More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2649 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1762  putative type IV secretion system protein VirB11  86.02 
 
 		 372 aa  639    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2649  putative type IV secretion system protein VirB11  100 
 
 		 372 aa  758    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.788763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6497  P-type DNA transfer ATPase VirB11  82.75 
 
 		 372 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0170  P-type DNA transfer ATPase VirB11  77.72 
 
 		 375 aa  548  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.178356 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0456  putative type IV secretion system protein VirB11  76.32 
 
 		 379 aa  533  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4194  P-type DNA transfer ATPase VirB11  68.26 
 
 		 383 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.877168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4845  type II secretion system protein E  69.68 
 
 		 352 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3321  ATP/GTP-binding motif-containing protein  69.68 
 
 		 352 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1678  type IV secretory pathway, VirB11 component  40.29 
 
 		 361 aa  249  5e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4369  type II secretion system protein E  41 
 
 		 342 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.957498 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5078  P-type DNA transfer ATPase VirB11  41.3 
 
 		 337 aa  246  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.382056 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5001  P-type DNA transfer ATPase VirB11  40.58 
 
 		 334 aa  246  4e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.547731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0863  P-type DNA transfer ATPase VirB11  40.75 
 
 		 368 aa  245  9e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.349465 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0248  Type IV secretory pathway AvhB11 protein  41.42 
 
 		 343 aa  245  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.776231 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4338  type II secretion system protein E  40.71 
 
 		 344 aa  241  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553621  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0059  type IV secretion system protein VirB11  40 
 
 		 361 aa  239  6.999999999999999e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2445  P-type DNA transfer ATPase VirB11  39.1 
 
 		 347 aa  238  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.938664 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0685  P-type DNA transfer ATPase VirB11  39.32 
 
 		 333 aa  238  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0054  P-type DNA transfer ATPase VirB11  39.72 
 
 		 362 aa  237  2e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5822  P-type DNA transfer ATPase VirB11  39.78 
 
 		 382 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0740  type IV secretion system ATPase VirB11  38.41 
 
 		 331 aa  223  4.9999999999999996e-57  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.252836  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a019  conjugal transfer protein VirB11  34.72 
 
 		 333 aa  219  6e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0039  cmgB11  37.94 
 
 		 330 aa  219  6e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0007  type IV secretion system ATPase VirB11  39.1 
 
 		 330 aa  217  2e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0478715  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0019  type IV secretion system ATPase VirB11  37.72 
 
 		 332 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0988827  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6333  P-type DNA transfer ATPase VirB11  38.95 
 
 		 357 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1145  P-type DNA transfer ATPase VirB11  35.64 
 
 		 355 aa  206  5e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0046  P-type DNA transfer ATPase VirB11  37.22 
 
 		 342 aa  204  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0041  type IV secretion system ATPase VirB11  37.72 
 
 		 332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4170  type II secretion system protein E  34.93 
 
 		 343 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08204  type II secretion system protein E  35.14 
 
 		 338 aa  196  7e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.291523  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9811  type IV secretion protein AvhB11  34.42 
 
 		 340 aa  192  6e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5020  type II secretion system protein E  34.46 
 
 		 347 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0172  P-type DNA transfer ATPase VirB11  34.21 
 
 		 328 aa  190  4e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0899621  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3530  type IV secretion system protein VirB11  36.39 
 
 		 355 aa  190  4e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6397  P-type DNA transfer ATPase VirB11  35.01 
 
 		 342 aa  189  7e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6152  type IV secretion system protein VirB11  35.26 
 
 		 346 aa  188  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4555  P-type DNA transfer ATPase VirB11  34.12 
 
 		 343 aa  187  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.303267  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0016  P-type DNA transfer ATPase VirB11  35.71 
 
 		 339 aa  186  5e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0161  hypothetical protein  33.04 
 
 		 334 aa  185  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4437  type II secretion system protein E  39.3 
 
 		 349 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7526  P-type DNA transfer ATPase VirB11  34.24 
 
 		 345 aa  182  7e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0812069 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8218  type IV secretion system protein VirB11  35.03 
 
 		 344 aa  182  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.662964  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0179  hypothetical protein  31.85 
 
 		 334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1479  Sigma 54 interacting domain protein  35.1 
 
 		 338 aa  177  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0024  P-type DNA transfer ATPase VirB11  33.93 
 
 		 353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6214  P-type DNA transfer ATPase VirB11  34.99 
 
 		 349 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.263277 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0116  P-type DNA transfer ATPase VirB11  34.11 
 
 		 349 aa  169  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.165684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7353  type II secretion system protein E  31.03 
 
 		 391 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0424132  normal  0.297904 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1525  type II secretion system protein E  31.89 
 
 		 349 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  28.66 
 
 		 412 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5190  type II secretion system protein E  31.89 
 
 		 349 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0537  type II secretion system protein E  31.67 
 
 		 440 aa  133  6e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  31.65 
 
 		 472 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  31.65 
 
 		 472 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  30.58 
 
 		 449 aa  131  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  31.65 
 
 		 521 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  31.65 
 
 		 520 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  31.65 
 
 		 520 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  31.65 
 
 		 523 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  31.65 
 
 		 520 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  31.65 
 
 		 523 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  31.65 
 
 		 515 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  31.29 
 
 		 474 aa  129  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  31.54 
 
 		 442 aa  127  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  31.56 
 
 		 478 aa  127  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0503  type II secretion system protein E  30 
 
 		 411 aa  123  5e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  30.19 
 
 		 521 aa  122  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  30.47 
 
 		 444 aa  122  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0032  type II secretion system protein E  30.35 
 
 		 404 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  28.29 
 
 		 589 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  29.43 
 
 		 487 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  29.79 
 
 		 463 aa  120  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  27.33 
 
 		 572 aa  120  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  27.48 
 
 		 472 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  26.49 
 
 		 569 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1622  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  28.44 
 
 		 346 aa  119  6e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  30.58 
 
 		 423 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  28.34 
 
 		 432 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  28.99 
 
 		 408 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  28.06 
 
 		 458 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1034  type II secretion system protein E  31.8 
 
 		 450 aa  117  3e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  28.67 
 
 		 462 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  29.39 
 
 		 423 aa  116  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  28.93 
 
 		 454 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  29.62 
 
 		 472 aa  115  8.999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  30.36 
 
 		 454 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  27.24 
 
 		 468 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  30.28 
 
 		 474 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  28.21 
 
 		 479 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  28.06 
 
 		 482 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1756  type II secretion system protein E  27.6 
 
 		 430 aa  114  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154  normal  0.161423 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  26.2 
 
 		 455 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  27.82 
 
 		 428 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  28.77 
 
 		 428 aa  114  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  28.68 
 
 		 498 aa  114  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  27.82 
 
 		 428 aa  114  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  27.82 
 
 		 428 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  28.01 
 
 		 460 aa  113  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1835  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  30.91 
 
 		 325 aa  113  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>