  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000314622  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1221  fatty acid hydroxylase  28.39 
 
 
301 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.387146  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  23.57 
 
 
304 aa  43.9  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  25.87 
 
 
264 aa  44.3  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1001  sterol desaturase-related protein  26.92 
 
 
282 aa  43.9  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02830  conserved hypothetical protein  26.35 
 
 
348 aa  44.3  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.11787  normal  0.073643 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3618  hypothetical protein  28.41 
 
 
274 aa  43.5  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246292  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  25.17 
 
 
320 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  25.6 
 
 
386 aa  43.5  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2550  sterol desaturase family protein  26.53 
 
 
287 aa  43.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0600  sterol desaturase family protein  26.76 
 
 
218 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4807  fatty acid hydroxylase  27.21 
 
 
249 aa  43.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  24 
 
 
272 aa  43.9  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2434  hypothetical protein  26.76 
 
 
218 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  25.52 
 
 
281 aa  42.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0287  sterol desaturase-like protein  26.67 
 
 
287 aa  43.1  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.897379 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  26.8 
 
 
321 aa  42.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  24.48 
 
 
264 aa  42.7  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2304  fatty acid hydroxylase  28.87 
 
 
298 aa  42  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  24.52 
 
 
274 aa  42  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7771  fatty acid hydroxylase  25.17 
 
 
284 aa  42  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.186795  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2318  hypothetical protein  25 
 
 
284 aa  42.4  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3261  hypothetical protein  26.42 
 
 
264 aa  42  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0633506  hitchhiker  0.0000000000915879 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  23.64 
 
 
291 aa  41.6  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  26.35 
 
 
268 aa  41.6  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6776  fatty acid hydroxylase  33.59 
 
 
334 aa  41.6  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.159357 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  22.88 
 
 
267 aa  41.6  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  26.71 
 
 
380 aa  41.2  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0146  fatty acid hydroxylase  22.64 
 
 
257 aa  41.2  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113209 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0212  hypothetical protein  27.03 
 
 
269 aa  41.2  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2637  fatty acid hydroxylase  26.16 
 
 
328 aa  41.2  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>