216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01970 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_01970  outer membrane efflux protein, putative  100 
 
 		 456 aa  916    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1475  outer membrane efflux protein  28.08 
 
 		 449 aa  201  3e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.236212  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3429  outer membrane efflux protein  26.74 
 
 		 442 aa  173  5e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.437271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1143  outer membrane efflux protein  26.88 
 
 		 455 aa  171  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.128527 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3719  outer membrane efflux protein  26.24 
 
 		 444 aa  160  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.633766  normal  0.0948534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5506  outer membrane efflux protein  24.6 
 
 		 451 aa  153  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  28.54 
 
 		 462 aa  152  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4492  outer membrane efflux protein  27.62 
 
 		 455 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.685781 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2515  outer membrane protein  26.39 
 
 		 463 aa  142  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  25.71 
 
 		 467 aa  139  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4162  outer membrane efflux protein  24.7 
 
 		 443 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000533026  normal  0.288124 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  25.12 
 
 		 463 aa  133  7.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0610  outer membrane efflux protein  23.71 
 
 		 453 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  25.88 
 
 		 496 aa  131  3e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2647  outer membrane efflux protein  23.08 
 
 		 445 aa  124  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.910769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2560  outer membrane efflux protein  25.17 
 
 		 438 aa  119  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  23.39 
 
 		 463 aa  117  5e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1266  outer membrane efflux protein  22.77 
 
 		 444 aa  115  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  24.6 
 
 		 483 aa  114  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2807  outer membrane efflux protein/ immunoreative antigen  24.42 
 
 		 441 aa  111  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  24.95 
 
 		 535 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  22.9 
 
 		 443 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2819  outer membrane efflux protein  23.06 
 
 		 438 aa  107  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  25.68 
 
 		 470 aa  106  8e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3706  outer membrane efflux protein  24.46 
 
 		 447 aa  104  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2362  outer membrane efflux protein  21.65 
 
 		 446 aa  99.8  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.451057 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2173  outer membrane efflux protein  23.38 
 
 		 448 aa  90.9  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01115  putative outer membrane transport/efflux protein  25.05 
 
 		 443 aa  89.4  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1841  Outer membrane protein-like protein  22.75 
 
 		 438 aa  85.9  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1000  outer membrane efflux protein  26.69 
 
 		 448 aa  85.9  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495217  normal  0.0302884 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0042  outer membrane efflux protein  23.89 
 
 		 454 aa  85.5  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2662  outer membrane efflux protein  20.7 
 
 		 445 aa  80.9  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4543  outer membrane efflux protein  23.83 
 
 		 430 aa  77  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.781416  normal  0.876595 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1135  outer membrane protein TolC, putative  22.1 
 
 		 480 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.196284  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0538  outer membrane efflux protein  22.14 
 
 		 462 aa  75.5  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1822  putative outer membrane protein TolC  22.15 
 
 		 476 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0370  putative outer membrane protein TolC  22.35 
 
 		 446 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00192444  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1738  putative outer membrane protein TolC  22.25 
 
 		 521 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1327  putative outer membrane protein TolC  22.35 
 
 		 446 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.345184  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0997  putative outer membrane protein TolC  22.25 
 
 		 476 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.471122  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0296  outer membrane protein TolC, putative  22.25 
 
 		 476 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618695  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0269  putative outer membrane protein TolC  22.25 
 
 		 476 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0165015  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1671  outer membrane efflux protein  24.46 
 
 		 461 aa  71.2  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3730  outer membrane efflux protein  26.44 
 
 		 477 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1841  outer membrane efflux protein  20.54 
 
 		 471 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5578  outer membrane efflux protein  22.31 
 
 		 451 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.46516 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4182  outer membrane efflux protein  21.83 
 
 		 471 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4184  outer membrane efflux protein  21.83 
 
 		 471 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.236948 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0063  outer membrane efflux protein  21.74 
 
 		 408 aa  65.1  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0180654  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  22.79 
 
 		 448 aa  64.7  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3983  outer membrane efflux protein  28.32 
 
 		 455 aa  64.3  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.462123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0814  outer membrane efflux protein  28.23 
 
 		 455 aa  63.5  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.881482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  21.92 
 
 		 419 aa  62.4  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  22.9 
 
 		 441 aa  62  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3333  outer membrane efflux protein  21.8 
 
 		 438 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0566  outer membrane efflux protein  26.35 
 
 		 473 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.151183 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  24.31 
 
 		 442 aa  61.6  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1131  outer membrane efflux protein  21.72 
 
 		 364 aa  61.2  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1450  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23 
 
 		 471 aa  60.1  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  22.17 
 
 		 471 aa  60.1  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  22.56 
 
 		 443 aa  59.7  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 438 aa  58.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  25.25 
 
 		 433 aa  58.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1353  outer membrane efflux protein  23.81 
 
 		 451 aa  58.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.678572  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0582  outer membrane efflux protein  29.44 
 
 		 464 aa  57.8  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4090  outer membrane efflux protein  29.52 
 
 		 473 aa  57.4  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4260  outer membrane efflux protein  21.27 
 
 		 438 aa  57.4  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1664  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.46 
 
 		 453 aa  57.4  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1174  outer membrane efflux protein  26.12 
 
 		 457 aa  57.4  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.89041 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5198  outer efflux pump domain-containing protein  22.4 
 
 		 522 aa  57.4  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0545953 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  21.51 
 
 		 417 aa  57  0.0000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3464  outer membrane efflux protein  32.85 
 
 		 489 aa  56.6  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0487  outer membrane efflux protein  32.85 
 
 		 489 aa  56.6  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3640  outer membrane efflux protein  32.85 
 
 		 489 aa  56.6  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0477  outer membrane efflux protein  24.57 
 
 		 517 aa  56.2  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3814  outer membrane efflux protein  29.81 
 
 		 493 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000440013  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  23.61 
 
 		 449 aa  55.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0526  outer membrane efflux protein  29.81 
 
 		 489 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00662182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4394  outer membrane efflux protein  28.31 
 
 		 465 aa  55.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000587559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  21.79 
 
 		 441 aa  55.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0530  outer membrane efflux protein  29.81 
 
 		 473 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  21.14 
 
 		 420 aa  55.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3298  outer membrane efflux protein  21.89 
 
 		 418 aa  55.1  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000531453  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1024  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.82 
 
 		 484 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.130102 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0505  outer membrane efflux protein  29.81 
 
 		 489 aa  55.1  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  21.22 
 
 		 470 aa  54.3  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  22.83 
 
 		 462 aa  53.9  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  24.85 
 
 		 627 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  20.86 
 
 		 458 aa  53.9  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1126  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.76 
 
 		 450 aa  53.5  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0366  outer membrane efflux protein  21.99 
 
 		 437 aa  53.1  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0094  outer membrane efflux protein, putative  21.99 
 
 		 501 aa  52.8  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0379352 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2864  outer membrane efflux protein  24.85 
 
 		 476 aa  53.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1278  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.49 
 
 		 486 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00202436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3265  outer membrane efflux protein  24.85 
 
 		 476 aa  53.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  23.76 
 
 		 576 aa  52.8  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1919  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  21.39 
 
 		 482 aa  52.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.328582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1021  outer membrane efflux protein  22.43 
 
 		 528 aa  52.4  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3096  outer membrane efflux protein  25.35 
 
 		 497 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3490  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.22 
 
 		 503 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.350691 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>