More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0774 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0774  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 		 344 aa  711    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.352991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3425  uroporphyrinogen decarboxylase  65.1 
 
 		 342 aa  471  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6506  uroporphyrinogen decarboxylase  64.12 
 
 		 339 aa  461  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  51.44 
 
 		 351 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.551213 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1187  uroporphyrinogen decarboxylase  50.73 
 
 		 353 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0251  uroporphyrinogen decarboxylase  51.16 
 
 		 351 aa  348  5e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.821676  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6502  uroporphyrinogen decarboxylase  50.59 
 
 		 341 aa  348  7e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.607973 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0174  uroporphyrinogen decarboxylase  50.57 
 
 		 351 aa  345  5e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2341  uroporphyrinogen decarboxylase  51.45 
 
 		 351 aa  344  1e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0130  uroporphyrinogen decarboxylase  48.28 
 
 		 351 aa  337  9.999999999999999e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339923  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2714  uroporphyrinogen decarboxylase  49.13 
 
 		 351 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0101  uroporphyrinogen decarboxylase  48.82 
 
 		 341 aa  336  2.9999999999999997e-91  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1992  uroporphyrinogen decarboxylase  49.71 
 
 		 351 aa  334  1e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03630  uroporphyrinogen decarboxylase  46.49 
 
 		 343 aa  325  6e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0946  uroporphyrinogen decarboxylase  47.79 
 
 		 341 aa  325  9e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  46.82 
 
 		 354 aa  321  9.999999999999999e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  46.53 
 
 		 364 aa  319  3.9999999999999996e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3020  uroporphyrinogen decarboxylase  45.27 
 
 		 351 aa  319  3.9999999999999996e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  44.99 
 
 		 354 aa  318  6e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5118  uroporphyrinogen decarboxylase  45.82 
 
 		 354 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0414  uroporphyrinogen decarboxylase  45.53 
 
 		 354 aa  316  4e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3008  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  44.83 
 
 		 357 aa  315  6e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2851  uroporphyrinogen decarboxylase  44.38 
 
 		 355 aa  309  5e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180798  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5771  uroporphyrinogen decarboxylase  45.4 
 
 		 355 aa  308  8e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66550  uroporphyrinogen decarboxylase  45.4 
 
 		 355 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45190  uroporphyrinogen decarboxylase  45.98 
 
 		 355 aa  307  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1818  uroporphyrinogen decarboxylase  46.15 
 
 		 402 aa  307  2.0000000000000002e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0377  uroporphyrinogen decarboxylase  46.15 
 
 		 361 aa  307  2.0000000000000002e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00215009  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2779  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  45.19 
 
 		 356 aa  305  8.000000000000001e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.313146 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0552  uroporphyrinogen decarboxylase  46.09 
 
 		 355 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147846 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0392  uroporphyrinogen decarboxylase  44.09 
 
 		 354 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4947  uroporphyrinogen decarboxylase  44.09 
 
 		 354 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.136579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  43.55 
 
 		 354 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.104978 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  44.38 
 
 		 355 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5074  uroporphyrinogen decarboxylase  44.09 
 
 		 354 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0448  uroporphyrinogen decarboxylase  43.52 
 
 		 355 aa  302  6.000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  43.9 
 
 		 352 aa  302  6.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  44.61 
 
 		 354 aa  302  6.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844287  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5124  uroporphyrinogen decarboxylase  44.09 
 
 		 354 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0440  uroporphyrinogen decarboxylase  42.98 
 
 		 354 aa  301  8.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115919 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0468  uroporphyrinogen decarboxylase  43.35 
 
 		 354 aa  301  1e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.551624  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  44.09 
 
 		 354 aa  301  2e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00219  uroporphyrinogen decarboxylase  44.09 
 
 		 355 aa  300  2e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2765  uroporphyrinogen decarboxylase  45.93 
 
 		 365 aa  300  2e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3222  uroporphyrinogen decarboxylase  43.1 
 
 		 354 aa  300  2e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.234724 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0415  uroporphyrinogen decarboxylase  44.54 
 
 		 355 aa  300  3e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2734  uroporphyrinogen decarboxylase  42.94 
 
 		 359 aa  299  5e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961609  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0025  uroporphyrinogen decarboxylase  46.29 
 
 		 356 aa  298  9e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002177  uroporphyrinogen III decarboxylase  43.8 
 
 		 355 aa  298  1e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0728  uroporphyrinogen decarboxylase  46.51 
 
 		 354 aa  297  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0876  uroporphyrinogen decarboxylase  46.51 
 
 		 354 aa  297  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46716  uroporphyrinogen decarboxylase  44.92 
 
 		 362 aa  296  3e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00457298 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0427  uroporphyrinogen decarboxylase  42.49 
 
 		 354 aa  296  4e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0482  uroporphyrinogen decarboxylase  42.41 
 
 		 354 aa  296  4e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  45.03 
 
 		 340 aa  295  5e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3422  uroporphyrinogen decarboxylase  42.69 
 
 		 354 aa  295  9e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3134  uroporphyrinogen decarboxylase  42.74 
 
 		 370 aa  295  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3861  uroporphyrinogen decarboxylase  42.46 
 
 		 370 aa  293  3e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00641  uroporphyrinogen decarboxylase  43.31 
 
 		 380 aa  292  5e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0387  uroporphyrinogen decarboxylase  43.19 
 
 		 354 aa  292  5e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3039  uroporphyrinogen decarboxylase  45.24 
 
 		 360 aa  291  8e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0332  uroporphyrinogen decarboxylase  44.38 
 
 		 350 aa  291  9e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0475139  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02733  uroporphyrinogen decarboxylase (AFU_orthologue; AFUA_1G05060)  45.2 
 
 		 363 aa  291  1e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1540  uroporphyrinogen decarboxylase  42.2 
 
 		 354 aa  290  2e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0588582  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0032  uroporphyrinogen decarboxylase  42.4 
 
 		 355 aa  290  3e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.590696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1934  uroporphyrinogen decarboxylase  42.44 
 
 		 365 aa  290  3e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4080  uroporphyrinogen decarboxylase  42.27 
 
 		 356 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1118  uroporphyrinogen decarboxylase  43.55 
 
 		 366 aa  288  7e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1599  uroporphyrinogen decarboxylase  43.97 
 
 		 368 aa  288  1e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00586302  hitchhiker  0.0000224711 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3846  uroporphyrinogen decarboxylase  42.86 
 
 		 354 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000118509 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3245  uroporphyrinogen decarboxylase  44.84 
 
 		 340 aa  287  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3406  uroporphyrinogen decarboxylase  42.86 
 
 		 354 aa  287  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0413  uroporphyrinogen decarboxylase  42.86 
 
 		 354 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4042  uroporphyrinogen decarboxylase  42.86 
 
 		 354 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.984022 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0821  uroporphyrinogen decarboxylase  42.37 
 
 		 369 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00198157  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0439  uroporphyrinogen decarboxylase  42.57 
 
 		 354 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3590  uroporphyrinogen decarboxylase  42.57 
 
 		 354 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0435  uroporphyrinogen decarboxylase  42.57 
 
 		 354 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3453  uroporphyrinogen decarboxylase  43.57 
 
 		 340 aa  286  4e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575742  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0435  uroporphyrinogen decarboxylase  42.57 
 
 		 354 aa  286  4e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2010  uroporphyrinogen decarboxylase  42.23 
 
 		 352 aa  286  4e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3849  uroporphyrinogen decarboxylase  42.86 
 
 		 355 aa  285  7e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0351  uroporphyrinogen decarboxylase  42.86 
 
 		 355 aa  285  9e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.777116  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0459  uroporphyrinogen decarboxylase  42.86 
 
 		 355 aa  285  9e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000960348 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3920  uroporphyrinogen decarboxylase  42.57 
 
 		 354 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0116  uroporphyrinogen decarboxylase  42.65 
 
 		 353 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.754255  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0210  uroporphyrinogen decarboxylase  42.57 
 
 		 354 aa  285  1.0000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0124917 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1268  uroporphyrinogen decarboxylase  43.49 
 
 		 340 aa  284  1.0000000000000001e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4411  uroporphyrinogen decarboxylase  41.26 
 
 		 354 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.356712  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5896  uroporphyrinogen decarboxylase  45.91 
 
 		 354 aa  283  2.0000000000000002e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03874  uroporphyrinogen decarboxylase  41.33 
 
 		 354 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3997  uroporphyrinogen decarboxylase  41.33 
 
 		 354 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03827  hypothetical protein  41.33 
 
 		 354 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0219  uroporphyrinogen decarboxylase  42.15 
 
 		 354 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4028  uroporphyrinogen decarboxylase  41.33 
 
 		 354 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901601 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2005  uroporphyrinogen decarboxylase  41.94 
 
 		 353 aa  283  4.0000000000000003e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4445  uroporphyrinogen decarboxylase  41.33 
 
 		 354 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000531857 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4540  uroporphyrinogen decarboxylase  41.33 
 
 		 354 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4488  uroporphyrinogen decarboxylase  41.33 
 
 		 354 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.830156  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4469  uroporphyrinogen decarboxylase  41.85 
 
 		 379 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.450699  normal  0.0158572 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>